导图社区 蛋白质的生物合成
这是一篇关于蛋白质的生物合成的思维导图。有特异性,除赖氨酸有2种tRNA合成酶,其他氨基酸各自对应一种氨基酰tRNA合成酶、有校正活性,能将错误氨基酸水解再换成对的
无菌术是针对微生物及其感染途径所采取的一系列预防措施。无菌术内容包括灭菌、消毒法、操作规则和管理制度。灭菌是指用物理或化学等方法,杀灭或除去所有致病和非致病微生物繁殖体和芽孢的方法。消毒则是指杀灭病原微生物和其他有害微生物,但并不要求杀灭所有微生物(如芽孢等)。
研究发现,肿瘤细胞会出现不同于正常细胞的代谢变化,同时肿瘤细胞自身可通过糖酵解和氧化磷酸化(OXPHOS)之间的转换来适应代谢环境的改变。2019年,Cancer Cell最新刊登了一篇文章,研究人员发现在禁食状态下使用二甲双胍可以显著抑制肿瘤生长,并提出PP2A-GSK3β-MCL-1通路可能是肿瘤治疗的新靶点
这是一篇关于创伤的思维导图。创伤(trauma)是机械因素引起人体组织或器官的破坏。加于人体的任何外来因素还包括高温、寒冷、电流、放射线、酸、碱、毒气、毒虫、蚊咬等所造成的结构或功能方面的破坏。创伤极为常见。
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蛋白质的生物合成
合成体系
mRNA
密码子
起始密码子
AUG:1.作为起始密码 2.作为甲硫氨酸的密码
终止密码子
UAA、UAG、UGA(U开头)
密码子特点
方向性
5’-3‘方向阅读
连续性
mRNA密码子之间没有间隔核苷酸,密码子连续阅读
插入或缺失1个或2个碱基,会引起阅读框架移动,称为移码
简并性
简并性:一种氨基酸可以被多种密码子编码,61种密码子有20种AA
为同一种氨基酸编码的各密码子称为同义密码子
同义密码子头两位碱基相同,第三位有差异
通用性
各种生物用同一套遗传密码
摆动性
tRNA的反密码子和mRNA密码子不严格遵守碱基互补配对
密码子的第三位和反密码子的第一位有碱基配对摆动
tRNA
一种tRNA只能结合一种氨基酸,一种氨基酸可以结合多种tRNA
-CCA-OH结合氨基酸形成氨基酰tRNA,mRNA结合反密码子
核糖体
rRNA和蛋白质
存在A位(氨基酰位)、P位(肽酰位)、E位(排出位)
蛋白质因子
IF(initial)起始因子
IF1
占据核糖体A位
IF2
促进fMet-tRNA(fMet)与小亚基结合,GTP酶活性
IF3
防止大小亚基过早结合
EF(extend)延长因子
EF-Tu(突进)
促进氨基酰tRNA进入A位,GTP酶活性
EFG(gogogo)
转位酶
EF-Ts(stimulate)
调节亚基,少考
eEF-2
真核生物转位酶活性
RF(release)释放因子
RF-1
识别UAA、UAG
RF-2
识别UAA、UGA
RF-3
协助RF-1、RF-2,使RF1、RF2与核糖体分离,GTP酶活性
eRF
真核生物识别终止密码子
参与蛋白质合成的能量物质
ATP、GTP
合成过程
氨基酸活化
氨基酸与对应tRNA结合,生成氨基酰tRNA
氨基酰tRNA合成酶催化
有特异性,除赖氨酸有2种tRNA合成酶,其他氨基酸各自对应一种氨基酰tRNA合成酶
有校正活性,能将错误氨基酸水解再换成对的
氨基酸羧基和tRNA的-OH以酯键连接
活化消耗一个ATP,两个高能磷酸建
需要特殊的起始氨基酰tRNA
真核生物
起始Met-tRNAi(Met)(i代表起始)
延长Met-tRNA(Met)
原核生物
起始fMet-tRNA(fMet)
f代表甲酰化,原核生物起始密码只能识别甲酰化的甲硫氨酸
翻译过程
翻译起始复合物的形成
核糖体大小亚基分离
mRNA(SD序列)与核糖体小亚基(16sRNA)结合
mRNA有SD序列(核糖体结合位点),可以被小亚基识别
fMet-tRNA(fMet)在IF-2的带领下(IF-1占领A位、IF-3防止结合)结合在核糖体P位
翻译起始复合物的形成(IF-2水解GTP使三种IF释放,大小亚基结合)
翻译的延长-核糖体循环
进位
氨基酰tRNA与GTP-EF-Tu结合成复合物进入A位,GTP水解
成肽
第一个肽键形成后,P位tRNA卸载氨基酸,二肽酰tRNA占据A位
转肽酶(肽酰转移酶)催化肽键形成
转肽酶是核酶的一种(本质RNA)
本质RNA的酶:转肽酶和核酶
在A位形成肽键
转位
P位tRNA进入E位脱落,A位肽酰tRNA进入P位,循环
EF-G催化核糖体转位
无GTP酶活性,但耗能(叫外卖)
翻译终止
RF识别终止密码子,释放肽链
识别UAA、UAG(1号AG)
识别UAA、UGA(2号GA)
合成后加工
肽链的折叠
分子伴侣
热激蛋白(Hsp)
伴侣蛋白
异构酶
蛋白二硫键异构酶
形成二硫键
肽脯氨酰基顺-反异构酶
脯氨酸弯折处折叠
肽链的肽键水解(一级结构)
N端水解
半数蛋白质的甲酰甲硫氨酸切除N-甲酰基保留甲硫氨酸
半数N-甲酰甲硫氨酸全切
N端含信号肽,成熟过程中被切除
C端修饰
肽链中氨基酸残基的化学修饰
磷酸化
丝氨酸、苏氨酸、酪氨酸(丝苏酪)
甲基化
赖氨酸、精氨酸、组氨酸、谷氨酸、天冬氨酸、天冬酰胺(来进组建+谷天酸+Asn)
乙酰化
赖氨酸、丝氨酸(二把手乙:莱斯国务卿)
羟基化
脯氨酸、赖氨酸
硒化
半胱氨酸
被硒化的半胱氨酸不同于硒代半胱氨酸(第21种氨基酸)
空间结构修饰(四级结构)
通过非共价键亚基聚合形成具有四级结构的蛋白质
新生肽链与辅基结合
抗生素抑制蛋白质合成
真核+原核均干扰(藤原拓海玩漂移)
伊短霉素
小亚基(伊元真小)
mRNA在核糖体上错位,阻止翻译起始复合物形成
嘌呤毒素
氨基酰tRNA类似物,占据A位(白嫖)
仅真核干扰(真白放(肥)比)
放线菌酮
大亚基
白喉毒素
eEF-2失活(eEF-2类似于EF-G)
蓖麻毒素
仅原核干扰
四环素
小亚基
链霉素
小亚基(小廉)
读码错误
氯霉素
组织肽酰转移、阻断延长
大观霉素
干扰病毒
干扰素
eEF-2失活
亚基
四姨脸小
四环素、伊短霉素、链霉素
大肥(放)绿(氯)比(蓖)