导图社区 王镜岩 生物化学 上册 11 核酸
王镜岩 生物化学 上册 第十一章 核酸,包括核苷酸结构组成、DNA的结构与功能、RNA的结构与功能、其他RNA的高级结构、原核生物和真核生物mRNA在结构上的不同 等知识点。
编辑于2022-07-22 17:04:55王镜岩 生物化学 上册 第十一章 核酸,包括核苷酸结构组成、DNA的结构与功能、RNA的结构与功能、其他RNA的高级结构、原核生物和真核生物mRNA在结构上的不同 等知识点。
王镜岩 生物化学 上册 第八章酶作用机制和酶活性调节,包括酶是生物催化剂、酶的化学本质及其组成、酶的命名和分类、六大类酶催化反应的性质、酶的专一性 、酶的活力测定、酶的分离纯化、核酶、抗体酶(abzyme)、酶工程等内容。
王镜岩 生物化学 上册 第九章 糖类,包括单糖、重要的单糖和单糖衍生物、寡糖、多糖、杂多糖、、细菌杂多糖 、糖蛋白及糖链 、 血型物质 等内容。
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王镜岩 生物化学 上册 第十一章 核酸,包括核苷酸结构组成、DNA的结构与功能、RNA的结构与功能、其他RNA的高级结构、原核生物和真核生物mRNA在结构上的不同 等知识点。
王镜岩 生物化学 上册 第八章酶作用机制和酶活性调节,包括酶是生物催化剂、酶的化学本质及其组成、酶的命名和分类、六大类酶催化反应的性质、酶的专一性 、酶的活力测定、酶的分离纯化、核酶、抗体酶(abzyme)、酶工程等内容。
王镜岩 生物化学 上册 第九章 糖类,包括单糖、重要的单糖和单糖衍生物、寡糖、多糖、杂多糖、、细菌杂多糖 、糖蛋白及糖链 、 血型物质 等内容。
第 十 一 章 核 酸
一、核苷酸
核苷
戊糖
:脱氧核糖 / 核糖
碱基
:A、T、G、C、U;
磷酸
(一)碱基
1、嘧啶碱:C、U、T;
✔️C为DNA和RNA共有,而T只存在于DNA和部分tRNA中,U只存在于RNA中。
2、嘌呤碱:A、G;
✔️嘌呤是由母体化合物嘌呤衍生而来。
3、稀有碱基
✔️ tRNA中稀有碱基较多,可高达10%。
(二)核苷
⭐️ 核苷:戊糖和碱基通过糖苷键连接而成糖苷。
● 核酸分子中的糖苷键均为 β-糖苷键。
✔️ 糖苷键是由戊糖上C1与嘌呤碱N9或嘧啶碱N1上的氢原子经脱水缩合而成。
分类
核糖核苷
脱氧核糖核苷
稀有核苷
:由稀有碱基形成的核苷称为稀有核苷,如假尿嘧啶核苷(ψ)、次黄嘌呤核苷。
🔺 核苷也能被修饰,主要是甲基化。tRNA和rRNA中还有少量的假尿嘧啶核苷。
(三)核苷酸
⭐️ 生物体内游离存在的核苷酸多是5‘-核苷酸。碱水解RNA时可得到2‘和3’-核苷酸的混合物。
· 核苷酸是核苷的磷酸脂。
(四)核苷酸衍生物
⭐️ 腺苷三磷酸(ATP)
⭐️ cAMP与cGMP是两种重要的第二信使。(分别由腺苷酸环化酶、鸟苷酸环化酶催化)
(五)核苷酸的聚合物
核酸分子中的共价键 → 核酸分子中核苷酸之间以 3 ′ -5 ′磷酸二酯键共价相连。
· 牛胰磷酸二酯酶从DNA、RNA的5‘端逐个水解5’-磷酯键,水解产物为3‘-核苷酸; 蛇毒磷酸二酯酶从DNA、RNA的3‘端逐个水解磷酸二酯键,得到5’-核苷酸。
二、DNA的结构与功能
(一)DNA的一级结构
⭐️ 概念:DNA分子中4脱氧核苷酸(dAMP、dGMP、dCMP、dTMP)之间的连接方式(3 ́-5 ́磷酸二酯键)和排列顺序叫做DNA的一级结构,简称为碱基序列;
● 一级结构的走向的规定为5 ́→3 ́;
● 不同的DNA分子具有不同的核苷酸排列顺序,因此携带有不同的遗传信息。
(二)DNA的双螺旋结构
1、DNA碱基组成的Chargaff规则:
① A=T、G=C
② A+C=G+T、A+G=C+T。
🌟 2、DNA分子双螺旋结构模型:【W-C DNA 分子双螺旋结构模型】
💡 DNA结构的平均特征
(1)两条反向平行的多聚核苷酸链沿一个中心轴相互缠绕,两条链均为右手螺旋。
(2)碱基位于双螺旋内侧,核酸与核糖在外侧,彼此通过3',5'-磷酸二酯键相连接,形成DNA分子骨架。碱基平面与纵轴重直,糖环平面与纵轴平行。多核苷酸链方向3→5'为再正向,形成一条大沟和一条小沟。
(3)双螺旋平均直径为2nm,两个相邻碱基对之间相距高度为0. 34nm,两核苷酸之间夹角为36 º,沿中心轴每旋转一周有10个核苷酸,每一转的高度(螺距)为3. 4nm.
