生物化学 蛋白质

生物化学与分子生物学第三章蛋白质思维导图，包含蛋白质的共价结构、 蛋白质的三维结构、蛋白质结构与功能的关系、 蛋白质的分离纯化和表征等。

蛋白质

• 氨基酸
  • 一、氨基酸—蛋白质的构件分子
    • 1 蛋白质的水解
    • 2 α-氨基酸的一般结构
  • 二、氨基酸的分类
    • 1 常见的蛋白质氨基酸
    • 2 不常见的蛋白质氨基酸
    • 3 非蛋白的氨基酸
  • 三、氨基酸的酸碱化学
    • 1 氨基酸的碱性离子形式
    • 2 氨基酸的解离
    • 3 氨基酸的等电点
    • 4 氨基酸的甲醛滴定
  • 四、氨基酸的化学反应
    • 1 α-氨基参加的反应
    • 2 α-羧基参加的反应
    • 3 α-氨基和α-羧基共同参加的反应
  • 五、氨基酸的光学活性和光谱性质
    • 1 氨基酸的光学活性和立体化学
    • 2 氨基酸的光谱性质
  • 六、氨基酸混合物的分析分离
    • 1 分配层析法的一般原理
    • 2 分配柱层析
    • 3 纸层析
    • 4 薄层层析
    • 5 离子交换层析
    • 6 气液层析
    • 7 高效液相层析
  • 七、糖胺聚糖和蛋白聚糖
    • 1 糖胺聚糖
    • 2 蛋白聚糖
• 蛋白质的共价结构
  • 一、蛋白质通论
    • 1 蛋白质的化学组成和分类
    • 2 蛋白质的分子大小和形状
    • 3 蛋白质构象和蛋白质结构的组织层次
    • 4 蛋白质功能的多样性
  • 二、肽
    • 1 肽和肽键的结构
    • 2 肽的物理和化学性质
    • 3 天然存在的活性肽
  • 三、蛋白质一级结构的测定
    • 1 蛋白质测序的策略
    • 2 N-末端和C-末端氨基酸残基的鉴定
    • 3 二硫桥位置的确定
    • 4 氨基酸组成的分析
    • 5 多肽链的部分裂解和肽段混合物的分离纯化
    • 6 肽段氨基酸序列的测定
    • 7 肽段在多肽链中次序决定
    • 8 二硫桥位置的确定
    • 9 蛋白质测序举例
    • 10 蛋白质序列数据库
  • 四、蛋白质氨基酸序列与生物功能
    • 1 同源蛋白质的物种差异与生物进化
    • 2 同源蛋白质具有共同的进化源
    • 3 血液凝固与氨基酸序列的局部断裂
  • 五、肽与蛋白质的人工合成
    • 1 肽的人工合成
    • 2 胰岛素的人工合成
    • 3 固相肽合成
• 蛋白质的三维结构
  • 一、研究蛋白质构象的方法
    • 1 X射线衍射法
    • 2 研究溶液中蛋白质构象的光谱学方法
  • 二、稳定蛋白质三维结构的作用力
    • 1 氢键
    • 2 范德华力（范德华力相互作用）
    • 3 疏水作用（熵效应）
    • 4 盐键
    • 5 二硫键
  • 三、多肽主链折叠的空间限制
    • 1 酰胺平面与α-碳原子的二面角
    • 2 可允许的Ф和Ψ值：拉式构象图
  • 四、二级结构：多肽链折叠的规则方式
    • 1 α螺旋
    • 2 β折叠片
    • 3 β转角和β凸起
    • 4 无规则卷曲
  • 五、纤维状蛋白质
    • 1 α-角蛋白
    • 2 丝心蛋白和其他β-角蛋白；β折叠片蛋白质
    • 3 胶原蛋白:一种三股螺旋
    • 4 弹性蛋白
    • 5 肌球蛋白和原肌球蛋白
  • 六、超二级结构和结构域
    • 1 超二级结构
    • 2 结构域
  • 七、球状蛋白质与三级结构
    • 1 球状蛋白质的分类
    • 2 球状蛋白质三维结构特征
  • 八、蛋白质结构折叠和结构预测
