导图社区 基因实验的方法
这是一篇关于基因实验的方法的思维导图,总结了基因实验中常用的过表达、敲低和敲除KO方法,对每种方法下的具体技术进行了详细说明,并清晰列出了各自的优缺点和适用场景。
这是一篇关于MIRI涉及到的表型的思维导图,主要内容包括:程序性死亡激活,组织与结构层面表型,器官功能层面表型,分子层面表型。
这是一篇关于铁死亡表型检测实验的思维导图,主要内容包括:生化指标验证实验(核心检测项)。阐述了各维度下的实验内容,离子水平、CPX4 - GSH抗氧化、脂质过氧化水平。
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基因实验的方法
过表达
质粒转染
不永久
快速简单
缺点瞬时表达
Rescue,快速实验
稳定转染
永久
优点:可长期使用
缺点:耗时
适用于需要稳定表达时
慢病毒OE
优点:最稳定,适合原代
缺点:成本高
适用于高分文章,动物实验
腺病毒
优点:感染强
缺点:暂时表达
适合于动物短期表达
敲低
RNA干扰(siRNA/shRNA):短双链RNA降解mRNA
CRISPRi:dCas9靶向启动子区抑制转录
Morpholino:反义寡核苷酸阻断翻译(用于胚胎)
优点:
✓ 快速(3-5天见效),周期短
✓ 可逆(RNAi为瞬时效应)
✓ 适合研究必需基因(不完全致死)
✓ 成本低,操作简单
缺点:
不彻底(残留表达20-80%)
脱靶效应(尤其是siRNA)
易受代偿机制影响
对长半衰期蛋白效果差
敲除KO
CRISPR-CAS9
优点:永久主流
缺点:单克隆困难
适合于机制深度研究
CRISPR-CAS12a
优点:特异性更高
缺点;使用·少
适合于多机制KO
CRISPRi
优点:可逆 特异
缺点:不能KO
适合于必需基因抑制
shRNA/siRNA(KD)
优点:快速便宜
缺点:不是KO
预实验