导图社区 Day21.2 UALCAL数据库
这是一篇关于Day21.2 UALCAL数据库的思维导图
关于Day30.2 Endnote攻略的思维导图,本专业和有兴趣的朋友们不要错过,可以下载做复习。
关于Day30 双疾病双表型的思维导图,本专业和有兴趣的朋友们不要错过,可以下载做复习。
关于Day29.2 CTD数据库的思维导图,本专业和有兴趣的朋友们不要错过,可以下载做复习。
社区模板帮助中心,点此进入>>
Day2怎么学好生信
Day3.2文献泛读与精读技巧
Day4 2023 还能发的生信套路
Day5 GEO,TCGA 数据集入门
Day6 生信表型“热”在哪里?
Day7.1 genecard数据库
Day7生信常见图片讲解(1)
Day8 生信常见图片讲解(2)
Day8.2 技术路线图
Day9 生信常见图片讲解(3)
UALCAL数据库
简介
网址
https://ualcan.path.uab.edu/index.html
主要应用
轻松访问公共癌症组学数据库
允许用户鉴定生物标记物或对感兴趣的基因进行验证
提供蛋白质、miRNA、lincRNA基因的表达谱和患者生存信息的图表
评估启动子区甲基化对基因表达的表观遗传调控
进行泛癌基因表达分析
通过链接到外部数据库,提供有关基因/靶标的其它信息
DOI
10.1016/j.neo.2017.05.002
CPTAC分析
表达分析
磷酸化分析
泛癌分析
CBTTC分析
TCGA分析
癌症检索模式
可对3种不同分子类型进行分析
TCGA Gene Analysis
TCGA miRNA Analysis
TCGA lncRNA Analysis
根据癌症类型检索
根据基因检索
根据基因集检索
基因检索模式
甲基化分析
相关性分析
外部连接
HPRD
存储人类蛋白质信息相互作用信息的数据库
http://hprd.org/index_html
GeneCards
http://www.genecards.org/
TargetScan
miRNA靶基因预测的网站
http://www.targetscan.org/vert_71/
Pubmed-Center
论文搜索以及摘要
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/
HumanProteinAtlas
提供人类蛋白质的组织和细胞分布
https://www.proteinatlas.org/
OpenTarges
识别潜在的治疗药物靶点并确定其优先级
https://www.opentargets.org/
GTEx
健康人贡献的RNASeq信息
https://commonfund.nih.gov/gtex
Drugbank
提供详细的药物数据与药物靶向信息及其机制
https://go.drugbank.com/
功能基因集检索模式
根据Gene Class进行功能基因检索
根据Enter your gene symbol(s) 进行功能基因检索