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蛋白质相关知识梳理,包括氨基酸化学结构和分类、氨基酸的理化性质、肽和肽键、蛋白质的一级结构和高级结构、蛋白质结构与功能的关系、蛋白质理化性质等等。
编辑于2022-10-12 13:17:06蛋白质
氨基酸化学结构和分类
氨基酸化学结构
组成人体蛋白质的20种氨基酸,均属于L-α-氨基酸,除甘氨酸外的19种氨基酸均具有手性
氨基酸分类
非极性脂肪族氨基酸7种
异亮氨酸
Ile
甲硫氨酸
Met
亮氨酸
Leu
丙氨酸
Ala
甘氨酸
Gly
脯氨酸
Pro
唯一亚氨基酸,唯一环状氨基酸
缬氨酸
Val
记忆:
一两假饼干腹泻
极性中性氨基酸5种
谷氨酰胺
Gln
苏氨酸
Thr
丝氨酸
Ser
半胱氨酸
Cys
天冬酰胺
Asn
记忆:
姑苏寺半天
含芳香环的氨基酸3种
酪氨酸
Tyr
色氨酸
Trp
苯丙氨酸
Phe
记忆:
老色本
酸性氨基酸2种
天冬氨酸
Asp
谷氨酸
Glu
记忆:
天冬谷
碱性氨基酸3种
精氨酸
Arg
赖氨酸
Lys
组氨酸
His
记忆:
精赖组
氨基酸的理化性质
两性解离和等电点
两性解离
阳性解离:氨基解离
阴性解离:羧基解离
等电点
能够让特定氨基酸解离成阳离子和阴离子的趋势和程度相等
PH离AA的PI越远,AA所带电荷越多
紫外吸收
色氨酸和酪氨酸在280nm附近有吸收峰(蛋白质280nm)
苯丙氨酸在260nm处有吸收峰
核酸在260nm处有最大吸收峰
颜色反应
茚三酮与氨基酸共热,生成570nm蓝紫色化合物,用于氨基酸定量分析
蛋白质与双缩脲成紫红色
肽和肽键
肽键
α-氨基和α-羧基脱水形成酰胺键
肽键具有一定双键性质
肽单元
即肽平面。指参与肽键的6个原子Cα₂、C、O、N、H、Cα₂位于同一平面
肽平面是蛋白质高级结构的基本结构单位
蛋白质的一级结构和高级结构
一级结构
概念:N端到C端的氨基酸的排列顺序
作用力:肽键和二硫键
高级结构
二级结构
概念:局部肽段,主链原子空间排布
作用力:氢键
氢键与螺旋长轴平行
表现形式:
α螺旋
右手螺旋,R链伸向螺旋外侧,螺旋每圈3.6个氨基酸残基
β折叠
呈折纸状/锯齿状,多肽链充分伸展
β转角
四个氨基酸构成的180°回折,第二个氨基酸往往是脯氨酸
Ω环
在蛋白质分子表面,以亲水氨基酸残基为主
三级结构
概念:整条肽链所有原子的排布
作用力:疏水键、离子键、氢键、范德华力(次级键:非共价键)
疏离氢华
表现形式
结构模体
概念:有功能的超二级结构
例子
锌指结构
由一个α螺旋,两个反平行β折叠,三个肽段构成
亮氨酸拉链
每两圈出现一个亮氨酸,所有亮氨酸都在同一侧
α螺旋-转角/环-α螺旋
转录因子
具有有一个或以上的模体结构
具有转录激活结构
具有蛋白质-蛋白质结构
结构域
分子量大的蛋白质折叠成的多个结构紧密且稳定的功能区域
四级结构
概念:①两个或两个以上的肽链②各自形成的亚基间空间排布及相互作用
含有两条或以上的肽链不一定具有四级结构
胰岛素由两条多肽链但没有形成亚基所以不具有四级结构
作用力:离子键、氢键
蛋白质结构与功能的关系
一级结构是高级结构和功能的基础
①一级结构是空间构象的基础
牛的核糖核酸酶A的变性和复性
②一级结构相似的蛋白质具有相似的高级结构和功能
生长激素和催乳素
抗利尿激素和缩宫素
③分子病:基因的点突破或大片段碱基缺失
镰刀型贫血症(β链谷走了缬路)
蛋白质功能依赖特定的空间结构
①血红蛋白亚基/三级结构和肌红蛋白相似,都含有血红素辅基
一个肌红蛋白结合1个血红素辅基/O₂,一个血红蛋白结合4个血红素辅基/O₂
肌红蛋白是三级结构,血红蛋白是四级结构
②血红蛋白4个亚基靠8个盐键相互连接。 血红蛋白与氧气结合存在正协同效应。 血红蛋白有紧张态(T)、松弛态(R)两种构象。
③蛋白质构象病:一级结构未改变,空间构象改变,影响其功能,严重时导致疾病发生。
如:老年痴呆、疯牛病、亨廷顿舞蹈症
蛋白质理化性质
①两性解离和PI
当蛋白质溶液处于某一PH时,蛋白质解离成正、负离子的趋势相等,即成为兼性离子,净电荷为零
②胶体性质
蛋白质胶体的稳定因素是水化膜和带电荷
③蛋白质变性
在物理或化学因素作用下蛋白质高级结构被破坏
变性本质:破坏非共价键和二硫键,分子量不变
变性特点
