第五章引物设计

引物设计（常规引物设计，简并引物设计）检测结果分析（测序原理，样品送检，结果分析）序列拼接（软件，应用）。

第五章

• 引物设计
  • 引物设计
    • 重要性
    • 原则
      • 长度
      • 特异性
      • 碱基分布
      • 互补情况
      • 修饰情况
      • 二级结构
      • GC含量
      • Tm值
      • ▲G值
      • 密码子的简并
    • 流程
      • 模板查找和下载
      • 序列同源性比较
      • 引物设计与筛选
      • 引物加工与修饰
      • 引物的评价分析
      • 引物的二次筛选
      • 引物的最终评估
    • 分类/设计软件
      • 常规引物设计
        • DNAMAN
        • Primer premier
        • Oligo
        • primer-Blast
      • 简并引物设计
        • Clustal W+primer premier
        • DNAMAN
        • Oligo
        • 在线CODEHOP
    • 简并引物设计
      • 相关概念
        • 简并性
        • 简并位点
        • 简并引物
        • 简并度
        • 简并PCR
      • 应用
      • 重要性
      • 设计原则
      • 实例
        • 只知道表达蛋白质序列但不知道DNA序列
        • 利用其他生物已确认的序列来扩增某一编码区
  • 测序结果分析
  • 序列拼接
• 测序结果分析
  • 测序原理
    • Sanger双脱氧末端终止法
    • 新一代测序技术（NGS）
    • 单分子测序
  • 测序样品送检
    • PCR产物
    • 质粒
    • 菌液
  • 测序结果分析
• 序列拼接
  • 软件
  • 应用