(4)两条链被碱基之间形成的氢键连成一体,互相匹配,A与T配对,形成两个氢键,G与C配对,形成三个氢键。
(5)碱基在一条链上的排列顺序不受任何限制,一条链序列确定后则决定另一条互补链序列。遗传信息由碱基序列所携带。
★DNA双螺旋结构的稳定因素❗️❗️❗️
⭐️ 最主要的是:① 碱基堆集力(范德华力、疏水作用) ② 氢键 ③磷酸基上负电荷被胞内组蛋白或正离子中和。
⭐️ 碱基堆积力:所谓的碱基堆积力就是指在DNA的双螺旋结构中,碱基对平面垂直于中心轴,层叠与双螺旋内侧,相邻疏水性碱基在旋进中彼此堆积在一起相互吸引形成的作用力。是稳定DNA 双螺旋结构的主要次级键之一。
·3、 Dickerson对DNA双螺旋模型的修正:每螺旋10.4个碱基,两碱基夹角不是36度,而是28-42度不等,其它参数也因序列不同而有变化; 组成碱基对的两个碱基的分布并非在同一平面上,而是沿长轴旋转一定角度,从而使碱基对的形状像螺旋奖叶片的样子,故称为螺旋桨状扭典,这种结构可提高碱基堆积力,使DNA结构更稳定。
4、DNA 结构可受环境条件的影响而改变。
A、B、C、D、E、Z;
1️⃣ B型DNA:为W-C双螺旋结构,DNA钠盐在较高湿度下(92%)制得的纤维结构。
2️⃣ A型DNA:螺体较宽而短,碱基倾角大些,大沟明显超过小沟;B型适中:(70%湿度下获得) ● RNA分子双螺旋区及RNA-DNA杂交双链具有与A-DNA相似的结构;
3️⃣ Z型DNA:【左手螺旋】 ⚠️ DNA甲基化可使大沟表面暴露的胞嘧啶变为5-甲基胞嘧啶,可导致B-DAN向Z-DNA转化,这种变构效应推测与基因表达调节有关。
🌸 Z-DNA结构:
1、两条多核苷酸链反向平行呈左手螺旋.
2、碱基位于分子轴外侧,构成了分子的凸面。
3.核糖、磷酸骨架链走向呈Z字形.
4、DNA双螺旋体细长.
5、外侧大沟消失等。
6、Z型序列必含鸟嘌呤,并且嘌呤碱和嘧啶碱交替出现。
如:· 人工合成的d(CGCGCG)寡聚体;
(三)DNA分子的三股螺旋
DNA三螺旋(H-DNA):出现在多嘧啶、嘌呤的情况下,形成三链DNA,并形成三螺旋体。
☆☆ Hoosgteen 模型:即第三个碱基以A或T与A=T碱基对中的A配对;G或C与G=C碱基对中的G配对,第三个碱基C必须质子化,以提供与G的N7结合的氢键供体,并且它与G配对只形成两个氢键。
铰链DNA:是一种分子内折叠形成的三股螺旋。
H-回文结构:当DNA的一段多聚嘧啶核苷酸或多聚嘌呤核苷酸组成镜像重复,即可回折产生H-DNA,该重复序列又称为H回文结构。
⭐️ 碱基堆积力与回文结构:
💡 碱基堆积力:每个碱基对平行伸展并且与上面的和下面的碱基对非常靠近,这一现象叫做碱基堆积。碱基堆积力是指在DNA双螺旋结构中,碱基对平面垂直于中心轴,层叠于双螺旋的内侧,相邻疏水性碱基在旋进中彼此堆积在一起相互吸引形成的作用力,维持DNA双螺旋结构的稳定的力主要是碱基堆积力。
💡 回文结构:DNA序列中,以某一中心区域为对称轴,其两侧的碱基对顺序正读和反读都相同,即对称轴一侧的片段旋转180°后,与另一侧片段对称重复。
DNA分子的四股螺旋
只见于富含G的区域。
(四)DNA的超螺旋
🔺 DNA的三级结构:主要是超螺旋,是在二级结构基础上,通过扭曲和折叠所形成的特定构象,其中包括单链与双链、双螺旋与双螺旋的相互作用,以及一些具有拓扑学特征的结构。
✔️DNA的三级结构:主要形式为超螺旋,生物体内最常见的超螺旋为负超螺旋,其螺旋方向与双螺旋方向相反,即左手超螺旋。
· 对于环状分子而言,有其拓扑学上特定规律L=T+W.L表连环数,T表扭转数,W表超螺旋数。
(五)DNA贮存遗传信息
1、DNA是染色体的主要成分 ;2、DNA是细菌的转化因子 ;3、DAN是病毒遗传信息的载体;
(六)DNA与Pro 复合物的结构
1.病毒颗粒有蛋白质和核酸构成,有些还含脂质糖类。噬菌体是以细菌和放线菌为宿主的病毒。
2. 细菌的拟核:细菌的DNA并非完全散开,其DNA主要通过与碱性蛋白结合,形成凸环而组装成,而是在细胞内紧密缠绕形成致密的小体。
细菌细胞具有原始的核,没有核膜,更没有核仁,结构简单,为了与真核细胞中典型的细胞核有所区别。
