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下图是一个关于利器待之的思维导图。导图从所用工具、生信技能应用场景、数据挖掘流程、高分实验性文章特点这四个方面作了介绍。
医学,介绍了 胃母细胞瘤(Gastroblastoma)、丛状纤维黏液瘤(plexiform fibromyxoma)、周细胞瘤(Pericytoma)、伴GLI1基因重排的恶性上皮样肿瘤(Malignant Epithelioid Neoplasm with GLI1 Gene Rearrangements)的内容。
免疫评分及免疫参数的思维导图,主要内容有简介、预后免疫参数、免疫评分(Immunoscore)和免疫背景参数、预测性免疫参数。
中性粒细胞是最丰富的粒细胞类型,占人类所有白细胞的40%至70%。作为宿主抵抗入侵病原体的第一道防线,中性粒细胞具备固有的吞噬能力,可以吸收纳米颗粒和吞噬死亡的红细胞,并在激活后清除外来病原体和加载靶点;而且,还能跨血管迁移到临近组织。是执行体内医学任务的天然候选者。
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利器待之
所用工具
研究分析算法,精通编程语言
掌握R语言,精通统计分析和数据可视化
掌握生信在线数据库和分析软件应用
生信技能应用场景
疾型锁定,寻找主变量
从主变量找机制变量
涉及数据库
信息数据库
Genebank, Nucleotide, Gencards, noncode, UCSC, ORF finder, CpG Finder
通路数据库
KEGG, DAVID, GSEA
互作数据库
Targetscan, JASPAR, Starbase, String
样本数据库
GEO, TCGA, SEER, Oncomine
数据挖掘流程
合并高通量数据集结果
锁定关键分子
分子与临床因素建立相关性
分子间建立聚类及网络
高分实验性文章特点
添加生信分析进一步证明结论
结合临床资料进行生存分析
通过信号通路及分子间相互作用阐述作用机制