导图社区 生物化学王镜岩下册4版
这是一篇关于生物化学王镜岩下册4版的思维导图,主要内容有26氨基酸生物合成和生物固氮、27核酸降解和核苷酸代谢、28新陈代谢的调节和控制等。
编辑于2022-10-02 08:54:494版下册 15--36章
26氨基酸生物合成和生物固氮
生物固氮
氨的同化作用
生物合成
由a戊酮二酸形成
草酰乙酰形成
丙酮酸族的生物合成
丝氨酸生成
芳香族及组氨酸生成
调节
产物调节
①筒单产物抑制
②协同抑制
③酶的多重性抑制
④连续产物抑制
酶生成量→
转化
氧化氮形成
谷脱甘肽
肌酸
短杆菌肽s
D~AA
27核酸降解和核苷酸代谢
核’核甘酸的分解代谢
核酸降解
核苷酸分解
嘌呤碱分解
嘧啶碱的分解
核甘酸的生物合成
嘌呤核糖核苷酸合成
①次黄嘌呤…合成
②腺嘌呤…合成
③鸟嘌呤…合成
④嘌呤碱+核苷→…
⑤嘌呤…合成调节
嘧啶…合成
尿嘧啶…合成
胞嘧啶…合成
嘧啶碱+核苷→…
…调节
核苷一磷酸→…三磷酸
脱氧核糖核苷酸的合成
①核糖…还原
②dMTP合成
③碱基+脱氧核苷→脱氧核苷酸
辅酶核苷酸合成
烟酰胺核苷酸的合成
黄素…合成
辅酶A合成
28新陈代谢的调节和控制
代谢控制的基本原理
互相一成网络
动力学稳态
调节点是远离平衡的反应
控制分析
协同调节
酶活性和酶量调节
①变构调节→前馈十反馈
②产/需能反应调节
③酶活性特异激活和抑制
④酶原激活,共价修饰,级联反应
⑤酶量调节
代谢途经的分隔与控制
①细胞结构和酶的区域化分布
②膜结构调节
1控制跨膜离子浓度和电位梯度
2控制细胞/器的物质运输
3膜与酶的可逆线合
③信号途径调节
机体在整体水平上调控
①激素和递质调节
②神经
③器官代谢协调
1肝加工和转运营养物
2肌肉利用ATP做功
3脑利用能量传递电脉冲加工信息
4血液运送氧代谢物和激素
代谢紊乱造成疾病
①糖尿病与胰岛素
②肥胖与脂代谢
③禁食与饥饿→l紊乱
29基因和染色体
概念
孟德尔遗传因子假说
摩尔根基因学说梁色体理论
基因DNA→编码肽链十RNA
基因/组结构
①原核………
②真核……
染色体结构
不同层次的结构
细菌拟核结构
真核生物染结构
①常/异染色质
②核小核结构
③染质高级结构
染色质重塑
①组蛋白修饰变异
组蛋白变异体→改变核小什刁功能
组pro修饰
组pro修饰酶
②DNA修饰
DNA甲基化→基困沉默十异染色质化
性别决定十剂量补尝
基因组印记
③染色质重塑十基因表达调节
基因进化
①热力动力学进化
②生命起源
前生命期化学进化
RNA世界假说
遗传密码起源十进化
③进化的驱动力多样性适应性
①生物分子相互做用→进化
②进化改变性状十改进进化能力
③中性漂变理论→挑站进化论
④获得性可以遗传
⑤小/大进化是协同进化
④基因/组进化
⑤表观遗传作用
30DNA的复制和修复
1DNA复制
①半保留
②起点十方式
③DNA聚合反应有关酶
l反应和酶
大肠杆菌DNA聚合酶
DNA连接酶
④半不连续复制
⑤复制拓扑性质
⑥过程
①起始
②延伸
③终止
⑦真核生物DNA的复制
2DNA损伤修复
①错配 修复
②直接…
