导图社区 临床标本
临床标本处理与分离纯化技术
临床标本的处理
一般原则:安全、适时、足量、采集部位合理、低温及时送检
标本的保存
DNA:短期4℃,长期-20℃及以下
RNA:短期-20℃,长期-70℃以下或液氮中
处理方法
血液标本:避免使用肝素抗凝
全血标本:最常使用
血清(浆)标本:外源性基因检测
外周血单个核细胞
棉拭子
体液标本
痰液标本:NaOH液化预处理
组织标本
细胞标本
生物样本分离纯化
DNA的分离纯化
酚-氯仿抽提法
原理
氯仿:增大酚的极性
TE溶液:保证DNA稳定性,悬浮细胞,熔解DNA(最后一步)
EDTA:金属离子螯合酶,抑制DNA酶活性,防止DNA被降解
SDS:弱碱,裂解细胞
蛋白酶K:降解蛋白
RNA酶:降解RNA
饱和酚:使蛋白质变性,不溶于水
再次纯化
NaAc:Na+中和DNA分子上的负电荷
无水乙醇:使DNA中的水溶于乙醇
二者作用:沉淀DNA
吸附柱法
原理
步骤
1.细胞破碎
2.核酸特异性吸附在硅载体上
3.洗脱核酸
4.熔解吸收DNA
RNA的分离纯化
原则:防止RNase对RNA的降解
制备前用DEPC:去除RNA酶(外源性)
总RNA的制备:Trizol试剂提取
原理
Trizol作用
1.变性蛋白
2.抑制RNA酶;裂解细胞
3.含Na离子:使DNA不溶于水
mRNA制备:亲和层析
原理
n:亲和层析
循环miRNA的制备
长链非编码RNA的制备
蛋白质的分离纯化
原则:尽可能保持其生物学活性
原理:利用蛋白质的性质异同
生物样本质量鉴定
核酸
含量
紫外分光光度法:在1cm光程下,A260=1,双链DNA含量为50ug/ml,单链RNA的含量为40ug/ml
纯度
A260/A280:DNA=1.8,RNA=1.8~2.0
A260/A230=2.0~2.5
完整性
凝胶电泳+荧光染色+紫外观察
蛋白质
浓度
纯度
鉴定核酸最常用方法:琼脂糖凝胶电泳法
原理
荧光染料:EB、SyberGreen
指标
A260nm:核酸(0.1~1.0)
A280nm:蛋白质和酚类(纯DNA的A260/280为1.8,纯RNA为2.0)
A230nm:碳水化合物(纯DNA和RNA的A260/A230为2.5,比值小于2.0被污染
沉淀洗涤
酚
无水乙醇
高盐溶液
洗涤:70%无水乙醇
柱
无需沉淀
加TE溶液
洗涤:79%无水乙醇
去除杂质
酚:RNA酶、酚
柱:硅制剂吸附DNA去除其它杂质
破细胞
DNA分离纯化基本步骤