3. 真核生物的染色体染色质指间期细胞内由DNA、组蛋白、非组蛋白及少量RNA组成的线性复合结构,是间期细胞遗传物质存在的形式。 ⭐️ 染色体基本结构单位是核小体,核心由组蛋白H2A,H2B,H3和H4各2分子组成八聚体:
🌸 DNA 高级结构形成: DNA(直径2nm) ↓ 盘绕组蛋白八聚体上,结合H1,压缩比1/7 核小体(一级结构) ↓ 螺旋化,压缩比1/6 螺线管(二级结构) ↓ 再螺旋化,压缩比1/40 超螺线管(三级结构) ↓ 折叠,压缩比1/5 染色单体(四级结构)
DNA的功能:作为生物遗传信息复制的模版核基因转录的模版,是生命遗传物质的物质基础和个体生命活动的基础。
三、RNA的结构与功能
(一)RNA的一级结构
⭐️ 定义:RNA分子中各核苷之间的连接方式(3 ́-5 ́磷酸二酯键)和排列顺序叫做 RNA的一级结构。
RNA的结构一般以单链形式存在,在局部可形成双螺旋结构,成茎环或发夹结构。
· 参与生物合成的三类RNA:tRNA、rRNA、mRNA。
⭐️ mRNA的一级结构:
✔️1、真核mRNA的一级结构:单顺反子,有5‘帽子、5’非翻译区、编码区、3‘非翻译区、3’多聚腺苷酸(poly A);
✔️2、原核生物mRNA是多顺反子,由先导区、插入序列、翻译区和末端序列组成,没有5‘帽子和3’polyA尾。
(二)RNA的高级结构
☆ 除tANA外,几乎所有RNA都与蛋自质形成和蛋自复合物,其复合物承担着重要的细胞功能,如核糖体,信息体,信号识别颗粒,拼接体,编辑体等。
⭐️ tRNA的高级结构:
· tRNA的高级结构约占RNA总量的15%,由核内形成并迅速加工后进入细胞质。主要功能是转运氨基酸。每一种氨基酸可有一种以上的tRNA,细胞内一般有50种以上不同的tRNA。
🔺功能:参与Pro生物合成,起着转运AA和识别密码子的作用。
tRNA的二级结构
🛎特征:
单链(3'端都为CCA-OH,5'端都为pG.)
三叶草形态
一臂四环:氨基酸臂、T ψ C环(胸苷-假尿苷-胞苷环)、额外环、反密码子环、DHU环(二氢尿嘧啶环)。
✔️氨基酸臂:3'端都为CCA-OH,可接受活化的氨基酸;
✔️反密码子环:由7个AA 组成,中间三个aa为反密码子,可识别mRNA上的密码子。
· T ψ C环:与核糖体的结合有关。
· DHU环:与氨酰-tRNA合成酶的结合有关。
tRNA的三级结构
特征:
在二级结构基础上进一步折叠扭曲形成倒L型。
tRNA中几乎所有相邻碱基通过疏水作用相互堆积。
· tRNA含大量修饰核苷酸,可能参与三级结构的形成,也增加了tRNA的识别功能。
⭐️ rRNA 的高级结构:
· 功能rRNA占细胞RNA总量的80%,是组成核糖体的主要成分,核糖体催化肽键合成的是rRNA,蛋白质只是起到维持rRNA构象起协助作用。
· rRNA的二级结构可形成颈环结构;rRNA的二级结构折叠形成三级结构。
🛎 特征:
单链,螺旋化程度较tRNA低
与蛋白质组成核糖体后方能发挥其功能
核糖体: (rRNA + Pro)
大亚基
含有肽基转移酶,可催化Pro肽键的合成。 (大亚基rRNA实际是一种核酶)
小亚基
核糖体解码中心位于小亚基上,解码是小亚基rRNA的功能。
四、RNA的功能
五、其他RNA的高级结构
功能mRNA约占细胞总RNA的3%~5%,代谢活跃,寿命较短,是蛋白质生物合成的模游离的mRNA 常会形成高级结构BNA一般都与蛋白质形成复合物,而且总是以RNA-蛋白质复合物的形式执行功能。
六、原核生物和真核生物mRNA在结构上的不同;
1)原核生物的mRNA是多顺反子的,真核生物的mRNA是单顺反子。
2)原核生物mRNA5'端无帽子结构,真核生物mRNA5'端有帽子结构。
3)原核生物mRNA3'端无多聚腺苷酸,真核生物mRNA3'端有一段长达200个腺苷酸(polyA尾)构成的聚腺苷酸,称为“尾巴结构”。
第 十 一 章 核 酸
一、核苷酸
核苷
戊糖
:脱氧核糖 / 核糖
碱基
:A、T、G、C、U;
磷酸
(一)碱基
1、嘧啶碱:C、U、T;
✔️C为DNA和RNA共有,而T只存在于DNA和部分tRNA中,U只存在于RNA中。
2、嘌呤碱:A、G;
✔️嘌呤是由母体化合物嘌呤衍生而来。