③切除…
④重组…
⑤应急反应十易错修复
3DNA突变
①类型
丨置换
转换
颠换
2移码
插入
缺失
3大片段缺失和重复
②诱变剂作用
①碱基类似物
②碱基修饰剂
③嵌入染料
③诱变剂/致癌剂的检测
31DNA重组
同源重组
holliday模型
细菌基因转移与重组
①细菌的接合作用
②细菌的遗传转化
③细菌的转导
④细菌细胞溶合
有关酶
特异位点重组
入噬菌体DNA整合切除
细菌特异位点重组
免疫球蛋白基因重排
转座重组
细菌转座因子
①插入序列
②转座子
③过程和效应
真……因子
32RNA的生物合成和加工
DNA→指导RNA合成
DNA→RNA聚合酶合成
启动子/转录因子
链的延伸/廷伸因子
终止子/终止因子
转录调节控制
RNA合成抑制剂
①嘌呤和嘧啶类似物
②DNA模板功能的抑制物
③RNA聚合酶的抑制物
RNA转录加工
原核生物RNA加工
①原核rRNA前体加工
②tRNA前体加工
③mRNA…
真核生物RNA加工
①真rRNA…
②tRNA…
③mRNA…
RNA剪接编辑再编码
剪接
编辑
再编码
RNA生物功能多样性
…降解
RNA指导合成下RNA,DNA合成
RNA复制
①噬菌体Q阝RNA复制
②病毒RNA复制方式
逆转录
①发现
②性质
③逆转录病毒基因组
④过程
⑤生物学意义
逆转座子种类和机制
①…结构特点
②转座作用
③生物学意义
33蛋白质合成加工和定位
遗传密码
破译
基本性质
①基本单位
简并性,摆动性,通用性 ,安全性
子主题
解读
选择转录
加工处理
纠错
翻译
…主导表形的形成
pro有关RNA和装置
核糖体
转移RNA和氨酰一tRNA合成酶
信使
pro合成步骤
①氨酰一tRNA合成
②多肽链合成起始
③……终止
④拆叠加工修饰
合成的忠实性
消耗能量
校对功能
核糖体的影响
定位
信号肽跨膜运输
糖基化作用
线叶体定位
34基因表达调节
基本原理
表达不同水平
反式因子/顺式元件调节
正/负
调节pro结合D~A结构域
①螺旋一转角一螺旋
②锌指
③同源域
调pro有相互作用
①亮氨酸拉链
②螺旋一突环一螺旋
原核…调节
操纵子
降解物阻遏
合成衰减作用
核糖体pro与rR~A协同作用
翻译调节和小R~A调节
mRNA翻译能力
翻译阻遏
反义RNA
tmRNA
核糖开关
真…调节
转录前
丢失
扩增
重排
修饰和异染色质化
转录水平
活化与阻遏
启动子增强孑
反式因子
RNA加工剪切
翻译
RNA干挠,多种RNA调节
翻译后加工
pro降解调节
35基因工程蛋白质工程及技术土
克降原理
限制酶连接
分子克隆载体和宿主
外基导入细胞
①→原核
②入噬菌体体外包装
③→真核
基因分离合成测序
文库构建
CD~A文库
①原理
②mRNA分离制备
③cDNA合成
④双链CDNA克隆
⑤基本步骤
克隆基因分离鉴定
由载体特征
原位杂交
差别杂交扣除杂交
从表达文库分离
鉴定
pcR
原理
最适条件
发展应用
DNA化合成
基因定位诱变
酶切定位诱变
寡核苜酸指导
pcR诱变
测序
基因表达
外在原核表达
控制丫原件
融合蛋白表达
提高表达水平
