1、多态性:即群体中多型基因位点的比例。所谓多型基因位点是指该位点具有两个或两个以上的等位基因。
2、杂合性:即群体中多个基因位点杂合子频率的平均值。
3、基因一致度:是指从各个位点随机抽出两个相同等位基因的概率之均值,亦叫平均纯合度。
4、近交增量(又叫近交率):群体遗传多样性消失的概率,可以用一代间群体平均近交系数的增量来表示。ΔF=Ft-Ft-1(公式)近交增量是目前标志群体遗传多样性下降速率的一个最适宜指标。
5、群体有效规模:又叫群体有效繁殖个数、群体有效含量。所谓群体有效规模是指就决定近交率上升速度而言,群体实际规模所相当于“理想群体”的头数而“理想群体”乃是规模恒定,公母各半,没有选择、迁移、突变以及世代交替的随机交配群体。为了统计上的方便,群体有效规模常用Ne来表示。