蛋白质结构与功能

生物化学、1.肽基呈刚性平面结构、2.肽基有极性：羰基氧带负电，氨基氮带正电、3.多数肽基为反式构象（Pro形成的肽键顺反式均有）

蛋白质结构与功能

• 四级结构
  • 球状亚单位缔结形成的有功能的聚集体：疏水相互作用、范德华力、氢键、离子键
  • 血红蛋白
    • 协同效应：T态、R态
    • 波尔效应：pH、CO2
    • 2,3-BPG
• 三级结构
  • 借助次级结构：疏水作用力、氢键、离子键、范德华力
  • 蛋白质变性
    • 物理因素
    • 化学因素
  • 肌红蛋白
• 二级结构
  • 测定：X射线衍射技术
  • 二面角
    • N-Cα=Φ
    • C-Cα=Ψ
  • α螺旋（3.6 13-螺旋）
    • 3.6个氨基酸
    • 螺距0.54nm
    • 相邻氨基酸轴距0.15nm
    • 右手螺旋
    • C=O和其后第四个N=H形成氢键
    • 氢键闭环包含13个原子
    • 特征二面角
      • Φ=-57°，Ψ=-48°
  • β折叠
    • 轴间距离0.35nm
    • 反平行更稳定
  • 非重复性二级结构
    • β转角
  • 超二级结构
    • αα、βαβ、ββ
    • 角蛋白
      • 2个右手α螺旋形成左手螺旋
    • 胶原蛋白
      • 3股左手螺旋拧成右手三螺旋
    • 丝心蛋白
      • β折叠
• 蛋白质测序
  • 直接测序法
    • 1.末端残基分析
      • N端
        • 氨肽酶
        • 桑格反应
        • 丹磺酰氯
        • Edman降解法
      • C端
        • 羧肽酶法
        • 肼解法
    • 2.多肽链分离（二硫键）
      • β-巯基乙醇
      • 二硫苏糖醇（DTT）
    • 3.氨基酸组分分析
      • 酸水解
      • 碱水解
    • 4.肽链专一裂解
      • 蛋白酶
      • 溴化氰（Met的羧基肽键）
    • 5.二硫键确定：对角线电泳分析
  • 串联质谱法
    • 质谱法
      • MALDI-TOF MS（基质辅助激光解吸离子化-飞行时间-质谱）
      • ESI-MS（电喷雾电离质谱）
• 一级结构
  • 肽基
    • 1.肽基呈刚性平面结构
    • 2.肽基有极性：羰基氧带负电，氨基氮带正电
    • 3.多数肽基为反式构象（Pro形成的肽键顺反式均有）
  • 寡肽
    • 谷胱甘肽（GSH）
    • 缬氨霉素