导图社区 酶
这是一篇关于酶的思维导图,包括酶的基本概念、酶的化学组成和分类、酶的结构与功能的关系、酶的作用机理等内容。
编辑于2021-09-25 12:58:04酶
酶的基本概念
酶1.1(酶是生物活细胞产生的,具有催化能力的生物催化剂) 1.2酶的化学本质(主要是蛋白质,极少数是RNAro核酸) 1.3酶的命名 (1)习惯命名 (2)系统命名 1.4酶与其它非酶催化剂的共同点
1.5酶特有的性质
酶的专一性
定义:是指酶对参与反应的底物有严格的选择性,即一种酶仅 能作用于一种底物,或一类分子结构相似的底物,发生某种特 定类型的化学反应,产生特定的产物。
绝对专一性(例如:脲酶只催化尿素水解成CO2和NH3。) 相对专一性(特定的化学键或特定的基因) 立体异构专一性(指酶对其所催化底物的立体构型有特定的要求。)
1.6酶活性及测定
相关概念: 酶活性:也称酶活力指酶催化一定化学反应的能力。其大小可用在一定条件下,它所催化的某一化学反应的反应速度来表示 酶反应速度:用单位时间内单位体积中底物的减少量或产物的增加量来表示。单位:浓度/单位时间 酶的活力单位:酶的多少通常用酶的活力单位来度量。1个酶的活力单位(U)定义为在一定条件下,单位时间内转化单位量底物所需的酶量。 酶的比活力:是指每毫克蛋白质所含酶的活力单位数·比活力可以表示酶的纯度。
酶活力测定的方法:
酶活力测定的实质:测定它所催化的化学反应的最佳反应速度。
·反应速度测定的两种方法:
1)检测单位时间内底物的减少量;
2)测定单位时间内产物的增加量。
测活基本条件:
①反应条件为最适条件,包括最适pH丶最适温度和最适离子强度等
②反应速度为初速度
③底物浓度过量。
具体测定方法 分光光度法: 多利用产物在紫外或可见光部分的光吸收性质,选择适当波长,测定反应过程的进行情 况简便、节约时间和样品,可以检测nmo1/L水平的变化 荧光法: 主要利用底物或产物的荧光性质。灵敏度高,但易受到干扰 同位素测定法: 同位素标记底物,反应后经分离,检测产物的脉冲数,即可换算成酶的活力单位灵敏 度最高。 电化学方法:pH计、氧电极法
酶的化学组成和分类
2.1酶的化学组成 2.1.1根据酶的化学组成分类 单纯酶:仅含有蛋白质的酶 如淀粉酶丶脂肪酶丶核糖核酸酶 结合酶:酶蛋白+辅因子=全酶 结合酶举例,()内为辅因子: 乳酸脱氢酶(辅酶,NAD) 异柠檬酸脱氢酶(辅酶,NAD) 醇脱氢酶(辅酶,NAD) 葡萄糖-6-磷酸脱氢酶(辅酶l,nADP) 琥珀酸脱氢酶(FAD) 乙酰辅酶A羧化酶(生物素,ATP,Mg++) 脂酰辅酶A合成酶(辅酶A,CA)
酶的辅助因子
一种酶蛋白只能与某一特定的辅酶/辅基集合(一蛋白一辅酶); 一种辅酶/辅基可与多种不同的酶蛋白结合组成具有不同专一性的酶(一辅酶多蛋白)
标注
*辅因子
※金属离子(Mg2+Zn2+、e2+Cu2+、Mn2+)
标注
小分子有机物(多是B族维生素的衍生物) (对电子、原子或化学基团起传递作用)
标注
辅基--以共价键紧密结合,透析不可分开
辅酶---以非共价键松散结合,透析可分开
概要
2.2.2按酶蛋白的亚基组成分类 单体酶:由一条多肽链组成的酶种类少,多水解酶,分子量13~35KD,如牛胰核糖核酸酶丶溶菌酶丶胰凝乳蛋白酶。 寡聚酶:由多种相同或不同亚基以非共价键结合组成的酶多为调节酶,且多数的聚合形式是活性型,解聚形式是失活型 多酶复合体:由几种不同功能的酶彼此聚合形成的复合体。 有利于一系列反应的连续进行,以提高酶催化效率,同时方便机体对酶的调控,如丙酮酸 脱氢酶复合体(三种酶、6种辅因子)
子主题
酶的结构与功能的关系
