导图社区 蛋白质的结构与功能
重磅来袭!生物化学与分子生物学第一章蛋白质的结构与功能思维导图分享!下图详细介绍了蛋白质的分子组成、蛋白质结构与功能的关系两部分内容,并着重梳理了蛋白质分子结构的相关知识要点。如果对你有帮助的话,不妨收藏一下呀!
编辑于2019-09-05 06:26:54pr的结构与功能
pr的分子组成
L-α-aa是pr的基本结构单位
一般20种,除甘氨酸(Gly G)
按侧链结构和理化性质分类
只有20种aa参与pr的合成
非极性脂肪族aa(×7)
甘氨酸 Gly G 丙氨酸 Ala A 缬氨酸 Val V 亮氨酸 Leu L 异亮氨酸 Ile I
脯氨酸 Pro P 含亚氨基 甲硫氨酸(蛋氨酸) Met M 含硫甲基
极性中性aa(×5)
含羟基(-OH) 丝氨酸 Ser S 苏氨酸 Thr T
天冬酰胺 Asn N 谷氨酰胺 Gln Q
分别为天冬氨酸和谷氨酸胺化得到
半胱氨酸 Cys C 含巯基(-SH)
芳香族aa(×3)
苯丙氨基 Phe P(苯环)
酪氨酸 Tyr T(酚基)
色氨酸 Trp W(吲哚基)
酸性aa(×2)
天冬氨酸 Asp D 谷氨酸 Glu E
侧链均含有羧基
碱性aa(×3)
精氨酸 Arg R(胍基)
赖氨酸 Lys K
组氨酸 His H(咪唑基)
aa的理化性质
两性解离(等电点 pI)
aa解离成阳离子和阴离子的趋势及程度相等,成为兼性离子,呈电中性,此时溶液的pH称为该aa的等电点(pI)
没有等电点相同的aa
pH<pI aa带正电 pH>pI aa带负电
pI=½(pK.+pK..)
若一个aa有3个可解离基团,取兼性离子两边的pK的平均值
紫外吸收性质
含共轭双键
Trp>Tyr>Phe的最大吸收峰 在280nm
与茚三酮→蓝紫色化合物(△) 该物质最大吸收峰在570nm
aa很少发生化学反应
通过肽键连接形成pr或多肽
主链骨架:氨基N、α-C、羧基C
肽键(酰胺键)
前一个aa的α-羧基和后一个aa的α-氨基脱水缩合形成
有一定程度的双键性,不能自由旋转
寡肽:2-20个aa 多肽:20-50个aa
方向N→C
aa残基
肽链中的aa分子因脱水缩合而基团不全
生物活性肽
谷胱甘肽(GSH)
谷氨酸(Glu)+半胱氨酸(Cys)+甘氨酸(Gly)
巯基(-SH) 还原性
膜蛋白(尤其是红细胞) 酶蛋白
功能
1.保护巯基酶的活性 2.维持红细胞膜的稳定 3.解毒 4.参与氧化还原反应
多肽类激素及神经肽体
pr的分子结构
基本结构(一级结构)
聪哥N-端至C-端的aa排列顺序
主要化学键:肽键 所有二硫键的位置也属于该范畴
高级结构(空间构象)
二级结构
肽单位:参与肽键的6个原子α-C.、C、O、N、H、α-C..构成的平面
定义:指pr分子中某一段肽链的局部空间结构,即该段肽链主链骨架原子的相对空间位置,不涉及侧链
分类
α-螺旋
多肽链的主链围绕中心轴(假想)作有规律的螺旋式上升
有Pro时,则不能形成α-螺旋(因为不能形成氢键)
右手螺旋 顺时针
用右手,大拇指☞上升方向,四指☞螺旋方向 从下往上看,为顺时针
螺距为0.54nm
3.6个aa残基螺旋上升一圈
β-折叠
5--8个aa残基形成锯齿状,再平行排列
两个反平行肽段的间距为0.70nm
β-转角
180°回折 4个aa残基组成(第二个常为Pro)
Ω环(无规卷曲)
存在于球状pr
超二级结构
形式:αα、βαβ、ββ
模体(结构模体)
有特定功能的超二级结构
形式: α-螺旋-β-转角(或环)-α-螺旋 链-β-转角-链 链-β-转角-α-螺旋-β-转角-链
锌指结构→能与DNA或RNA结合 亮氨酸拉链→癌基因表达调控有关
三级结构
定义:整条肽链中全部aa残基的相对空间位置,即所有原子
肌红蛋白=血红素辅基+多肽链
A-H8个螺旋区 表面亲水侧链,分子内部为疏水侧链
疏水键(较主要)、盐键(离子键)、氢键、范德华力
可溶于水(pr溶于水才能发挥功能)
结构域
分子量较大的pr可折叠成多个结构比较紧密且稳定的区域,并各行其功能 并非所有pr的结构域都明显可分
100--200个aa残基
分子伴侣
四级结构
定义:各个亚基的空间排布及亚基接触部位的布局和相互作用
亚基:没有功能的三级结构
血红蛋白
化学键为离子键
4个亚基通过8个离子键相连
分类
根据组成
单纯pr(只含aa)
缀合pr/结合pr(pr+非pr)
非pr指辅基
根据形状
纤维状pr(多数为结构蛋白)
球状pr(多数为功能蛋白)
pr结构与功能的关系
主要功能
分布广、含量高、更新快
构成细胞和生物体结构、物质运输 催化、信息交流、免疫、氧化供能 维持酸碱平衡和正常的血浆渗透压
执行功能的主要方式
pr与小分子相互作用
pr与核酸的相互作用
pr与pr相互作用是主要方式
一级结构
一级结构是空间构象的基础
一级结构相似的pr具有相似的高级结构和功能
aa序列→生物进化
aa序列改变→疾病
分子病:因基因突变而导致pr分子发生变异的疾病
血红蛋白(Hb)与肌红蛋白(Mb)
pr的理化性质
两性电离
胶体性质
变性与复性
光吸收
测含量
分子量单位道尔顿 1kd=1千道尔顿 即分子量为1000
影响α-螺旋形成的因素 1.同性aa(尤其是同种电荷) 2.脯氨酸(Pro) 3.侧链大小(比较大的不能形成)
在折叠时,以α-C为转折点,以肽单元为基本单位进行旋转、折叠和扭曲形成不同的二级结构
每克样品含N克数×6.25×100 =100g样品中pr含量(g%)
6.25=1/16%