第四章基因组测序与序列组装

这是一篇关于第四章基因组测序与序列组装的思维导图，主要内容包括：4.5 人类基因组测序与组装，4.4 基因组测序的其他路线，4.3 序列组装，4.2 基因组测序，4.1 DNA测序的方法。

第四章基因组测序与序列组装

• 4.1 DNA测序的方法
  • （1）链终止法 （2）化学降解法
    • 4.1.1 第一代DNA测序
      • 链终止法
      • 链终止法的技术要点
      • 双脱氧核糖核苷酸
      • 链终止法测序对DNA聚合酶的要求
      • T7 DNA聚合酶
      • Taq DNA聚合酶
      • 引物的序列决定了DNA测序的起点
      • 自动化测序
      • 荧光染料标记物
      • 毛细管电泳
    • 4.1.2 第二代DNA测序
      • 焦磷酸测序
    • 4.1.3 第三代DNA测序
      • 单分子DNA实时测序
      • 零模式波导测序平台
      • 纳米孔DNA实时读序平台
      • 纳米孔蛋白质
      • 固相纳米孔硅片
      • 碱基电子阅读
      • 纳米孔DNA分子移动速率的控制
• 4.2 基因组测序
  • 4.2.1 基因组测序的策略
  • 4.2.2 基因组测序的覆盖面
  • 4.2.3 序列间隙与物理间隙
  • 4.2.4 插入片段的两端测序
• 4.3 序列组装
  • 4.3.1 作图法测序与序列组装
  • 4.3.2 鸟枪法测序与序列组装
  • 4.3.3 不同测序路线与序列组装的策略的比较
    • 流感嗜血杆菌基因组测序与序列组装
    • 果蝇基因组的鸟枪法测序
    • 水稻基因组测序
    • 玉米基因组测序
    • 鸟枪法测序的优势与局限
    • 序列组装的分期标准
• 4.4 基因组测序的其他路线
  • 4.4.1 重要区域的优先测序
  • 4.4.2 EST测序
  • 4.4.3 共栖/共生生物基因组测序
  • 4.4.4 单细胞DNA测序
    • 单细胞DNA扩放酶--Phi29
• 4.5 人类基因组测序与组装
  • 4.5.1 人类基因组的测序策略
    • 人类基因组的草图序列与完成序列
    • 人类参考基因组
  • 4.5.2 人类基因组测序的伦理学问题
  • 4.5.3 人类基因组测序计划相关的重大事件