3、稀有碱基
✔️ tRNA中稀有碱基较多,可高达10%。
(二)核苷
⭐️ 核苷:戊糖和碱基通过糖苷键连接而成糖苷。
● 核酸分子中的糖苷键均为 β-糖苷键。
✔️ 糖苷键是由戊糖上C1与嘌呤碱N9或嘧啶碱N1上的氢原子经脱水缩合而成。
分类
核糖核苷
脱氧核糖核苷
稀有核苷
:由稀有碱基形成的核苷称为稀有核苷,如假尿嘧啶核苷(ψ)、次黄嘌呤核苷。
🔺 核苷也能被修饰,主要是甲基化。tRNA和rRNA中还有少量的假尿嘧啶核苷。
(三)核苷酸
⭐️ 生物体内游离存在的核苷酸多是5‘-核苷酸。碱水解RNA时可得到2‘和3’-核苷酸的混合物。
· 核苷酸是核苷的磷酸脂。
(四)核苷酸衍生物
⭐️ 腺苷三磷酸(ATP)
⭐️ cAMP与cGMP是两种重要的第二信使。(分别由腺苷酸环化酶、鸟苷酸环化酶催化)
(五)核苷酸的聚合物
核酸分子中的共价键 → 核酸分子中核苷酸之间以 3 ′ -5 ′磷酸二酯键共价相连。
· 牛胰磷酸二酯酶从DNA、RNA的5‘端逐个水解5’-磷酯键,水解产物为3‘-核苷酸; 蛇毒磷酸二酯酶从DNA、RNA的3‘端逐个水解磷酸二酯键,得到5’-核苷酸。
二、DNA的结构与功能
(一)DNA的一级结构
⭐️ 概念:DNA分子中4脱氧核苷酸(dAMP、dGMP、dCMP、dTMP)之间的连接方式(3 ́-5 ́磷酸二酯键)和排列顺序叫做DNA的一级结构,简称为碱基序列;
● 一级结构的走向的规定为5 ́→3 ́;
● 不同的DNA分子具有不同的核苷酸排列顺序,因此携带有不同的遗传信息。
(二)DNA的双螺旋结构
1、DNA碱基组成的Chargaff规则:
① A=T、G=C
② A+C=G+T、A+G=C+T。
🌟 2、DNA分子双螺旋结构模型:【W-C DNA 分子双螺旋结构模型】
💡 DNA结构的平均特征
(1)两条反向平行的多聚核苷酸链沿一个中心轴相互缠绕,两条链均为右手螺旋。
(2)碱基位于双螺旋内侧,核酸与核糖在外侧,彼此通过3',5'-磷酸二酯键相连接,形成DNA分子骨架。碱基平面与纵轴重直,糖环平面与纵轴平行。多核苷酸链方向3→5'为再正向,形成一条大沟和一条小沟。
(3)双螺旋平均直径为2nm,两个相邻碱基对之间相距高度为0. 34nm,两核苷酸之间夹角为36 º,沿中心轴每旋转一周有10个核苷酸,每一转的高度(螺距)为3. 4nm.
(4)两条链被碱基之间形成的氢键连成一体,互相匹配,A与T配对,形成两个氢键,G与C配对,形成三个氢键。
(5)碱基在一条链上的排列顺序不受任何限制,一条链序列确定后则决定另一条互补链序列。遗传信息由碱基序列所携带。
★DNA双螺旋结构的稳定因素❗️❗️❗️
⭐️ 最主要的是:① 碱基堆集力(范德华力、疏水作用) ② 氢键 ③磷酸基上负电荷被胞内组蛋白或正离子中和。
⭐️ 碱基堆积力:所谓的碱基堆积力就是指在DNA的双螺旋结构中,碱基对平面垂直于中心轴,层叠与双螺旋内侧,相邻疏水性碱基在旋进中彼此堆积在一起相互吸引形成的作用力。是稳定DNA 双螺旋结构的主要次级键之一。
·3、 Dickerson对DNA双螺旋模型的修正:每螺旋10.4个碱基,两碱基夹角不是36度,而是28-42度不等,其它参数也因序列不同而有变化; 组成碱基对的两个碱基的分布并非在同一平面上,而是沿长轴旋转一定角度,从而使碱基对的形状像螺旋奖叶片的样子,故称为螺旋桨状扭典,这种结构可提高碱基堆积力,使DNA结构更稳定。
4、DNA 结构可受环境条件的影响而改变。
A、B、C、D、E、Z;
1️⃣ B型DNA:为W-C双螺旋结构,DNA钠盐在较高湿度下(92%)制得的纤维结构。
2️⃣ A型DNA:螺体较宽而短,碱基倾角大些,大沟明显超过小沟;B型适中:(70%湿度下获得) ● RNA分子双螺旋区及RNA-DNA杂交双链具有与A-DNA相似的结构;
3️⃣ Z型DNA:【左手螺旋】 ⚠️ DNA甲基化可使大沟表面暴露的胞嘧啶变为5-甲基胞嘧啶,可导致B-DAN向Z-DNA转化,这种变构效应推测与基因表达调节有关。
🌸 Z-DNA结构:
1、两条多核苷酸链反向平行呈左手螺旋.
2、碱基位于分子轴外侧,构成了分子的凸面。
3.核糖、磷酸骨架链走向呈Z字形.
