导图社区 Day29.2 CTD数据库
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CTD数据库
简介
网址
http://ctdbase.org/
特点
可查找
可访问
互操作
可重用
功能
Chemical-Gene/蛋白质相互作用
Chemical-Disease关系
基因/Protein-Disease关系
数据库来源
化学物数据集
信号通路数据集
疾病数据集
暴露数据集
生物数据集
基因数据集
GO和表型数据集
解剖学数据集
文献数据集
Analyze模块
Batch Query(批量查询）
Set Analyzer(分析器设置)
My GeneVene(我的基因韦恩)
MyVene(我的韦恩)
VennViewer（韦恩查看器）
Download模块
1.点击Download/Data Files
2.点击Batch Query
3.点击Download
Search模块
模块检索方式
Keyword Quary检索模式
Advanced Search检索模式
Chemical
Basics展示化学物质的基本信息
Gene interaction展示化学物质有交互作用的基因列表及具体交互细解
Genes可查看有相互作用的基因列表
Diseases可查看与所选化学物质相关的疾病列表
Phenotypes可查看有相互作用的表型列表
Comps列举与目标化学物质产生相互作用基因组最具相似性的化学物质
Pathways可查看有相互作用的信号通路列表(仅显示P<0.01的部分)
GO可查看有相互作用的信号通路列表(仅显示P<0.01的部分
Exposure Studies 可查看相关暴露研究
Expoure Details可查看暴露研究明细
References:可查看与化学物质相关的参考文献
Gene
Basics基因基本信息
Chemical lnteractions:可查看与目的基因有交互作用的化学物质及具体作用类型
Chemicals: 可查看与目的基因有交互作用的化学物质列表
Diseases:可查看与目的基因有交互作用的疾病列表
Phenotypes: 可查看与目的基因有交互作用的表型列表
Gene lnteractions: 可查看与目的基因有交互作用的基因列表及交互网络
Comps:可查看与目的基因有共同交互网络的基因列表及化学物质
Pathways:可查看目的基因涉及的信号通路列表
GO可查看目的基因涉及的GO列表
Disease
Basics:可查看疾病基本信息
Chemica-Gene lnteractions: 可查看与目的疾病相关的化学物质-基因交互作用
Chemicals:可查看与目的疾病有交互作用的化学物质列表
Genes:可查看与目的有疾病交互作用的基因列表
Phenotypes:可查看与目的疾病有交互作用的表型列表
Comps:可查看与目的疾病有交互作用的基因列表及交互网络
Pathways:可查看目的疾病涉及的信号通路列表
References
Go
Basics:可查看GO术语基本信息
Genes:可查看本GO条目中涉及的基因
Diseases:可查看本GO条目中涉及的疾病
Pathways
Basics:信号通路基本信息
Gene: 可查看信号通路相关基因
Diseases: 可查看信号通路相关疾病
interactions
其他
暴露研究查询
暴露细节查询
暴露事件查询
暴露结局查询
暴露参考文献查询
物种查询
解剖学查询