3.1酶的主要结构 >酶的活性中心:酶分子中能与底物特异性结合并催化底物转变为产物的具有 特定三维结构的区域。 必需基团:酶分子中氨基酸残基侧链的化学基团中,一些与酶活性密切相关 的化学基团 >活性中心内的必需基团:包括结合基团(与底物结合)和催化基团(催化底 物变成产物) >活性中心外的必需基团:位于活性中心以外,维持酶活性中心应有的空间构 象或作为调节剂的结合部位所需。 酶活性中心的特点 ·活性中心是一个三维实体,通常由在一级结构上并不相邻的氨基酸残基组成 活性中心只占酶总体积很小的一部分(约1%~2%) 活性中心为酶分子表面的一个裂缝丶空隙或口袋,中心内多为疏水氨基酸残基,但也有 少量极性氨基酸残基,以便底物结合和进行催化 与底物结合为多重次级键,包括氢键丶疏水键和范德华力 ·底物结合的专一性在一定程度上取决于活性中心和底物之间在结构上的互补性 活性中心的构象不是固定不变的,而是具有一定的柔性
3.2酶原激活 >酶原激活:一些酶(主要是蛋白酶,这里称为酶原)在体内以无 活性的酶原形式被合成,需要通过水解(由其他蛋白酶催化或自 我催化)去除一些氨基酸序列以后才会有活性,这种调节酶活性 的方式称为酶原激活或水解激活。 >实质是分子构象改变,酶活性中心形成和暴露的过程 >改变酶的一级结构,具有不可逆性 酶原存在及激活的意义? 例1:急性胰腺炎的发病机理 胰腺分泌的胰蛋白酶原被就地激活。 例2:凝血酶原的激活 生理情况下,血液中的凝血酶原不被激活,保证血流畅通;血 管破损时,凝血酶原被激活,产生血凝块,阻止大量失血 酶原激活的生理意义 避免细胞产生的酶对细胞进行自身消化,并使酶在特定的部位 和环境中发挥作用,保证代谢正常进行。 有些酶原可视作酶的储存形式。
3.3同工酶 ※ 定义 指催化相同的化学反应,但酶蛋白的分子结构理化性质乃至免疫学性质不 同的一组酶。 ·由不同的基因编码的多肽链,或由编码的基因相同但不同的转录后加工或不同 的翻译后加工。 具有相似的活性中心。 ·存在于同一种属或同一个体的不同组织或同一细胞的不同亚细胞结构中,使得 不同组织丶器官和不同的亚细胞结构具有不同的代谢特征为同工酶用来诊断 不同器官的疾病提供了理论依据。
3.4别构酶 别构酶:某些化合物与酶分子中的别构中心可逆地结合,使酶分子的构象 改变,从而改变酶的催化活性,这种调节称为别构调节·具有别构调节作 用的酶称为别构酶,也称为变构酶。
酶的作用机理
过渡态:根据过渡态理论( transition state theory),在任何一个化学 反应系统中,反应物需要到达一个特定的高能状态以后才能发生反应。这种 不稳定的高能状态被称为过渡态。 活化能:底物分子从基态转变到过渡态所需的能量。
标注
※酶稳定反应过渡态的机制 邻近与定向效应 ·底物变形 ·酸碱催化 共价催化 活性部位的低介电性
1)邻近与定向效应 邻近效应:酶使游离底物集中于酶分子的活性中心区域,反应基团之间相互 靠近,增加亲核攻击的机会。 定向效应:底物的反应基团和酶的催化基团之间,或底物的反应基团之间正 确的空间取向所产生的效应
2)底物形变 >底物形变实为诱导契合的主要结果当酶与底物相遇时,酶分子诱导底物 分子内部结构重排,发生形变,比较接近它的过渡态
3)酸碱催化 参与绝大多数的催化 稳定过度期 失去质子——酸催化 得到质子——碱催化
4)共价催化 定义:指酶在催化过程中必须与底物上的某些基团暂时形成不稳定的共价 中间物的一种催化方式。 >这种共价键是某些氨基酸残基的侧链作为亲核试剂,对底物分子上的亲电 基团展开亲核攻击造成的,这样的催化有时也叫亲核催化。
5)活性部位的低介电性 >即疏水的非极性环境:有利于电荷之间的相互作用
酶促反应动力学
>酶促反应动力学:研究各种因素对酶促反应速率的影响,并加以定量 的阐述。 >酶促反应速率:一般都是以单位时间内,底物或产物浓度的变化值来 表示。 ※ >影响因素包括:底物浓度丶酶浓度、pH丶温度丶抑制剂激活剂离 子强度等
