分子交互

ceRNA筛选思路：①直接筛非编码RNA；②有功能基因，找编码蛋白的mRNA；③有miRNA，过表达miRNA筛选RNA表达谱变化，从差异表达趋势一致的分子中做ceRNA预测然后进行验证。

分子交互

• 蛋白结合DNA
  • 转录因子
• 蛋白结合蛋白
  • 受体与配体
  • 抗体抗原反应
• RNA结合DNA或RNA
  • lncRNA、circRNA
• RNA结合蛋白或蛋白结合RNA
• ceRNA(竞争性内源RNA)
  • 具有MRE，即miRNA反应原件
  • 能够竞争性结合miRNA,最终发挥miRNA对靶基因调控的作用
  • ceRNA的调控机制：①两个RNA分子能够结合的miRNA必须有交集；②构成ceRNA调控关系的RNA分子其表达量是正相关关系
  • ceRNA筛选思路：①直接筛非编码RNA；②有功能基因，找编码蛋白的mRNA；③有miRNA，过表达miRNA筛选RNA表达谱变化，从差异表达趋势一致的分子中做ceRNA预测然后进行验证
• ceRNA的研究思路 A-B-C
  • 1 验证A,C的表达正相关，qPCR、western等
  • 2 上调或下调A影响C的表达，反过来也一样
  • 3 验证miRNA可以抑制主变量和编码基因
  • 4 证明A、C是B的靶基因，荧光素酶报告实验
  • 5 rescue（反反反）
  • 加分步骤，过表达A-与C结合的miRNA少，C表达量上升