    • 1 蛋白质的变性
    • 2 氨基酸序列规定蛋白质的三维结构
    • 3 蛋白质折叠的热力学
    • 4 蛋白质折叠的动力学
    • 5 蛋白质结构的预测
  • 九、亚基缔合的四级结构
    • 1 有关四级结构的一些概念
    • 2 四级缔合的驱动力
    • 3 亚基相互作用的方式
    • 4 四级结构的对称性
    • 5 四级缔合在结构和功能上的优越性
• 蛋白质结构与功能的关系
  • 一、肌红蛋白结构与功能
    • 1 肌红蛋白的三级结构
    • 2 辅基血红素
    • 3 氧气与肌红蛋白的结合
    • 4 氧气的结合改变肌红蛋白的构象
    • 5 肌红蛋白结合氧的定量分析(氧结合曲线）
  • 二、血红蛋白结构与功能
    • 1 血红蛋白结构
    • 2 氧结合引起的血红蛋白构象变化
    • 3 血红蛋白的协同性氧结合(Hb氧结合曲线)
    • 4 氢离子、二氧化碳,和BPG对血红蛋白结合氧的影响
  • 血红蛋白分子病
    • 1 分子病是遗传的
    • 2 镰刃状细胞贫血病
    • 3 其他血红蛋白病
    • 4 地中海贫血
  • 免疫系统和免疫球蛋白
    • 1 免疫系统
    • 2 免疫系统能识别自我和非我
    • 3 在细胞表面的分子相互作用引发免疫反应
  • 五、肌球蛋白丝、肌动蛋白丝与肌肉收缩
    • 1 肌纤维的结构
    • 2 肌原纤维由粗丝和细丝构成
  • 六、蛋白质结构与功能的进化
• 蛋白质的分离纯化和表征
  • 一、蛋白质的酸碱性质
  • 二、蛋白质的分子大小和形状
    • 1 根据化学组成测定最低相对分子质量
    • 2 渗透压法测定蛋白质的相对分子质量
    • 3 蛋白质的扩散和扩散系数
    • 4 沉降分析法测定蛋白质的相对分子质量
    • 5 凝胶过滤法测定蛋白质的相对分子质量
    • 6 SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳法测定蛋白质的相对分子质量
    • 7 蛋白质的分子形状
  • 三、蛋白质的胶体性质与蛋白质沉淀
    • 1 蛋白质的胶体性质
    • 2 蛋白质的沉淀
  • 四、蛋白质分离纯化的一般原则
  • 五、蛋白质的分离纯化方法
    • 1 根据分子大小不同的纯化方法
    • 2 利用溶解度差别的纯化方法
    • 3 根据电荷不同的纯化方法
    • 4 利用选择性吸附的纯化方法
    • 5 利用对配体的特异生物学亲和力的纯化方法
    • 6 高效液相层析和快速蛋白质液相层析
  • 六、蛋白质含量测定与纯度鉴定

氨基酸

• 一、氨基酸—蛋白质的构件分子
  • 1 蛋白质的水解
  • 2 α-氨基酸的一般结构
• 二、氨基酸的分类
  • 1 常见的蛋白质氨基酸
  • 2 不常见的蛋白质氨基酸
  • 3 非蛋白的氨基酸
• 三、氨基酸的酸碱化学
  • 1 氨基酸的碱性离子形式
  • 2 氨基酸的解离
  • 3 氨基酸的等电点
  • 4 氨基酸的甲醛滴定
• 四、氨基酸的化学反应
  • 1 α-氨基参加的反应
  • 2 α-羧基参加的反应
  • 3 α-氨基和α-羧基共同参加的反应
• 五、氨基酸的光学活性和光谱性质
  • 1 氨基酸的光学活性和立体化学
  • 2 氨基酸的光谱性质
• 六、氨基酸混合物的分析分离
  • 1 分配层析法的一般原理
  • 2 分配柱层析
  • 3 纸层析
  • 4 薄层层析
  • 5 离子交换层析
  • 6 气液层析
  • 7 高效液相层析
• 七、糖胺聚糖和蛋白聚糖
  • 1 糖胺聚糖
  • 2 蛋白聚糖