⒈活性丧失
⒉溶解度降低
⒊粘度增加(由球状变成纤维状)
⒋易被蛋白酶水解
⒌结晶能力消失
④蛋白质的紫外吸收性质
A280和浓度成正比,用于定量测定
蛋白质
氨基酸化学结构和分类
氨基酸化学结构
组成人体蛋白质的20种氨基酸,均属于L-α-氨基酸,除甘氨酸外的19种氨基酸均具有手性
氨基酸分类
非极性脂肪族氨基酸7种
异亮氨酸
Ile
甲硫氨酸
Met
亮氨酸
Leu
丙氨酸
Ala
甘氨酸
Gly
脯氨酸
Pro
唯一亚氨基酸,唯一环状氨基酸
缬氨酸
Val
记忆:
一两假饼干腹泻
极性中性氨基酸5种
谷氨酰胺
Gln
苏氨酸
Thr
丝氨酸
Ser
半胱氨酸
Cys
天冬酰胺
Asn
记忆:
姑苏寺半天
含芳香环的氨基酸3种
酪氨酸
Tyr
色氨酸
Trp
苯丙氨酸
Phe
记忆:
老色本
酸性氨基酸2种
天冬氨酸
Asp
谷氨酸
Glu
记忆:
天冬谷
碱性氨基酸3种
精氨酸
Arg
赖氨酸
Lys
组氨酸
His
记忆:
精赖组
氨基酸的理化性质
两性解离和等电点
两性解离
阳性解离:氨基解离
阴性解离:羧基解离
等电点
能够让特定氨基酸解离成阳离子和阴离子的趋势和程度相等
PH离AA的PI越远,AA所带电荷越多
紫外吸收
色氨酸和酪氨酸在280nm附近有吸收峰(蛋白质280nm)
苯丙氨酸在260nm处有吸收峰
核酸在260nm处有最大吸收峰
颜色反应
茚三酮与氨基酸共热,生成570nm蓝紫色化合物,用于氨基酸定量分析
蛋白质与双缩脲成紫红色
肽和肽键
肽键
α-氨基和α-羧基脱水形成酰胺键
肽键具有一定双键性质
肽单元
即肽平面。指参与肽键的6个原子Cα₂、C、O、N、H、Cα₂位于同一平面
肽平面是蛋白质高级结构的基本结构单位
蛋白质的一级结构和高级结构
一级结构
概念:N端到C端的氨基酸的排列顺序
作用力:肽键和二硫键
高级结构
二级结构
概念:局部肽段,主链原子空间排布
作用力:氢键
氢键与螺旋长轴平行
表现形式:
α螺旋
右手螺旋,R链伸向螺旋外侧,螺旋每圈3.6个氨基酸残基
β折叠
呈折纸状/锯齿状,多肽链充分伸展
β转角
四个氨基酸构成的180°回折,第二个氨基酸往往是脯氨酸
Ω环
在蛋白质分子表面,以亲水氨基酸残基为主
三级结构
概念:整条肽链所有原子的排布
作用力:疏水键、离子键、氢键、范德华力(次级键:非共价键)
疏离氢华
表现形式
结构模体
概念:有功能的超二级结构
例子
锌指结构
由一个α螺旋,两个反平行β折叠,三个肽段构成
亮氨酸拉链
每两圈出现一个亮氨酸,所有亮氨酸都在同一侧
α螺旋-转角/环-α螺旋
转录因子
具有有一个或以上的模体结构
具有转录激活结构
具有蛋白质-蛋白质结构
结构域
分子量大的蛋白质折叠成的多个结构紧密且稳定的功能区域
四级结构
概念:①两个或两个以上的肽链②各自形成的亚基间空间排布及相互作用
含有两条或以上的肽链不一定具有四级结构
胰岛素由两条多肽链但没有形成亚基所以不具有四级结构
作用力:离子键、氢键
蛋白质结构与功能的关系
一级结构是高级结构和功能的基础
①一级结构是空间构象的基础
牛的核糖核酸酶A的变性和复性
②一级结构相似的蛋白质具有相似的高级结构和功能
生长激素和催乳素
抗利尿激素和缩宫素
③分子病:基因的点突破或大片段碱基缺失
镰刀型贫血症(β链谷走了缬路)
蛋白质功能依赖特定的空间结构
①血红蛋白亚基/三级结构和肌红蛋白相似,都含有血红素辅基
一个肌红蛋白结合1个血红素辅基/O₂,一个血红蛋白结合4个血红素辅基/O₂
肌红蛋白是三级结构,血红蛋白是四级结构
②血红蛋白4个亚基靠8个盐键相互连接。 血红蛋白与氧气结合存在正协同效应。 血红蛋白有紧张态(T)、松弛态(R)两种构象。
③蛋白质构象病:一级结构未改变,空间构象改变,影响其功能,严重时导致疾病发生。
如:老年痴呆、疯牛病、亨廷顿舞蹈症
蛋白质理化性质
①两性解离和PI
当蛋白质溶液处于某一PH时,蛋白质解离成正、负离子的趋势相等,即成为兼性离子,净电荷为零
②胶体性质
蛋白质胶体的稳定因素是水化膜和带电荷
③蛋白质变性
在物理或化学因素作用下蛋白质高级结构被破坏
变性本质:破坏非共价键和二硫键,分子量不变
变性特点
⒈活性丧失
⒉溶解度降低
⒊粘度增加(由球状变成纤维状)
⒋易被蛋白酶水解
⒌结晶能力消失
④蛋白质的紫外吸收性质
A280和浓度成正比,用于定量测定