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生物化学与分子生物学(第一章 蛋白质):存在自然界中的氨基酸有300余种,但组成人体蛋白质的氨基酸有21种(包括含硒半胱氨酸,不包括吡咯赖氨酸),且均属 L-α-氨基酸(甘氨酸除外)。
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绪论 1
第一节 生物化学与分子生物学推动生命科学进入分子层次 1
一、生物化学与分子生物学的发展经历了三个阶段 1
二、我国科学家对生物化学与分子生物学发展的贡献 3
三、当代生物化学与分子生物学研究的目标和特点 3
第二节 自然界生物体及生命活动具有共同的分子基础 4
一、生物体由信息大分子和多种小分子共同构成 4
二、生物体的化学反应有效利用并适应地球环境 5
第三节 生物化学与分子生物学的发展引领医学进入分子医学新时代 6
一、从分子层次认识疾病将从根本上理解疾病的发生和发展机制 6
二、医学进入了分子诊断和分子治疗新时代 7
三、分子组学研究是未来实现个体化治疗的基础 8
第一篇生物分子结构与功能
第一章 蛋白质的结构与功能 11
重点:氨基酸的结构、蛋白质的分子结构、结构与功能的关系 难点:*肽平面、蛋白质的二级结构 *蛋白质结构与功能的关系 *以血红蛋白为例,理解多亚基蛋白质的协同效应与变构效应
第一节 蛋白质的分子组成 11
各种蛋白质的含氮量很接近,平均为16%
一、L-a-氨基酸是构成蛋白质的基本结构单位 11
存在自然界中的氨基酸有300余种,但组成人体蛋白质的氨基酸有21种(包括含硒半胱氨酸,不包括吡咯赖氨酸),且均属 L-α-氨基酸(甘氨酸除外)
二、氨基酸的侧链结构(R基团)决定其差异性和功能 12
侧链含烃链的氨基酸属于非极性脂肪族氨基酸
侧链含芳香基团的氨基酸是芳香族氨基酸
侧链有极性但不带电荷的氨基酸是极性中性氨基酸
侧链含负性解离基团的氨基酸是酸性氨基酸
侧链含正性解离基团的氨基酸属于碱性氨基酸
三、氨基酸具有共同或特异的理化性质 14
(一)两性解离及等电点
等电点(isoelectric point, pI) 在某一pH的溶液中,氨基酸解离成 阳离子和阴离子的趋势及程度相等,成为 兼性离子,呈电中性。此时溶液的pH值 称为该氨基酸的等电点
(二)其他理化性质
1. 茚三酮反应
氨基酸与茚三酮水合 物共热,可生成蓝紫色化 合物,可作为氨基 酸定性定量分析的方法
2、紫外吸收性质
含共轭双键的色氨酸、酪 氨酸的最大吸收峰在 280 nm 附近。
四、氨基酸通过肽键连接形成蛋白质或活性肽 15
(一)肽(Peptide)
肽键(Peptide bond)
氨基酸残基(Residue)
N 末端:多肽链中有游离氨基的一端 C 末端:多肽链中有游离羧基的一端
#(二) 几种生物活性肽
#五、非常见氨基酸也具有重要的生物功能 17
第二节 蛋白质的分子结构 17
一、氨基酸残基的排列顺序是蛋白质一级结构的最主要因素 17
*主要的化学键是肽键,有些蛋白质还包括二硫键 *每种蛋白质都各有其独特的一级结构,但是各种蛋白质一级结构的主链都是类似的
二、多肽链中的局部特殊构象是蛋白质的二级结构 18
*主要的化学键是氢键 *并不涉及氨基酸残基侧链的构象
(一)肽单元 (peptide unit)
(二) α-螺旋 (α-helix)
(三)β-折叠 /β-片层 (β-sheet)
(四)β-转角 和无规卷曲
(五)超二级结构——模体
三、多肽链在二级结构基础上进一步折叠形成三级结构 22
*主要的化学键是次级键(疏水键、离子键、氢键和范德华氏力等)
(一)结构域(domain)
(二)分子伴侣(chaperon)
四、多亚基的蛋白质具有四级结构 24
*主要的化学键是次级键
(一)定义
每一条多肽链都有完整的三级结构,称为蛋白质的亚基 (subunit)蛋白质分子中各亚基的空间排布及亚基接触部 位的布局和相互作用,称为蛋白质的四级结构
五、蛋白质的结构与功能是其分类基础 25
根据蛋白质组成成分
单纯蛋白质(少)
结合蛋白质 = 蛋白质部分 + 非蛋白质部分
根据蛋白质形状
纤维状蛋白质
结构蛋白
球状蛋白质
功能蛋白
根据蛋白质功能
根据蛋白质结构
第三节 蛋白质的结构与功能的关系 26
一、蛋白质一级结构与功能的关系 26
(一)一级结构是空间构象的基础
1、一级结构保持,被破坏的空间构象及功能可以恢复
2、一级结构相似的蛋白质,空间构象及功能也相似
(二)物种间接近,一级结构相似,其空间构象和功能也相似
(三)一级机构关键氨基酸序列改变可引起疾病
二、蛋白质的功能依赖特定空间结构 28
(一)血红蛋白构象变化引起功能变化
1、血红蛋白亚基与肌红蛋白结构相似
2、Hb和Mb结构的差异决定了功能的不同
*协同效应(cooperativity) 一个寡聚体蛋白质的一个亚基与其配体结合 后,能影响此寡聚体中另一个亚基与配体结合能 力的现象,称为协同效应。 如果是促进作用则称为正协同效应 (positive cooperativity)。 如果是抑制作用则称为负协同效应 (negative cooperativity)。
3、Hb亚基构象变化可影响亚基与氧结合
*变构效应/别构效应(allosteric effect) 蛋白质空间结构的改变伴随其功能的变化, 称为变构效应。 具有变构效应的蛋白质成为变构蛋白 (allosteric protein)。 能引起蛋白质发生别构效应的物质称为变构 剂效应剂(allosteric effector)。
(二)蛋白质构象改变可引起疾病
#三、蛋白质的化学修饰是其功能调控的重要方式 32
第四节 蛋白质的理化性质 32
一、蛋白质具有两性解离性质 32
*在等电点时,蛋白质的溶解度最小,容易沉淀析出
二、蛋白质具有胶体性质 32
三、蛋白质空间结构破坏可引起变性 32
变性的本质
破坏非共价键和二硫键,不改变一级序列结构
四、蛋白质在紫外光谱区有特征性吸收峰 33
五、蛋白质呈色反应可用于蛋白质浓度测定 33
茚三酮反应(ninhydrin reaction)
双缩脲反应(biuret reaction)
#第五节 蛋白质分离、纯化和结构分析 33
一、基于蛋白质理化性质的分离和纯化方法 34
二、蛋白质一级结构可通过两种策略进行分析 37
三、测定蛋白质空间结构有利于功能研究 39
#第六节 血浆蛋白质 40
一、采用电泳法可将血浆蛋白质分成若干组分 40
二、血浆中大多数蛋白质具有特殊的生物学功能 40
第二章 核酸的结构与功能 43