相关系数:剔除了两个变量量纲影响,标准化后的特殊协方差
Pearson's correlation皮尔逊相关系数,又称积差相关、积矩相关
Spearman’s Rank 斯皮尔曼秩相关系数:根据原始数据的排序位置进行求解,对原始变量的分布不做要求,属于非参数统计方法,又称“等级差数法”。
使用区别:
a) Pearson相关系数适用条件为两个变量间有线性关系、变量是连续变量、变量均符合正态分布。
b) 若上述有条件不满足则考虑用Spearman相关系数
c) 对于同一量纲数据建议Pearson,例如mRNA基因表达量数据,计算不同 mRNA表达量的相关系数;对于不同量纲数据,可考虑Spearman相关系数,例如mRNA表达量与某表型数据。
Kendall’s Tau 肯德尔秩相关系数:是一个非参数性质(与分布无关)的秩统计参数,是用来度量两个有序变量之间单调关系强弱的相关系数,它的取值范围是 [-1,1],绝对值越大,表示单调相关性越强,取值为 0 时表示完全不相关。
定义:原始的 Kendall 秩相关系数定义在一致/同序对 (concordant pairs) 和分歧/异序对 (discordant pairs) 的概念上。所谓一致对,就是两个变量取值的相对关系一致;分歧对则是指它们的相对关系不一致。(C:同序对;D:异序对。