4、DNA双螺旋体细长.
5、外侧大沟消失等。
6、Z型序列必含鸟嘌呤,并且嘌呤碱和嘧啶碱交替出现。
如:· 人工合成的d(CGCGCG)寡聚体;
(三)DNA分子的三股螺旋
DNA三螺旋(H-DNA):出现在多嘧啶、嘌呤的情况下,形成三链DNA,并形成三螺旋体。
☆☆ Hoosgteen 模型:即第三个碱基以A或T与A=T碱基对中的A配对;G或C与G=C碱基对中的G配对,第三个碱基C必须质子化,以提供与G的N7结合的氢键供体,并且它与G配对只形成两个氢键。
铰链DNA:是一种分子内折叠形成的三股螺旋。
H-回文结构:当DNA的一段多聚嘧啶核苷酸或多聚嘌呤核苷酸组成镜像重复,即可回折产生H-DNA,该重复序列又称为H回文结构。
⭐️ 碱基堆积力与回文结构:
💡 碱基堆积力:每个碱基对平行伸展并且与上面的和下面的碱基对非常靠近,这一现象叫做碱基堆积。碱基堆积力是指在DNA双螺旋结构中,碱基对平面垂直于中心轴,层叠于双螺旋的内侧,相邻疏水性碱基在旋进中彼此堆积在一起相互吸引形成的作用力,维持DNA双螺旋结构的稳定的力主要是碱基堆积力。
回文结构:DNA序列中,以某一中心区域为对称轴,其两侧的碱基对顺序正读和反读都相同,即对称轴一侧的片段旋转180°后,与另一侧片段对称重复。
DNA分子的四股螺旋
只见于富含G的区域。
(四)DNA的超螺旋
🔺 DNA的三级结构:主要是超螺旋,是在二级结构基础上,通过扭曲和折叠所形成的特定构象,其中包括单链与双链、双螺旋与双螺旋的相互作用,以及一些具有拓扑学特征的结构。
✔️DNA的三级结构:主要形式为超螺旋,生物体内最常见的超螺旋为负超螺旋,其螺旋方向与双螺旋方向相反,即左手超螺旋。
· 对于环状分子而言,有其拓扑学上特定规律L=T+W.L表连环数,T表扭转数,W表超螺旋数。
(五)DNA贮存遗传信息
1、DNA是染色体的主要成分 ;2、DNA是细菌的转化因子 ;3、DAN是病毒遗传信息的载体;
(六)DNA与Pro 复合物的结构
1.病毒颗粒有蛋白质和核酸构成,有些还含脂质糖类。噬菌体是以细菌和放线菌为宿主的病毒。
2. 细菌的拟核:细菌的DNA并非完全散开,其DNA主要通过与碱性蛋白结合,形成凸环而组装成,而是在细胞内紧密缠绕形成致密的小体。
细菌细胞具有原始的核,没有核膜,更没有核仁,结构简单,为了与真核细胞中典型的细胞核有所区别。
3. 真核生物的染色体染色质指间期细胞内由DNA、组蛋白、非组蛋白及少量RNA组成的线性复合结构,是间期细胞遗传物质存在的形式。 ⭐️ 染色体基本结构单位是核小体,核心由组蛋白H2A,H2B,H3和H4各2分子组成八聚体:
🌸 DNA 高级结构形成: DNA(直径2nm) ↓ 盘绕组蛋白八聚体上,结合H1,压缩比1/7 核小体(一级结构) ↓ 螺旋化,压缩比1/6 螺线管(二级结构) ↓ 再螺旋化,压缩比1/40 超螺线管(三级结构) ↓ 折叠,压缩比1/5 染色单体(四级结构)
DNA的功能:作为生物遗传信息复制的模版核基因转录的模版,是生命遗传物质的物质基础和个体生命活动的基础。
三、RNA的结构与功能
(一)RNA的一级结构
⭐️ 定义:RNA分子中各核苷之间的连接方式(3 ́-5 ́磷酸二酯键)和排列顺序叫做 RNA的一级结构。
RNA的结构一般以单链形式存在,在局部可形成双螺旋结构,成茎环或发夹结构。
· 参与生物合成的三类RNA:tRNA、rRNA、mRNA。
⭐️ mRNA的一级结构:
✔️1、真核mRNA的一级结构:单顺反子,有5‘帽子、5’非翻译区、编码区、3‘非翻译区、3’多聚腺苷酸(poly A);
✔️2、原核生物mRNA是多顺反子,由先导区、插入序列、翻译区和末端序列组成,没有5‘帽子和3’polyA尾。
(二)RNA的高级结构
☆ 除tANA外,几乎所有RNA都与蛋自质形成和蛋自复合物,其复合物承担着重要的细胞功能,如核糖体,信息体,信号识别颗粒,拼接体,编辑体等。
⭐️ tRNA的高级结构:
· tRNA的高级结构约占RNA总量的15%,由核内形成并迅速加工后进入细胞质。主要功能是转运氨基酸。每一种氨基酸可有一种以上的tRNA,细胞内一般有50种以上不同的tRNA。
🔺功能:参与Pro生物合成,起着转运AA和识别密码子的作用。
tRNA的二级结构
🛎特征:
单链(3'端都为CCA-OH,5'端都为pG.)