产物分离鉴定
产物的一般分离和鉴定方法
从包涵体中纯化
用金属螯合柱纯化→组氨酸标签
外在真核表达
在酵母
植物
哺乳动物
转基因动/植物
获植物方法
标记基因报告基因
转植再生
表达
…动物…
安全性
重组D~A实验室操作安全性
转基因生物产业生产
转基因食晶
pro工程
Pro分子设计改造
实验进化
进展
应用展望
新纪元
产业
展望
36基因组学及蛋白质组学
全基因组DNA测定和注释
①基本内涵
拼接
注释
测序
②大肠杆菌全基困组测序和注释
③人类基因组…
功能基因组学
①转录谱分析
②基因敲除
③基因敲低
pro组学1
①二维电泳分离pro
②pro一pro相互作用网络分析
③pro翻译后修饰高通量鉴定
④人类蛋白质组工程
⑤系统生物学
25蛋白质降解和氨基酸分解
降解
特性
反应机制
①溶酶体无选择降解
②泛素给选择降解加标记
对外源蛋白质消化吸收
AA分解代谢
脱氨基作用
①氨基转移反应
②GLc-丙氨酸循环,→肝
③转氨酶
氧化脱氨基作用
其他
联合脱氨
脱羧
氨的命运
转运
排泄
尿素形成
尿素循环的发现
尿素循环
调节
AA碳骨架氧化途径
①乙酰一C0A途径
②a一酮戊二酸途径
③琥珀酰coA
④廷胡索酸
⑤草酰乙酸
生糖/酮AA
AA衍生物
与一碳单位
与生物活性物质
AA代谢缺乏
24脂质的代谢
三酰甘油消化吸收转运
脂肪酸氧化
①活化
②脂肪酸转入线粒体
③阝氧化
①kn00p的重要发现
②脂肪酸阝氧化作用
过程
脂酰一COA脱氢酶
脱氢酶缺乏症
④脂肪酸氧化足高度放能的过程
不饱和脂肪酸氧化
①不饱和脂肪酸的氧化
②丙酰一C0A的生成
奇数碳原子氧化途经
VB12变位酶辅酶机制
子主题
③过氧化物脂方酸阝氧化
④a/ω氧化
⑤阝氧化酶进化
酮体
乙酰一cOA代射结局
肝中酮体形成
肝外用酮体做燃料
调节代谢
①进入线体的调控
②心脏中氧化调节
③激素
④根据代谢需要的调控
⑤酶水平
生物合成
①贮存脂肪
②生物合成
乙酰C0A的作用
乙酰COA十碳酸氢盐→丙二酸单酰COA
脂肪酸合酶
由脂肪酸合酶催化的反应
七步
脂肪酸合成途经与阝氧化比较
碳链加长和去饱和
代谢途径调节
③脂酰甘油生物合成
④磷脂合成
甘油磷脂合成
二酰甘油是磷酯胆碱和脂酰乙醇合成关键化合物
脂肪酸取代在Snl和Sn2位上
4,5二磷酸磷脂酰肌醇
肝中结构脂调控优先于贮能
磷酯类生物合成最后一步发生在细胞溶胶面
⑤鞘磷/糖脂合成
⑥类十二烷酸合成
⑦胆固醇生物合成
概述
步骤
1,甲羟戊酸合成
2,①→异戊酰焦磷酸十甲烯丙基焦磷酸
3,三十碳角鲨烯
4,鲨稀→羊毛固醇
5,羊毛固醇→胆固醇
调控
⑧胆固醇转化产物的生物合成
①哺乳动物胆固醇代谢
②血浆脂蛋白
乳糜微粒极低密度脂蛋白
低密度脂蛋白
高密度脂蛋白
③胆汁酸
④类固醇缴素
23光合作用
1概况
能量源头→光
发现
场所→质体
总过程
①分光/暗两阶段
②水是光合还原NADP十的最终电子供体
③反应方程
④O2来自水
利用可见光
①光二象性
②光合用光为可见光
③可见光光谱能级
2叶缘素的光反应性叶绿体
叶绿素吸收光能
辅助集光色素
