导图社区 Day22 临床预测模型套路课题设计
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小儿常见病的辩证与护理
蛋白质
均衡饮食一周计划
消化系统常见病
耳鼻喉解剖与生理
糖尿病知识总结
细胞的基本功能
体格检查:一般检查
心裕济川传承谱
解热镇痛抗炎药
临床预测模型套路课题设计
核心构成
特定疾病中特定表型差异表达基因的鉴定
特征的筛选和模型的构建
临床预测模型的验证评价
生信中常见的表型
免疫
自噬
线粒体自噬
内质网应激
铁死亡
铁代谢
细胞焦亡
坏死性凋亡
缺氧
氧化应激
糖酵解
衰老
代谢
细胞干性
EMT
表观遗传(Eraser, Reader, Writer)
m1A
m5C
m6A
RNA 修饰基因(包括 m1A+m5C+m6A)
表型基因的来源
GeneCards 数据库(https://www.genecards.org/)
GSEA 数据库(https://www.gsea-msigdb.org/gsea/index.jsp)
已经发表的特定表型生信类文献
表型数据库
其他的模块
PPI 网络
富集分析
GO 和 KEGG 富集分析
基因集富集分析(GSEA)
基因集变异分
析(GSVA)
免疫浸润分析
基因改变分析
模型的验证和评价
基于高、低风险分组的 K-M 生存曲线和时间依赖 ROC 曲线
决策曲线分析(DCA)
校准曲线(calibration curve)
外部数据集验证
内部验证
特征的筛选
单因素 Cox 回归
多因素 Cox 回归
LASSO 回归
非负矩阵因子分解算法
随机森林算法
支持向量机递归特征消除(SVM-RFE)算法
列线图模型