1、在乳制品生产中的应用奶酪生产（加入凝乳酶和氯化钙，酪蛋白凝固经切块、压制成型及加盐后，进行发酵成熟，最终形成奶酪特有的风味）
2、在调味料中生产中的使用（利用复合蛋白酶将蛋白质分解，增加底物，依靠美拉德反应生成风味调味料）
3、在焙烤制品中的应用(利用中性蛋白酶，水解面筋蛋白，软化面团，改善面团的粘弹性和延伸性，从而改善烘焙品质)
4、在肉制品加工中的应用(木瓜蛋白酶、无花果蛋白酶，属半胱氨酸蛋白酶能作用于蛋白质中的赖氨酸，从而将结缔组织中蛋白质水解，肉嫩化）
5、在茶饮料中的应用（添加蛋白酶，将茶叶中的不溶性蛋白质水解为可溶性的蛋白质及氨基酸，增加滋味，提高浸出率）
6、在豆制品生产中的应用（利用大豆内肽酶水解大豆蛋白，使生产的豆奶粉，冲调时无沉淀、无颗粒感，口感细腻浓厚）
7、在酿造工业中的应用（在酒精发酵中，利用蛋白酶分解谷物中的蛋白质增加酵母营养，促进酵母生长，缩短发酵期）
8、在活性肽生产中的应用（通过控制蛋白质的酶解，得到特定的生物活性肽，具有特定的功能）
