R语言基础

该内容描述了一个使用R语言和RStudio进行数据分析或科学计算的基本流程。首先，用户需要完成R和RStudio的安装，用户会利用CRAN（Comprehensive R Archive Network，R语言的综合存档网络）来安装所需的R包，这些包提供了额外的函数和数据集，有助于用户完成特定的分析任务。费曼医学僧，一起探索数据挖掘。不定时分享R语言知识、生信挖掘知识、孟德尔随机化知识.有配套的课程。

R语言基础

• R、Rstudio、Rtools安装
  • 安装R
  • 安装Rstudio
  • 安装Rtools
• Rstudio界面简介
  • 个性化界面设置
  • CRAN镜像的永久设置
• R包管理
  • R包
    • 源码包与二进制
    • R包的安装
      • 网络安装
        • R包典藏网：CRAN install.packages(" ")
        • 生物信息： bioconductor BioManager::install(" ")
        • 程序仓库：github devtools::install_github（" "）
      • 本地安装
  • 修改镜像
    • CRAN options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/"))
    • bioconductor options(BioC_mirror="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/bioconductor/")
    • 使用Rstudio界面来设置镜像也可
  • 安装路径管理
    • 查看R包所在的路径 .libPaths() #查看
• 创建一个Rproject
  • 创建一个R project
  • 创建、保存、打开R脚本
  • 一些常用指令
    • 查看当前路径：getwd()
    • 设置当前路径：setwd()
    • 清除当前环境变量：rm(list=ls())
    • 清除内存：gc()
    • SessionInfo() 查看R与R包版本等信息
    • 查看函数帮助：?函数名；例如：??rms（有些帮助是一个?,有些是??）
• R语言中常见的符号和快捷键
  • 在编辑、运行代码区创建小标题：Ctrl+shift+R
  • 赋值： <- Alt+-；= 也是赋值号
  • 注释：## Ctrl+shift+c；运行时注释的内容不运行代
  • 逻辑运算： >, <, =, >=, <=, == ；输出是TRUE、FALSE
  • 各类括号：()、[]、{}
  • 算术运算：+, -, *, /
• R语言文件读入、写入
  • .txt、.csv、.excel文件的读入/写入
  • 矩阵与数据框的区别