Day20.2 KM plotter数据库

关于Day20.2 KM plotter数据库的思维导图，本专业和有兴趣的朋友们不要错过，可以下载做复习。

KM plotter数据库

• 简介
  • 网址：http://kmplot.com/analysis/
  • 网站通过Kaplan—Meier算法或者COX分析进行分析
• 使用教程
  • mRNA模块
    • 1.点击start KM plotter for 肿瘤名
    • 2.输入基因名，选择分组、预后指标和随访时间
    • 3.展示结果
  • 其他模块
    • mRNA RNA-seq模块
    • miRNA模块
    • 蛋白模块
    • DNA模块
• 其他
  • ROC-plotter
  • muTarget
  • Genotype检索
  • Target检索
  • TNM plot
    • 泛癌分析
    • 癌组织和正常组织差异基因表达水平比较
    • 癌组织、正常组织和转移组织差异基因表达水平比较
• 其他生存分析数据库
  • PrognoScan
    • http://dna00.bio.kyutech.ac.jp/PrognoScan/index.html
    • 需要引用PrognoScan: A new cdatabase for meta-analysis of the prognostic value of genes. Mizuno H,Kitadak, Nakaik, Sarai A. BMC Med Genomics.209 218.
    • 提供了分析图
      • 基因表达图
      • 表达直方图
      • P值图
      • Kaplan-Meier图
      • 生存时间图
      • 属性分布图
  • Oncolnc
    • 网址：http://www.oncolnc.org/
    • 需要引用Anaya J.2016.0ncoLnc: linking TCGA survival data to mRNAs, miRNAs, and ncRNAs,PeerJ Computer Science 2:e67.
    • 步骤
      • 1.输入基因名，点击submit
      • 2.选择癌肿-输入cutoff值
      • 3.下载结果
  • 其他生存分析在线工具
    • lnCAR
      • 网址：https://lncar.renlab.org/
      • explorer
        • 1.输入lncRNA
        • 2.analysis
      • My lncRNA
        • 1.选择肿瘤，输入lncRNA定位
    • GEPIA
      • 网址：http://gepia2.cancer-pku.cn/#index
    • UALCAN
      • 网址：https://ualcan.path.uab.edu/index.html
      • 需要引用
        • 10.1016/j.neo.2022.01.001
        • 10.1016/j.neo.2017.05.002
    • Cbioportal
      • 网址：http://www.cbioportal.org/
    • OncomiR
      • 网址：https://oncomir.org/
    • Breast Cancer Gene-ExpressionMiner
      • 网址：http://bcgenex.ico.unicancer.fr/BC-GEM/GEM-Accueil.php?js=1
    • MethSurv
      • 网址：https://biit.cs.ut.ee/methsurv/