导图社区 蛋白质翻译
关于蛋白质翻译的思维导图。包括以下内容: 1,遗传密码 2.运载单位 3.场所-核糖体 4.模板-mRNA 5.具体过程 6.蛋白质的转运机制 7.修饰、降解、稳定性研究
编辑于2022-08-15 20:03:35 上海翻译
1. 遗传密码
概念
三联体密码子 沿着mRNA5‘-3’开始翻译
性质
连续性(密码子间没有空格)
简并性(除AUG(Met)、UGG(Try)外,每个氨基酸都有多个密码子对应)
通用性
特殊性(大多数时候通用,少数时候例外)
密码子与反密码子 反向平行配对 摆动学说
起始密码子(AUG GUG),终止密码子(3个)
2. 运载单位-tRNA
结构
二级结构
三叶草型
1柄(CCA-OH‘氨基酸臂) 3叶(假尿嘧啶环,反密码子环,二氢尿嘧啶环D)
三级结构
倒L型
氢键形成
氨基酸臂、假尿嘧啶环 一个双螺旋;反密码子环、二氢尿嘧啶环一个双螺旋
为了让AAs靠近核糖体大亚基上的多肽合成位点;反密码子环靠近小亚基上的mRNA与之配对
作用
运输氨基酸的工具
解读mRNA的遗传信息
种类
起始tRNA
延伸tRNA
同工tRNA
代表同一种氨基酸,结构上相似能被同一种氨酰tRNA合成酶识别
校正tRNA
无义校正
校正tRNA与释放因子竞争
错义校正
校正tRNA与正常密码子竞争
3. 场所-核糖体
原核
组成
大亚基
23S-可能与起始tRNA的结合有关
5S-两个保守序列(CGAAC是它和tRNA互相识别的序列;GCGCCGAAUGGUAGU与23S一段序列互补,是5S与50S大亚基相互作用的位点)
小亚基
16S-两个保守序列(一个与mRNA的5’端SD序列互补;一段在靠近3‘端识别23S,在30S和50S间起作用)
真核
功能
合成的场所
同时容纳另一种携带肽链的tRNA,肽酰tRNA
5个活性位点(主要在大亚基)
mRNA结合部位
结合或接受AA-tRNA部位(A位)
结合或接受肽基tRNA的部位
肽基转移部位(P位)
形成肽键的部位(转肽酶中心)
各种延伸因子的结合位点
4. 模板-mRNA
5. 具体过程
氨基酸的活化
氨酰-tRNA合成酶作用下 活化成 活化氨基酸-AA-tRNA
肽链的起始
30S小亚基+IF、IF3,通过SD序列与mRNA结合——在IF2+GTP的帮助下,fMet-tRNAfMet进入小亚基P位,tRNA的反密码子与mRNA上的起始密码子配对——带有tRNA、mRNA、3个起始因子的小亚基复合物+50S大亚基结合——GTP水解,释放起始因子
延伸
后续AA-tRNA与核糖体结合
起始复合物形成后,氨酰-tRNA+EF-Tu。GTP复合物——A位
肽键的生成
肽基转移酶作用移到P位,与之前的氨酰tRNA形成肽键
移位
水解GDP在EF-Tu作用下释放GDP,完成移位,使新形成的肽酰-tRNA完全进入P位,结合另一GTP,进入新循环
终止
遇见终止密码子UAA、UAG、UGA时,释放因子识别这些密码子,水解P位多肽链与tRNA间的二酯键,新生肽链、tRNA释放,大小亚基解体
新合成肽链的折叠加工
蛋白质前体的加工
N端fMet/Met的切除
二硫键的形成
特定氨基酸的修饰
新生肽非功能片段的切除
蛋白质的折叠
酶:二硫键异构酶、脯氨酸顺反异构酶
分子伴侣:热休克蛋白(帮助能自发折叠的pro);伴侣素(帮助不能自发折叠的pro)
6. 蛋白质的转运机制
共翻译转运
翻译后转运
7. 修饰、降解、稳定性研究
泛素划介导的蛋白质降解
泛素组成
泛素激活E1
泛素结合E2
泛素连接E3
具体过程
ATP供给能量前提下,E1黏附在泛素分子尾部的Cys上——激活泛素分子——将泛素分子转移到E2
E3将连接有E2的泛素连接到靶细胞
26s蛋白酶体特意识别到该蛋白质将其降解
SUMOylation小泛素相关修饰物
翻译后蛋白质修饰系统
阻碍泛素对底物蛋白的共价修饰,提高其稳定性,使之不被降解
NEDDylation
类似泛素+参与蛋白质翻译后修饰+不引起蛋白质降解,只借此调节蛋白质的功能
蛋白质一级结构对其稳定性的影响
N段第一个残基对蛋白质稳定性的影响
Met、Gly、Ala、Ser、Thr、Val稳定
Lys、Arg不稳定
靠的是氨酰tRNA合成酶:催化特定氨基酸和tRNA结合,对两者都有高度专一性——AA+tRNA+ATP=AA-tRNA+AMP+ppi