肽聚糖为一类复杂的多聚体,是细菌细胞壁主要组分,为原核细胞所特有,又称黏肽或胞壁质。G+菌的肽聚糖由聚糖骨架、四肽侧链和五肽交联桥三部分组成,三维立体结构,坚固。G-菌的肽聚糖仅由聚糖骨架和四肽侧链两部分组成。聚糖骨架由N-乙酰葡糖胺和N-乙酰胞壁酸交替间隔排列,经β-1,4糖苷键联结而成。各种细菌细胞壁的聚糖骨架均相同。四肽侧链的组成和联结方式随细菌种类不同而异。如葡萄球菌(G+)菌细胞壁的四肽侧链的氨基酸依次为L-丙氨酸、D-谷氨酸、L-赖氨酸和D-丙氨酸;第三位的L-赖氨酸通过由五个甘氨酸组成的交联桥联接到相邻聚糖骨架四肽侧链末端的D-丙氨酸上,从而构成机械强度十分坚韧的三位立体结构。在大肠埃希菌(G-)的四肽侧链中,第三位氨基酸是二氨基庚二酸(DAP),并由DAP与相邻四肽侧链末端的D-丙氨酸直接连接,没有五肽交联桥,因而只形成单层平面网络的二维结构。