异种抗原：指来源于不同种属的抗原性物质。比如病原微生物及其产物如外毒素，植物蛋白，治疗用动物抗血清及异种器官移植物。
用于临床治疗的马血清抗毒素，具有双重效应：
1.既是特异性抗原，可中和外毒素。对机体有利
2.又是异种抗原，导致超敏反应，对机体有害
同种异型抗原，指同一种属不同个体间所存在的不同抗原亦称同种抗原。如最常见的输血反应。
自身抗原：某些病理情况下，使自身组织细胞抗原发生改变和修饰，或外伤导致的免疫隔离抗原的释放，可使自身成分变成自身抗原，诱导机体产生自身免疫应答。隐蔽的自身抗原：精子蛋白，眼球晶体蛋白，甲状腺球蛋白。例如交感性眼炎。
异嗜性抗原：指存在于人，不同种属动物，微生物，植物等之间的共同抗原。
