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用深度注意网络基于全脑MRI预测胶质瘤预后:多中心研究的思维导图, 目的是基于全脑MRI预测胶质瘤预后,不进行图像分割;对象:弥漫性胶质瘤的患者。
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用深度注意网络基于全脑MRI预测胶质瘤预后:多中心研究
方法
病人来源、分组 2个外部验证 还有一个公共数据库 .纳入标准包括成年患者(>18岁)(1)经病理诊断为原发WHO II-IV级胶质瘤;(2)术前MRI资料,包括T1加权、T2加权、T2加权FLAIR和T1加权Gd增强成像(分别为T1、T2、FLAIR和T1c);(3)现有的生存数据和临床数据。
图像的采集和预处理
CNN模型的构建 (流程图)
子主题
预后效能的评估:Kaplan-Meier analysis;用X-tile 计算截止值,a weighted log-rank test 评估不同风险之间评估的差异 ;使用R包pec计算每个数据集的预测误差随时间变化的曲线和综合Brier评分(IBS),以评估总体性能;C指数用来计算区别能力;随时间变化的ROC评估不同时间点的风险评分;多变量Cox分析确定Deeprisk是不是预后的独立预测因素。
诺莫图和 增加的预后价值:1、根据临床因素建立的诺莫图 2、把DeepRisk score用Cox分析纳入临床诺莫图中,建立深度学习的诺莫图,这样就可以通过对比两种诺莫图的效能评价增加的预测预后的价值(计算预测误差曲线和IBS,以量化两种诺模图的总体预测性能)。使用R包SurvIDINRI计算净重分类改进(NRI)计算,以衡量DeepRisk分数增加的预测性能的改进。3、DCA曲线
讨论
第一段:本文的主要内容,对比两个深度学习的效能 对比了两个诺莫图的结果
第二段:本研究选择用全脑MRI 图像,不勾画ROI;本研究模型加入了注意力机制,提高模型的效能
第三段:既往研究的对比、影像组学、机器学习、DTI,CNN 本研究加入了注意力机制 创新点
第四段:之前研究建立的诺莫图没有加入影像学的特征,且本研究建立的诺莫图的效能较高
第五段:不足 选择偏倚;国外数据;没有纳入组织学信息
创新点
1、多中心数据、公共数据集 、样本量大
2、内容丰富:对比不同图像 整体和局部;不同模型:临床、临床加影像的组合的对比
3、统计学方法很详细;技术方法上的创新
概述
弥漫性胶质瘤是最常见的原发脑肿瘤
传统分类:根据WHO分级,包含2\3\4级,但是这种方法的分类不足以预测预后,差别很大,2021年 根据分子分型分类
由于弥漫性胶质瘤本身的侵袭性的特点,所以该肿瘤是系统性的而不是局灶性的
建立2个深度学习模型预测弥漫性胶质瘤预后;也对比了是不是这个模型可以增加临床和基因特征的预测价值
目的:基于全脑MRI预测胶质瘤预后,不进行图像分割;对象:弥漫性胶质瘤的患者