微生物的分类和鉴定

微生物的通用分类单元为：界、门、纲、目、科、属、种，此导图还介绍了微生物在生物界的地位以及微生物的鉴定

微生物的分类和鉴定

• 通用分类单元
  • 界、门、纲、目、科、属、种
  • 种的概念
    • 是生物分类中基本的分类单元和分类等级，指一大群表型特征高度相似、亲缘关系极其接近、与同属内其他种有着明显差异的菌株的总称
    • 新种：是指权威性的分类、鉴定手册中从未记载过的一种新分离并鉴定过的微生物
  • 学名
    • 双名法
      • 学名=属名（斜体）+种的加词（斜体） +（首次定名人）+现名定名人+现名定名年份
    • 三名法
      • 学名=属名（斜体）+种的加词（斜体） +符号subsp或var（正体） +亚种或变种的加词（斜体）
  • 亚种以下的分类单元
    • 亚种
    • 变种
    • 型
    • 菌株
      • 又称品系（在非细胞型的病毒中则称毒株或 株），表示任何由一个独立分离的单细胞（或单 个病毒粒）繁殖而成的纯遗传型群体及其一切后 代
      • 模式菌株：是一个种的具体活标本，必须是该菌 种的活培养物，是由一个被指定为命名的模式菌 株传代而来
• 微生物在生物界的地位
  • 生物的界级分类学说
    • 两界系统
    • 三界系统
    • 四界系统
    • 五界系统
      • 动物界
      • 植物界
      • 原生生物界
      • 真菌界
      • 原核生物界
    • 六界系统
  • 三域学说
    • 细菌域
    • 古生菌域
    • 真核生物域
  • 各大类微生物的分类系统
    • 《伯杰氏鉴定细菌学手册》
    • Ainsworth等人的菌物分类系统纲要
• 微生物的鉴定
  • 微生物的鉴定方法
    • 细胞的形态和习性水平（经典分类鉴定）
    • 细胞的组分水平（细胞壁、脂类、醌类和光合色 素成分分析）
    • 蛋白质水平
    • 核酸水平
    • 数学统计学或计算生物学水平
  • 经典分类鉴定方法
    • 经 典 鉴 定 指 标
      • 形态
        • 个体：细胞形状、大小、排列、运动性，特殊构造和染色反应等
        • 群体：菌落形态，在半固体或液体培养基中的生长状态
      • 生理生化反应
        • 营养要求：能源、碳源、氮源、生长因子
        • 酶：产酶种类和反应特性
        • 代谢产物：种类、产量、颜色、显色反应
        • 对药物的敏感性
      • 生态特征
        • 生长温度、与氧、PH、渗透压关系、宿主种类，生活史、有性生殖情况
      • 血清学反应
      • 对噬菌体敏感性
  • 现代分类鉴定方法
    • 通过核酸分析鉴定微生物遗传型
      • DNA碱基比例
      • 核酸分子杂交
      • rRNA寡聚核苷酸编目分析
      • 微生物全基因组序列的测定
    • 细胞化学成分用作鉴定指标
      • 细胞壁化学成分
        • 如根据肽聚糖分子中肽尾第三位氨基酸的种类、肽桥的结构以及与邻近肽尾交联的位置的不同来划分
      • 全细胞水解液的糖型
        • 对放线菌进行分类
      • 磷酸类脂成分的分析
      • 枝菌酸的分析
        • 对“诺卡氏菌形放线菌”进行分类
      • 醌类的分析
        • 对放线菌鉴定上有一定的价值
      • 气相色谱技术用于微生物鉴定
        • 分析代谢产物中脂肪酸和醇类等成分，对厌氧菌的鉴定十分有用。
    • 数值分类法
      • 又称统计分类法，是一种依据数值分析的原理，借助现代计算机技术对拟分类的微生物对象按大量表型性状的相似性程度进行统计、归类的方法
      • 1）计算两菌株间的相关系数
      • 2）列出相似度矩阵
      • 3）将矩阵图转换成树状图