导图社区 蛋白质的结构与功能
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第一章 蛋白质的结构与功能
蛋白质的分子组成
C、H、O、N、S(P、Fe、Cu、Zn、Mn、I)
N:16%(凯式定氮法-每克样品含氮数*6.25*100=100g样品中蛋白质含量)
氨基酸是蛋白质的基本组成单位
L-a-氨基酸——基本结构单位
不参与但具有重要生理功能
鸟氨酸、瓜氨酸、精氨酸代琥珀酸-参与合成尿素
参与(甘氨酸除外)
按其侧链结构和理化性质分类
非极性脂肪族氨基酸
极性中性氨基酸
芳香族氨基酸
酸性氨基酸
碱性氨基酸
20/300参与组成蛋白质,硒代半胱氨酸
氨基酸具有共同或特异的理化性质
两性解离
等电点
含共轭双键的氨基酸具有紫外线吸收的性质
色氨酸,酪氨酸 280nm
分析溶液中蛋白质含量的快速简便的方法
与茚三铜反应生成蓝紫色化合物
570nm
氨基酸定量分析方法
肽键连接形成蛋白质或肽
2~20氨基酸相连-寡肽,20个以上-多肽
氨基末端-N-端,羧基末端-C-端
氨基酸残基
蛋白质的分子结构
由一条肽链形成的蛋白质只有一、二、三级结构,2条或2条以上的才有四级结构。二三四级结构统称为高级结构或空间构象。
一级结构
氨基酸的排列顺序决定
定义:从N-端至C-端的氨基酸排列顺序称为蛋白质一级结构
肽键(主要)、二硫键
一级结构是蛋白质空间构象和特异生物学功能的基础,但并不是决定蛋白质空间构象的唯一因素。
二级结构
定义:蛋白质分子中某一段肽链的局部空间结构,也就说该段肽链主链骨架原子的相对空间位置,并不涉及氨基酸残基侧链的构象。
多肽链的局部有规则重复的主链构象
包括a-螺旋、b-折叠、b-转角、W环
a-螺旋
是常见的蛋白质二级结构
是指蛋白质分子中多个肽平面通过α-碳原子沿长轴方向,按一定规律盘绕形成的稳定α-螺旋构象
特点
右手螺旋
3.6AA/圈,螺旋0.54nm
氢键维系
侧链基团在外,并以其大小、形状、所带电荷来影响其螺旋形式
b-折叠
使多肽链形成片层结构
又称β-片层。是指蛋白质多肽链主链中肽平面折叠成锯齿状的结构
肽链延伸折叠成锯齿状
若干肽段可互相靠拢,平行排列,成片层状
侧链基团在片层上下
平行排列的肽段可顺向,可反向
可通过回折形成相反方向
b-转角、W环存在于球状蛋白质
b-转角
常发生于肽链进行180°回折时的转角上,通常由4个氨基酸残基组成,其第一个残基的羰基氧与第四个残基的氨基氢可形成氢键
Ⅰ型和Ⅱ型的转角区别在于:肽键的二面角Y和F角有所不同
W环
这类肽段形状像希腊字母Ω,所以称Ω环。
总出现在蛋白质分子的表面,以亲水残基为主,在分子识别中可能起重要作用
肽单元
三级结构
多肽链进一步折叠
定义:是指整条肽链中全部氨基酸残基的相对空间位置,也就是整条肽链所有原子在三维空间的排布位置
折叠成紧密的球状或椭球状
含有多种二级结构并具有明显的折叠层次
疏水侧链常分布在分子内部
次级键
疏水键、盐键、氢键和范德华力
意义
使蛋白质具有亲水性
三级结构形成后,蛋白质才具有生理活性
结构模体
可由2个或2个以上的二级结构肽段组成
定义
是蛋白质分子中具有特定空间构象和特定功能的结构成分(模体是具有特殊功能的超二级结构)
模体例子
螺旋-环-螺旋
锌指
结构域
四级结构
含有两条以上多肽链的蛋白质可具有四级结构
维系键
氢键
离子键
亚基
蛋白质的功能
功能
构成细胞和生物体结构
物质运输
催化
信息交流
免疫
氧化供能
维持机体的酸碱平衡
维持正常的血浆渗透压
一级结构相似的蛋白质具有相似的高级结构与功能
氨基酸序列与生物进化信息
重要蛋白质的氨基酸序列改变可引起疾病
蛋白质的理化性质
性质
两性电离
胶体性质
变性与复性
在紫外光谱区有特征光吸收
呈色反应
茚三铜反应
双缩脲反应
碱性赖精组,酸性天和谷。 含硫半甲硫,羟基酪苏丝。 芳香苯色酪,分支缬亮异。
存在于自然界中的氨基酸有300余种,参与蛋白质合成的氨基酸一般有20种,通常是L-a-氨基酸(除甘氨酸外)