导图社区 甲基化研究
这是一篇关于甲基化研究的思维导图,上游机制-间接机制:检测启动子CpG岛甲基化水平变化或者是组蛋白甲基化位点甲基化水平变化。
ceRNA筛选思路:①直接筛非编码RNA;②有功能基因,找编码蛋白的mRNA;③有miRNA,过表达miRNA筛选RNA表达谱变化,从差异表达趋势一致的分子中做ceRNA预测然后进行验证。
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甲基化研究
甲基化的实验检测方法
酶切法 Southern Blotting
MS-PCR、BSP
DNA甲基化怎么找
从启动子区找CpG岛(生信)
特异性甲基化检测方法验证
上游机制-间接机制
检测启动子CpG岛甲基化水平变化或者是组蛋白甲基化位点甲基化水平变化
上游机制-直接机制
找甲基化酶和去甲基化酶表达水平的变化,或者是甲基化结合蛋白MBD,通过再引入一个因变量(酶-某分子-靶基因)把故事自圆其说
CpG岛甲基化可以影响转录因子在相应位点对启动子的结合
研究套路
1 寻找甲基化位点(启动子区找CpG岛)
2 实验验证(MSP、BSP)
3 分析甲基化位点与生物表型的相关性
4 验证甲基化调控靶基因表达量的变化
5 构建转录层面调控机制