来源丰富，燃料储存和供应系统简单，可采用类似加油站的系统
甲醇渗透（浓差扩散和电迁移），与氧的电化学还原构成短路电池，在阴极产生混合电位，降低DMFC的开路电压，而且增加氧阴极极化和降低电池的电流效率。
甲醇水溶液作燃料，DMFC质子交换膜阳极侧会始终保持在良好的水饱和状态下，水均由阳极迁移至阴极。阴极侧排水负荷增大，阴极被水淹的情况更严重，阴极水管理难度增加。
阴极氧化剂(如空气中氧)的利用率均很低，其目的是增加阴极流场内氧化剂的流动线速度，以利于向催化层的传质和水的排出，但这势必增加DMFC电池系统的内耗
阳极氧化时，产生H+与电子和气体，所有要求电极具有憎水孔。电极构成材料(Pt/C电催化剂）极易在析出的反应气作用下导致脱落、损失。
DMFC工艺，增加MEA的电极与膜之间的结合力，防止MEA在电池长时间工作时膜与电极分离、增加欧姆极化，大幅度降低电池性能，严重时导致电池失效。