三叶草形态
一臂四环:氨基酸臂、T ψ C环(胸苷-假尿苷-胞苷环)、额外环、反密码子环、DHU环(二氢尿嘧啶环)。
✔️氨基酸臂:3'端都为CCA-OH,可接受活化的氨基酸;
✔️反密码子环:由7个AA 组成,中间三个aa为反密码子,可识别mRNA上的密码子。
· T ψ C环:与核糖体的结合有关。
· DHU环:与氨酰-tRNA合成酶的结合有关。
tRNA的三级结构
特征:
在二级结构基础上进一步折叠扭曲形成倒L型。
tRNA中几乎所有相邻碱基通过疏水作用相互堆积。
· tRNA含大量修饰核苷酸,可能参与三级结构的形成,也增加了tRNA的识别功能。
⭐️ rRNA 的高级结构:
· 功能rRNA占细胞RNA总量的80%,是组成核糖体的主要成分,核糖体催化肽键合成的是rRNA,蛋白质只是起到维持rRNA构象起协助作用。
· rRNA的二级结构可形成颈环结构;rRNA的二级结构折叠形成三级结构。
🛎 特征:
单链,螺旋化程度较tRNA低
与蛋白质组成核糖体后方能发挥其功能
核糖体: (rRNA + Pro)
大亚基
含有肽基转移酶,可催化Pro肽键的合成。 (大亚基rRNA实际是一种核酶)
小亚基
核糖体解码中心位于小亚基上,解码是小亚基rRNA的功能。
四、RNA的功能
五、其他RNA的高级结构
功能mRNA约占细胞总RNA的3%~5%,代谢活跃,寿命较短,是蛋白质生物合成的模游离的mRNA 常会形成高级结构BNA一般都与蛋白质形成复合物,而且总是以RNA-蛋白质复合物的形式执行功能。
六、原核生物和真核生物mRNA在结构上的不同;
1)原核生物的mRNA是多顺反子的,真核生物的mRNA是单顺反子。
2)原核生物mRNA5'端无帽子结构,真核生物mRNA5'端有帽子结构。
3)原核生物mRNA3'端无多聚腺苷酸,真核生物mRNA3'端有一段长达200个腺苷酸(polyA尾)构成的聚腺苷酸,称为“尾巴结构”。
第 十 一 章 核 酸
一、核苷酸
核苷
戊糖
:脱氧核糖 / 核糖
碱基
:A、T、G、C、U;
磷酸
(一)碱基
1、嘧啶碱:C、U、T;
✔️C为DNA和RNA共有,而T只存在于DNA和部分tRNA中,U只存在于RNA中。
2、嘌呤碱:A、G;
✔️嘌呤是由母体化合物嘌呤衍生而来。
3、稀有碱基
✔️ tRNA中稀有碱基较多,可高达10%。
(二)核苷
⭐️ 核苷:戊糖和碱基通过糖苷键连接而成糖苷。
● 核酸分子中的糖苷键均为 β-糖苷键。
✔️ 糖苷键是由戊糖上C1与嘌呤碱N9或嘧啶碱N1上的氢原子经脱水缩合而成。
分类
核糖核苷
脱氧核糖核苷
稀有核苷
:由稀有碱基形成的核苷称为稀有核苷,如假尿嘧啶核苷(ψ)、次黄嘌呤核苷。
🔺 核苷也能被修饰,主要是甲基化。tRNA和rRNA中还有少量的假尿嘧啶核苷。
(三)核苷酸
⭐️ 生物体内游离存在的核苷酸多是5‘-核苷酸。碱水解RNA时可得到2‘和3’-核苷酸的混合物。
· 核苷酸是核苷的磷酸脂。
(四)核苷酸衍生物
⭐️ 腺苷三磷酸(ATP)
⭐️ cAMP与cGMP是两种重要的第二信使。(分别由腺苷酸环化酶、鸟苷酸环化酶催化)
(五)核苷酸的聚合物
核酸分子中的共价键 → 核酸分子中核苷酸之间以 3 ′ -5 ′磷酸二酯键共价相连。
· 牛胰磷酸二酯酶从DNA、RNA的5‘端逐个水解5’-磷酯键,水解产物为3‘-核苷酸; 蛇毒磷酸二酯酶从DNA、RNA的3‘端逐个水解磷酸二酯键,得到5’-核苷酸。
二、DNA的结构与功能
第 十 一 章 核 酸
(一)DNA的一级结构
⭐️ 概念:DNA分子中4脱氧核苷酸(dAMP、dGMP、dCMP、dTMP)之间的连接方式(3 ́-5 ́磷酸二酯键)和排列顺序叫做DNA的一级结构,简称为碱基序列;
● 一级结构的走向的规定为5 ́→3 ́;
● 不同的DNA分子具有不同的核苷酸排列顺序,因此携带有不同的遗传信息。
(二)DNA的双螺旋结构
1、DNA碱基组成的Chargaff规则:
① A=T、G=C
② A+C=G+T、A+G=C+T。
🌟 2、DNA分子双螺旋结构模型:【W-C DNA 分子双螺旋结构模型】
💡 DNA结构的平均特征
(1)两条反向平行的多聚核苷酸链沿一个中心轴相互缠绕,两条链均为右手螺旋。
(2)碱基位于双螺旋内侧,核酸与核糖在外侧,彼此通过3',5'-磷酸二酯键相连接,形成DNA分子骨架。碱基平面与纵轴重直,糖环平面与纵轴平行。多核苷酸链方向3→5'为再正向,形成一条大沟和一条小沟。
(3)双螺旋平均直径为2nm,两个相邻碱基对之间相距高度为0. 34nm,两核苷酸之间夹角为36 º,沿中心轴每旋转一周有10个核苷酸,每一转的高度(螺距)为3. 4nm.
