7.27 生信小TOP

这是一篇关于7.27 生信小TOP的思维导图，生信分析的一般流程和常用数据库、分析方法大纲。根据解螺旋课程整理。

沧海拾遗 （分子）

• 复杂之处
  • 分子类型多样
  • 分子数量庞大
  • 存在修饰形式
• 怎么找
  • 要么筛，要么猜； 有钱筛，没钱猜。
    • 预算充足，优选非编码RNA（mi、Inc、circRNA)
    • 预算紧凑，筛mRNA表达谱
    • 预算匮乏，转一下策“猜”
• 怎么筛
  • 通用起点
  • 水平：DNA、RNA、蛋白
    • DNA和RNA水平：芯片和二代测序
    • 蛋白水平：分离差异蛋白
      • 质谱技术
      • 代谢组学筛选分子
  • 平台：芯片、测序、质谱
    • 基因芯片，也叫生物芯片
      • 基本原理：杂交，碱基互补配对原则
      • 常规应用：检测DNA、RNA、蛋白质
    • 一代/二代测序
      • 一代：Sanger测序法
      • 二代：NGS测序法
    • 质谱
      • 原理：利用电场和磁场测量离子质荷比
      • 蛋白水平筛分子的套路
        • 第一步，把蛋白逐一给分离开
        • 第二步，就是对这个分开的蛋白有差异的进行鉴定