①通用性：所有生物可共用一套密码。为进化论提供了强有力的支持，充分说明生物有共同起源
②连续性：在mRNA链上，从起始信号到终止信号，密码子的排列是连续的，之间既没有重叠也没有间隔，无标点。翻译时正确选择阅读起点，依次翻译，由起始密码子到终止密码子组成的区域叫阅读框架（阅读框）。
若阅读框中缺少或跳跃，即会移码，产生错误蛋白。
③简并性：几种密码子编码同一种氨基酸的现象。编码同种氨基酸的的一组密码子互称同义密码子。
甲硫氨酸和色氨酸只有一个密码子。专一性主要取决于前两位碱基。不同物种使用通用密码存在偏好。
增加了密码子中碱基改变仍然编码原来氨基酸的可能性，减少了因碱基变化造成的可能伤害，利于遗传与进化的统一。
④变偶性：mRNA和tRNA进行碱基配对，前两对严格遵守原则，第三对可以有一定的变动。反密码子5'端碱基和密码子3'端碱基被定义为变偶碱基。tRNA中常为修饰碱基，次黄嘌呤出现频率高。
由于变偶性，理论上32种tRNA就可以识别61个编码密码子。