(4)两条链被碱基之间形成的氢键连成一体,互相匹配,A与T配对,形成两个氢键,G与C配对,形成三个氢键。
(5)碱基在一条链上的排列顺序不受任何限制,一条链序列确定后则决定另一条互补链序列。遗传信息由碱基序列所携带。
★DNA双螺旋结构的稳定因素❗️❗️❗️
⭐️ 最主要的是:① 碱基堆集力(范德华力、疏水作用) ② 氢键 ③磷酸基上负电荷被胞内组蛋白或正离子中和。
⭐️ 碱基堆积力:所谓的碱基堆积力就是指在DNA的双螺旋结构中,碱基对平面垂直于中心轴,层叠与双螺旋内侧,相邻疏水性碱基在旋进中彼此堆积在一起相互吸引形成的作用力。是稳定DNA 双螺旋结构的主要次级键之一。
·3、 Dickerson对DNA双螺旋模型的修正:每螺旋10.4个碱基,两碱基夹角不是36度,而是28-42度不等,其它参数也因序列不同而有变化; 组成碱基对的两个碱基的分布并非在同一平面上,而是沿长轴旋转一定角度,从而使碱基对的形状像螺旋奖叶片的样子,故称为螺旋桨状扭典,这种结构可提高碱基堆积力,使DNA结构更稳定。
4、DNA 结构可受环境条件的影响而改变。
A、B、C、D、E、Z;
1️⃣ B型DNA:为W-C双螺旋结构,DNA钠盐在较高湿度下(92%)制得的纤维结构。
2️⃣ A型DNA:螺体较宽而短,碱基倾角大些,大沟明显超过小沟;B型适中:(70%湿度下获得) ● RNA分子双螺旋区及RNA-DNA杂交双链具有与A-DNA相似的结构;
3️⃣ Z型DNA:【左手螺旋】 ⚠️ DNA甲基化可使大沟表面暴露的胞嘧啶变为5-甲基胞嘧啶,可导致B-DAN向Z-DNA转化,这种变构效应推测与基因表达调节有关。
🌸 Z-DNA结构:
1、两条多核苷酸链反向平行呈左手螺旋.
2、碱基位于分子轴外侧,构成了分子的凸面。
3.核糖、磷酸骨架链走向呈Z字形.
4、DNA双螺旋体细长.
5、外侧大沟消失等。
6、Z型序列必含鸟嘌呤,并且嘌呤碱和嘧啶碱交替出现。
如:· 人工合成的d(CGCGCG)寡聚体;
(三)DNA分子的三股螺旋
DNA三螺旋(H-DNA):出现在多嘧啶、嘌呤的情况下,形成三链DNA,并形成三螺旋体。
☆☆ Hoosgteen 模型:即第三个碱基以A或T与A=T碱基对中的A配对;G或C与G=C碱基对中的G配对,第三个碱基C必须质子化,以提供与G的N7结合的氢键供体,并且它与G配对只形成两个氢键。
铰链DNA:是一种分子内折叠形成的三股螺旋。
H-回文结构:当DNA的一段多聚嘧啶核苷酸或多聚嘌呤核苷酸组成镜像重复,即可回折产生H-DNA,该重复序列又称为H回文结构。
第 十 一 章 核 酸
(三)DNA分子的三股螺旋
⭐️ 碱基堆积力与回文结构:
💡 碱基堆积力:每个碱基对平行伸展并且与上面的和下面的碱基对非常靠近,这一现象叫做碱基堆积。碱基堆积力是指在DNA双螺旋结构中,碱基对平面垂直于中心轴,层叠于双螺旋的内侧,相邻疏水性碱基在旋进中彼此堆积在一起相互吸引形成的作用力,维持DNA双螺旋结构的稳定的力主要是碱基堆积力。
回文结构:DNA序列中,以某一中心区域为对称轴,其两侧的碱基对顺序正读和反读都相同,即对称轴一侧的片段旋转180°后,与另一侧片段对称重复。
DNA分子的四股螺旋
只见于富含G的区域。
(四)DNA的超螺旋
🔺 DNA的三级结构:主要是超螺旋,是在二级结构基础上,通过扭曲和折叠所形成的特定构象,其中包括单链与双链、双螺旋与双螺旋的相互作用,以及一些具有拓扑学特征的结构。
✔️DNA的三级结构:主要形式为超螺旋,生物体内最常见的超螺旋为负超螺旋,其螺旋方向与双螺旋方向相反,即左手超螺旋。
· 对于环状分子而言,有其拓扑学上特定规律L=T+W.L表连环数,T表扭转数,W表超螺旋数。
(五)DNA贮存遗传信息
1、DNA是染色体的主要成分 ;2、DNA是细菌的转化因子 ;3、DAN是病毒遗传信息的载体;
(六)DNA与Pro 复合物的结构
1.病毒颗粒有蛋白质和核酸构成,有些还含脂质糖类。噬菌体是以细菌和放线菌为宿主的病毒。
2. 细菌的拟核:细菌的DNA并非完全散开,其DNA主要通过与碱性蛋白结合,形成凸环而组装成,而是在细胞内紧密缠绕形成致密的小体。
