导图社区 生物化学与分子生物学-真核转录
生物化学与分子生物学-真核转录知识梳理,包括关键成分、起始、延长并加帽、终止并加尾、转录后加工修饰等等。
这是一篇关于医学遗传学-免疫缺陷的思维导图,详细解释了ABO血型系统的遗传基础,包括“IAB”、“IB”、“H”等基因和它们编码的“N-乙酰半乳糖胺转移酶”、“D-半乳糖转移酶”等蛋白质的功能。讨论了人类白细胞抗原(HLA)系统,这是一组位于人体有核细胞表面的抗原,与免疫应答、器官移植等多个方面密切相关。HLA系统包括多个基因群,如I类、Ⅱ类和Ⅲ类基因,它们在人体中发挥着不同的作用。
这是一篇关于医学遗传学-线粒体疾病的思维导图,介绍了线粒体疾病的多种类型,按照生化分类分为底物转运缺陷、底物利用缺陷、Krebs循环缺陷和电子传递缺陷。详细描述了几个具体的线粒体疾病案例。首先是Leber视神经菱缩(LHON),这是一个由于mtDNA中的复合体IND4亚基基因在第11778位点的碱基从G变为A导致的遗传性疾病。讨论了mtDNA点突变或缺失如何选择性地破坏胰岛β细胞,从而与糖尿病相关。
这是一篇关于医学遗传学-多基因疾病的思维导图,列出了精神分裂症的一些主要症状,包括联想障碍、情感淡漠情感不协调、意志活动减弱或缺乏、幻觉妄想和紧张症等。这些症状构成了精神分裂症的核心症候群,并且病人常常缺乏自知力。还提到了与这些基因相关的其他疾病,如青少年型糖尿病(I型DM)和哮喘。列出了与神经系统疾病相关的其他基因和疾病,如帕金森病(与PARK2、SNCA等基因相关)和阿尔兹海默症(与APP、PSEN1等基因相关)。
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真核转录
关键成分
RNApol
RNApolⅠ
定位:核仁
鹅膏蕈碱:耐受
转录产物:rRNA的前体45S rRNA
对应Ⅰ类启动子
Ⅰ类启动子富含GC碱基对,包括核糖体起始因子和上游启动子原件
RNApolⅡ
定位:核内
鹅膏蕈碱:敏感
转录产物:mRNA前体hnRNA,lncRNA,miRNA
对应Ⅱ类启动子
由TATA box+上游调控元件+起始元件组成,上游还存在CAAT盒、GC盒等特征序列
RNApolⅢ
鹅膏蕈碱:高浓度时敏感
转录产物:tRNA,5S rRNA,snRNA
对应Ⅲ类启动子
包括A盒、B盒、C盒
转录因子TF
相对应RNApol,TF分别称为TFⅠ、TFⅡ、TFⅢ
TFⅡD
TATA结合蛋白-TBP
TBP相关因子-TAFs
TFⅡA
辅助TBP-DNA结合,稳定TFⅡB-TBP与DNA复合物
TFⅡB
稳定TFⅡD-DNA复合物,结合RNApol
TFⅡE
解旋酶,结合TFⅡH
TFⅡF
促进RNApolⅡ结合及作为其他因子结合的桥梁
TFⅡH
解旋酶、作为蛋白激酶催化CTD磷酸化
起始
1||| TFⅡD的TBP结合TATAbox,并在TAFs协助下结合到启动子区
2||| TFⅡB与TBP结合,同时TFⅡB也与DNA结合
3||| TFⅡA可以稳定与DNA结合的TFⅡB-TBP复合体
4||| TFⅡB-TBP复合体与RNApolⅡ-TFⅡF结合,协助RNApolⅡ靶向结合启动子
5||| TFⅡE和TFⅡH加入形成闭合转录复合物
6||| TFⅡH发挥解旋酶活性,闭合转录复合体形成开放转录复合体,同时发挥蛋白激酶作用,催化RNApolⅡ羧基末段结构域CTD磷酸化,启动转录
延长并加帽
1||| 新生RNA链核苷酸长度为25~30个时,5'端加帽
7-甲基鸟嘌呤帽结构
2||| 合成60~70个核苷酸时,TFⅡE和TFⅡH释放,RNApolⅡ进入转录延长期,此后,大多数TF会脱离转录前起始复合物
终止并加尾
1||| 依赖修饰点(终止信号),修饰点对应序列会被转录出来,并被特异的核酸酶识别并切断
2||| 断端3'-OH加上polyA尾
转录后加工修饰
hnRNA剪切
内含子形成套索RNA被剪除
内含子在剪接接口处被剪除
剪接过程需经过两次转酯反应,过程没有能量的消耗
剪接体是内含子剪接场所
hnRNA分子有剪切和剪接两种模式
hnRNA分子可发生可变剪接
免疫球蛋白重链hnRNA
mRNA编辑
转录后加工,可以有多用途分化
rRNA剪接
真核rRNA前体经剪接形成不同类别的rRNA
45S rRNA存在自剪接机制
tRNA加工
tRNA加工包括核苷酸的碱基修饰
降解
正常转录物降解
1||| 依赖于脱腺苷酸化的mRNA降解
先去尾,再脱帽,再酶切
1||| 脱腺苷酸化酶进入环状结构,进行脱腺苷酸化反应
2||| 脱腺苷酸化酶脱离帽结构,使脱帽酶对帽结构进行水解
3||| mRNA被5'→3'核酸外切酶识别并水解
2||| 不依赖于脱腺苷酸化的mRNA降解
异常转录物降解
1||| 无义介导的mRNA降解
含有提前终止密码子的mRNA会被选择性清除
2||| 无终止降解
3||| 无停滞降解
4||| 核糖体延伸介导的降解等