※ >Km是酶的特征常数,与酶浓度无关,与底物的种类和酶促反应的条件有关 在一定条件下,不同的酶具有不同的Km值,可鉴别酶 Km作为常数,只是对一定的底物、pH丶温度及离子强度等条件而言,同 一酶对于不同底物有不同的Km值(例:可逆反应)。 有多个酶催化的连锁反应,如能确定各种酶m值及相应的底物浓度,有 助于寻找代谢过程中的限速步骤。 Km值大的酶为限速酶 反应激活剂与抑制剂的存在 ·酶不仅与底物结合,也可与激活剂或抑制剂结合而影响Km值,通过Km值 的测定可以协助激活剂及抑制剂的存在以及抑制作用的类型。 Km值可以用于酶的鉴定 根据Km稳定与否,判定酶是否被纯化 酶对特定底物的Km值是恒定的。 对同一底物,不同的同工酶具有不同的Km值 可以利用酶的Km值判断一些酶是同工酶还是同一种酶
5.2.酶浓度对反应速率的影响 在一定温度和pH条件下,当底物浓度大大超过酶浓度时, 酶的浓度和反应速度呈正比关系。
5.5.激活剂对酶反应速率的影响 激活剂:使酶由无活性变为有活性或使酶活性增加的物质 ●必需激活剂—酶促反应不可缺少 ●非必需激活剂提高酶反应活性 应用离子激活剂的注意事项 ·激活剂对酶有一定的选择性(相对性) ·激活剂浓度对其作用的影响
定义 抑制剂与酶蛋白中的必需基团以共价形式结合,引起酶的永久性失活, 不能用透析或超滤等物理方法除去抑制剂而恢复酶活性 >常用抑制剂种类 有机磷杀虫剂 烷化试剂丶 有机汞有机砷化合物 氰化物硫化物、C 重金属盐 青霉素 >分为专一性不可逆抑制剂和非专一性不可逆抑制剂两种
实例一:丙二酸对琥珀酸脱氢酶的抑制
酶活性调节
关键酶
主要调节方式
1)别构调节
变构酶:某些化合物与酶分子中的别构中心可逆地结合,使酶分子的构象改变从而改变酶的催化活性,这种调节称为 变构调节。具有别构调节作用的酶称为变构酶,也称为别构酶。 >变构效应剂:能使酶分子发生别构作用的小分子物质,常为机体正常 代谢产生的中间物或终产物。因别构导致酶活性增加的物质称为变构 激活剂或正变构效应物;相反,为变构抑制剂或负变构效应物 >协同效应:当效应剂与调节亚基结合后,通过改变酶分子的构象,促 进催化亚基与底物的结合,称为变构激活或正协同效应;反之为负协 同效应。 变构酶的一般性质 除了活性中心外,还含有变构中心,这是判断一个酶是不是别构酶的唯一标准 别构效应物与被调节的酶结合是可逆的 >一般是寡聚酶(多亚基),具有四级结构 >动力学曲线一般是S型 >大多是生理物质,常是系列反应酶系统的第一个酶或处于代谢途径分支上的酶 >变构酶对酶的影响可以是激活也可以是抑制 ※ 变构酶的生理意义: >可通过其浓度改变快速调节细胞内酶的活性,实现对代谢速度和方向的调 节 >有利于通过反馈抑制的方式及早地调整整个代谢途径的速度,减少不必要 的底物消耗
2)共价修饰调节
※ >共价修饰:酶蛋白肽链上一些基团可与某种化学基团发生可逆的共价结合 ,从而改变酶的活性。这种酶活性的调节方式称为共价修饰·能进行共价 修饰的酶称为共价修饰酶 >特点 一般具有无活性(或低活性)和有活性(或高活性)两种形式 过程可逆,分别由修饰酶和去修饰酶催化 具有级联放大效应
3)酶原激活
4)调节蛋白的激活或抑制
定义: 细胞内的某些蛋白质可与特定的酶结合而调节被结合的酶的活性,这些 调节酶活性的蛋白质称为调节蛋白。其中,抑制酶活性的调节蛋白称为抑制 蛋白,激活酶活性的调节蛋白称为激活蛋白
第七节酶的应用
酶基因的缺失引起遗传病 酶活性的高低作为疾病诊断指标 >酶作为试剂用于临床检验和科学研究 >酶和酶的抑制剂作为治疗药物 >酶制剂作为饲料添加剂 >酶用于食品加工 酶用于工业生产
本章小结 概述 酶的概念(酶和核酶)丶特性(高效性、专一性和可调性等) 化学组成 简单酶和结合酶(辅酶或辅基,与维生素丶核苷酸的关系) 分子组成 单体酶丶寡聚酶;酶的活性中心和必需集团;酶原和酶原的 激活 >酶催化高效性的作用的机理 酶催化作用机制(中间产物学说) 酶的动力学 酶活性及其表示法;温度pH、酶浓度;[S]与反应速度 的关系(米氏方程,米氏常数、意义及求法,米氏曲线);抑制剂 (动力学曲线和特点,举例);不可逆(专一和非专一);可逆抑 制(竞争和非竞争);激活剂 酶活性的调节 变构调节和共价修饰调节(定义丶原理和举例)