细菌细胞具有原始的核,没有核膜,更没有核仁,结构简单,为了与真核细胞中典型的细胞核有所区别。
3. 真核生物的染色体染色质指间期细胞内由DNA、组蛋白、非组蛋白及少量RNA组成的线性复合结构,是间期细胞遗传物质存在的形式。 ⭐️ 染色体基本结构单位是核小体,核心由组蛋白H2A,H2B,H3和H4各2分子组成八聚体:
🌸 DNA 高级结构形成: DNA(直径2nm) ↓ 盘绕组蛋白八聚体上,结合H1,压缩比1/7 核小体(一级结构) ↓ 螺旋化,压缩比1/6 螺线管(二级结构) ↓ 再螺旋化,压缩比1/40 超螺线管(三级结构) ↓ 折叠,压缩比1/5 染色单体(四级结构)
DNA的功能:作为生物遗传信息复制的模版核基因转录的模版,是生命遗传物质的物质基础和个体生命活动的基础。
三、RNA的结构与功能
(一)RNA的一级结构
⭐️ 定义:RNA分子中各核苷之间的连接方式(3 ́-5 ́磷酸二酯键)和排列顺序叫做 RNA的一级结构。
RNA的结构一般以单链形式存在,在局部可形成双螺旋结构,成茎环或发夹结构。
· 参与生物合成的三类RNA:tRNA、rRNA、mRNA。
⭐️ mRNA的一级结构:
✔️1、真核mRNA的一级结构:单顺反子,有5‘帽子、5’非翻译区、编码区、3‘非翻译区、3’多聚腺苷酸(poly A);
✔️2、原核生物mRNA是多顺反子,由先导区、插入序列、翻译区和末端序列组成,没有5‘帽子和3’polyA尾。
第 十 一 章 核 酸
(二)RNA的高级结构
☆ 除tANA外,几乎所有RNA都与蛋自质形成和蛋自复合物,其复合物承担着重要的细胞功能,如核糖体,信息体,信号识别颗粒,拼接体,编辑体等。
⭐️ tRNA的高级结构:
· tRNA的高级结构约占RNA总量的15%,由核内形成并迅速加工后进入细胞质。主要功能是转运氨基酸。每一种氨基酸可有一种以上的tRNA,细胞内一般有50种以上不同的tRNA。
🔺功能:参与Pro生物合成,起着转运AA和识别密码子的作用。
tRNA的二级结构
🛎特征:
单链(3'端都为CCA-OH,5'端都为pG.)
三叶草形态
一臂四环:氨基酸臂、T ψ C环(胸苷-假尿苷-胞苷环)、额外环、反密码子环、DHU环(二氢尿嘧啶环)。
✔️氨基酸臂:3'端都为CCA-OH,可接受活化的氨基酸;
✔️反密码子环:由7个AA 组成,中间三个aa为反密码子,可识别mRNA上的密码子。
· T ψ C环:与核糖体的结合有关。
· DHU环:与氨酰-tRNA合成酶的结合有关。
tRNA的三级结构
特征:
在二级结构基础上进一步折叠扭曲形成倒L型。
tRNA中几乎所有相邻碱基通过疏水作用相互堆积。
· tRNA含大量修饰核苷酸,可能参与三级结构的形成,也增加了tRNA的识别功能。
⭐️ rRNA 的高级结构:
· 功能rRNA占细胞RNA总量的80%,是组成核糖体的主要成分,核糖体催化肽键合成的是rRNA,蛋白质只是起到维持rRNA构象起协助作用。
· rRNA的二级结构可形成颈环结构;rRNA的二级结构折叠形成三级结构。
🛎 特征:
单链,螺旋化程度较tRNA低
与蛋白质组成核糖体后方能发挥其功能
核糖体: (rRNA + Pro)
大亚基
含有肽基转移酶,可催化Pro肽键的合成。 (大亚基rRNA实际是一种核酶)
小亚基
核糖体解码中心位于小亚基上,解码是小亚基rRNA的功能。
四、RNA的功能
五、其他RNA的高级结构
功能mRNA约占细胞总RNA的3%~5%,代谢活跃,寿命较短,是蛋白质生物合成的模游离的mRNA 常会形成高级结构BNA一般都与蛋白质形成复合物,而且总是以RNA-蛋白质复合物的形式执行功能。
六、原核生物和真核生物mRNA在结构上的不同;
1)原核生物的mRNA是多顺反子的,真核生物的mRNA是单顺反子。
2)原核生物mRNA5'端无帽子结构,真核生物mRNA5'端有帽子结构。
3)原核生物mRNA3'端无多聚腺苷酸,真核生物mRNA3'端有一段长达200个腺苷酸(polyA尾)构成的聚腺苷酸,称为“尾巴结构”。