黏膜:包括上皮、固有层和黏膜肌层。上皮为较厚的未角化的复层扁平上皮,耐摩擦,有保护作用。在食管与胃贲门交界处,复层扁平上皮突然变成单层柱状上皮;固有层为致密结缔组织,内有食管腺导管;黏膜肌层由纵行肌组成。
黏膜下层:为厚的疏松结缔组织构成,内含食管腺,可分泌黏液经导管排入食管腔。黏膜和黏膜下层形成7~10条纵行皱襞,横切面呈星形。食物通过食管时,皱襞消失。
肌层: 上1/3段为骨骼肌,下1/3为平滑肌,中段为骨骼肌和平滑肌混合组成。其肌纤维的排列为内环形和外纵形两层。
外膜:由疏松的纤维组织构成,含有较大的血管、淋巴管和神经,它与食管周围的器官相连。