光合单位
共振吸收光能
3光驱动电子流中心光化学
光合细苗只有二种类型中一种反应中心
①脱镁叶绿素一醌型反应中心(11)
紫色细菌反应中心的三维结构
紫色细菌光化学反应中心的电子传递
②Fe-S型反应中心l型
热力学动力学防止能量散失
生氧光合生物同时具有两种类型的反应中心
①P680和P700分别是光系统反应中心色素
②叶绿素以蛋白缔合形式存在于光合膜中
生氧光合生物分子构造
①psII分子构造与紫色细菌相似
②PsI分子结构类似紫细和psII结构
PSII与PSI串联起作用
①生氧光合电子传递的Z图式
②PsII的光驱动电子流
③通过Ps丨的光驱动电孑流
连接
水光解
定位
4光驱动的A丅P合成光合磷酸化
质子梯度把电子流和磷酸化偶联
化学渗透
循/非循环光合磷酸化
叶绿体ATP合酶与线粒体相似
盐细菌光合磷酸化
能量利用效率
5暗反应cO2的固定
①C02的固定 与核酮糖二磷酸羧化酶/加氧酶
①co2 的固定是通过循环进行的
②酶组成
③RUbisco存在形式
④催化反应
②C02由卡尔文→糖
①C02→3一Bp(三磷酸甘油酸)
②3一Bp→G3P
③从丙酮糖在生15二磷酸核酮糖
③卡尔文三个阶段
④4种酶
6光呼吸及碳4途径
①Rubisco酶
②碳4植物申二氧化碳的固定和①是分开
③CAM植物
22糖原的分解和生物合成
1 生物学意义
2降解
①磷酸化酶
①非还原性末端磷酸解
②磷酸解1→4糖苷键
③分子结构
④反应机制
⑤辅助因子→磷酸吡哆酫PLP
②脱支酶
子主题
③变位酶
④G6P磷酸酶
3合成
①历程
②合成三种酶
①UDP-葡糖焦磷酸化酶
②糖原合成酶
③糖原分支酶
4调控
①磷酸化酶调节机制
②糖原合酶
③G蛋白对激素信号传递
④糖原累积症
21糖异生和糖的其他代谢途径
1糖异生作用
①作用途径
l)糖异生&糖酵解
II)迂回措施
①丙酮酸→草酰乙酸→PEP
②FBp→F6p
③G6p→Glc
②总览
③丙酮酸→Glc能量消耗意义
④调节
1FPk和1,6二磷酸果糖酶调节
2丙酮酸激/羧化/PEP∽激酶调节
⑤乳酸再利用和可立氏循环
2Glc转运
3乙酫酸途径
4寡糖类的生物合成和分解
①概论
②乳糖合成分解
合成
分解
乳糖不耐受症
③糖蛋白合成分解
糖链合成
①特点
②连接类型
寡糖链合成
④糖蛋白糖链分解代谢
20戊糖磷酸途径
1发现
2主要反应
氧化阶段
①G6P→6磷酸葡糖酸δ内酯
②→6磷酸葡糖酸
③→5磷酸核酮糖(Ru5P)
非氧化阶段
④Ru5P→5磷酸核糖
⑤Ru5P→5磷酸木酮糖
⑥RU5P+5磷酸木酮糖→G3p+7磷酸景天庚酮糖
⑦7磷景酮十G3P→4磷酸赤藓糖+F6P
⑧Ru5p十4赤→G3p十F6P
3调控
4生物学意义
①产生NADPH主要途径
②细胞内不同结构糖的来源和为各种单糖提供相互转变条件
19氧化磷酸化
1氧化还原电势
①氧化还原电势
②重要的电对
③标准还原电势差和自由能变化
④标准电动势和平衡常数
2电子传递和氧化呼吸
①电子传递过程自由能的释放
②呼吸链
③电子传递链
④电链详
⑤抑制剂
3氧化磷酸化作用
