核酸序列分析

这是一个关于核酸序列分析的思维导图，详细的总结了第一代DNA测序技术，新一代序技术，核酸数据分析。

核酸序列分析

• 第一代DNA测序技术
  • 双脱氧链终止法测序原理
    • 进行测序反应
    • 凝胶电泳和序列读取
  • 测序反应体系
    • DNA模板
      • 单链DNA模板
      • 双链DNA模板
      • PCR产物
    • 测序引物
    • DNA聚合酶
    • 荧光标记
  • 自动DNA测序仪
    • 自动DNA测序仪的主要构成
    • 自动DNA测序仪的种类
    • 自动DNA测序仪的工作原理
  • 测序策略
    • 确证性测序策略
    • 未知DNA序列的测定策略
      • 较小的目的DNA片段
      • 大片段未知序列DNA
    • 大规模基因组计划测序
• 新一代测序技术
  • 基本原理和工作流程
    • DNA片段单分子扩增
    • 并行测序反应
  • 新一代测序技术的特点
  • 新一代测序技术的应用
    • 从头测序和重测序
    • 个体基因组测序和SNP研究
    • 转录组及表达谱分析
    • 小分子RNA研究
  • 第三代测序技术的发展趋势
    • 通过检测掺入的荧光标记核苷酸实现单分子测序
    • 直接读取单分子DNA序列
• 核酸数据分析
  • 核酸数据库
    • GenBank
    • EMBL
    • DDBJ
  • 数据库查询和检索
    • Entrez检索工具
    • SRS检索工具
    • DBGET/LinkDB检索工具
  • 核酸序列的基本分析
    • 核酸序列的分子量、碱基组成、碱基分布等基本分析
    • 限制性酶切分析
    • DNA测序分析
    • EST序列的电子延伸
  • 核酸序列的对比分析
    • BLAST
    • FASTA
  • 开放阅读框和编码序列分析
  • 启动子预测
  • 向数据库提交核酸序列