①线粒体结构
②作用机制
③质子梯度形成
④ATP合成机制
⑤解偶联和抑制
⑥细胞溶胶NADH再氧化
⑦调控
⑧ATP总结算
⑨氧的不完全还原
18柠檬酸循环
1丙酮酸→乙酰辅酶A过程
①丙酮酸脱羧→乙酰基
②乙酰基转移→乙酰辅酶A
③E3催化E2中二氢硫辛酰胺辅基在氧化
④E3亚基再氧化
2柠檬酸循环
①草酰乙酸+乙酰辅酶A→柠檬酸
②柠檬酸异构→顺乌头酸→异柠檬酸
③异柠檬酸氧化→α-酮戊二酸
④α-酮戊二酸氧化脱羧→琥珀酰辅酶A
⑤琥珀酰辅酶A→琥珀酸
⑥琥珀酸脱氢→廷胡索酸
⑦廷胡索酸水合→L-苹果酸
⑧苹果酸氧化→草酰乙酸
3化学总结算
4调控
5柠檬酸循环在代射中双重角色
6乙酫酸途径
17六碳糖的分解和糖酵解作用
1研究历史
2过程概述
3图解
4第一阶段(消耗2个)
①Glc磷酸化→G6p
②G6p异构化→F6p
③F6p磷酸化→FBP
④FBP裂解→DHAP+GAP
⑤DHAP与GAP相互转变
5第二阶段(放能4个)
⑥GAP氧化→1,3-BPG
脱氢酶催化机制
砷酸盐破坏1,3-BPG形成
⑦1,3-BPG转移基团→3-PG
⑧3-PG→2-PG
⑨2-PG→PEP
⑩PEP→丙酮酸
6能量转变估算
净产生2个
7丙酮酸的去路
①生成乳酸
②生成乙醇
丙酮酸脱羧→乙醛还原→乙醇十NAD氧化
8作用调节
①磷酸果糖激酶
②F-2,6-BP对酵解的调节作用
③己糖/丙酮酸激酶的调节作用
④丙酮酸激酶调节作用
⑤5-磷酸木酮调节
⑥癌组织糖代射紊乱
9其他六碳糖进入糖酵解的途经
1果糖→F6p
2半乳糖→G6p
半乳糖血症
3甘露糖→F6P
16生物能学
生物能学与热力学
①系统状态性质过程
②热功能
③热一定律和焓
④热化学
⑤热二定律和熵
⑥Gibbs自由能
化学反应中自由能变仪和意义
①化学自由能的变化和标准白由能的生成
②标准自由能变化和化学平衡的关系
③实际自由能变化取决于反/产物的浓度
④偶联反应的标准自由能具有可加性
ATP与磷酰基转移
①ATp水解的自由能变化是最大的负值
②细胞中影响ATP水解的因素
③其他磷酸化合物和硫酯有水解自由能
④ATP通过基团转移放能
⑤ATP水解成磷酰基焦磷酰基腺苷酰基
⑥ATP为供能
⑦核苷酸的转磷酸作用甘所有细胞中都存在
⑧无机多磷酸是潜在的磷酰基供体
⑨ATp系统动态平衡
15 新陈代谢总论
概念和原理
1包括合成代谢合分解代谢
2代谢反应受自由能驱动
3核苷酸衍生物是能量和活性基团的载体
4代谢的基本要略是在于形成ATP和还原力构造原件
5代谢在分子细胞整体三个水平上调节
新陈代谢的主要反应机制
1基团转移反应
1酰基转移
2磷酰基转移
3糖基转移
2氧化还原反应
3消除异构及重排反应
1消除反应
①协同机制
②经过碳正离子的机制
③经过碳负离子机制
从立体化学看可分为
①反式消除
②顺除消除
异构反应
分子重排反应
4碳-碳键的形成反应
①羟醛缩合反应
②克莱森酯缩合反应(3步)
③β_酮酸的氧化脱羧反应
5自由基反应
新陈代谢的研究方法
1利用酶的抑制剂
2利用遗传缺陷
3同位素示踪
4核磁共振
5色谱一质谱互联