导图社区 氨基酸
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氨基酸
结构
元素组成
C、H、O、N、S等
结构通式
标准氨基酸
有20种
为L-α氨基酸(甘氨酸除外)
非标准氨基酸
血管收缩
组胺
胶原蛋白
4-羟脯氨酸
凝血蛋白
γ-羧基谷氨酸
有密码子,组成蛋白质
吡咯赖氨酸
硒代半胱氨酸
尿素合成
鸟氨酸
瓜氨酸
神经递质
γ-氨基丁酸
细菌,真菌
D-氨基酸
英文
Gly
甘氨酸
不含手性碳
Ala
丙氨酸
Leu
亮氨酸
Ile
异亮氨酸
Val
缬氨酸
Pro
脯氨酸
Met
甲硫氨酸
原核生物生物合成起始氨基酸
Ser
丝氨酸
含羟基
酶的活性部位
Asn
天冬酰胺
Gln
谷氨酰胺
Phe
苯丙氨酸
Tyr
酪氨酸
酚羟基
Trp
色氨酸
Thr
苏氨酸
Asp
天冬氨酸
Glu
谷氨酸
Arg
精氨酸
Lys
赖氨酸
His
组氨酸
Cys
半胱氨酸
二硫键
巯基
类别
极性
酸性
谷氨酸、天冬氨酸
古天(乐)
中性
苏、谷、丝、半、天
苏姑娘死半天
碱性
赖、精、组
非极性(疏水)
芳香族
苯、酪、色
本来就色
脂肪族
缬、异、亮、丙、甘、脯、蛋
携一两个饼干孵蛋
层析
相关概念
固定相
结合在支持介质上不流动的水
流动相
穿过支持介质的流动溶液
原理(根据氨基酸溶解度差划分)
具体原理:待分离的不同组分在流动相和固定相之间分配系数的差异
分配柱层析
所需介质
淀粉、纤维素、硅胶
纸层析
介质
滤纸
Rf(相对迁移率)
Rf=离开原点的距离/溶剂前沿的距离
薄层层析
粉状介质
离子交换柱层析
原理
疏水作用大,静电引力强,结合能力强
离子交换树脂
举例
PH=3时,氨基酸质子化,因为碱性氨基酸本身带正电(如NH4+),比酸性氨基酸带正电多,所以碱性氨基酸比酸性氨基酸后洗脱。
液相色谱
HPLC(高效液相色谱)
FPLC(快速蛋白质液相色谱)
理化性质
酸碱性质
等电点(pI)
pH与pI的关系
pH>pI
负电
向正极
pH=pI
不带电
不移动
pH<pI
正电
向负极
计算公式
酸性pI<7,碱性pI>7
解离
α-氨基(碱性)
α-羧基(酸性)
化学反应
Sanger反应
α-氨基+DNFB→DNP-AA(黄色)
简单记忆方程式,了解大致过程
Edman反应
α-氨基+PITC→PTH-AA
茚三酮反应
反应基团
氨基,羧基
颜色
蓝紫色
黄色(Pro)
应用
测氨基酸含量
原理:在一定浓度内,吸光率与氨基酸含量成正比
三种反应对比
巯基反应
半胱氨酸(Cys)
断裂二硫键
氧化法
过氧酸
还原法
β-巯基乙醇
防止形成二硫键
碘乙酸
形成沉淀
与重金属反应
紫外吸收
公式
A=εcl
各单位概念
ε
摩尔消光系数
l
比色标光径
cm
c
溶液浓度
mol/L
苯,酪,色
吸光度
280nm
注意核酸为260nm
大多数蛋白质含有酪,色残基,可以根据酪,色残基含量来分析溶液中蛋白质含量。
知乎@小谷同学
b站@别抱cc
小红书@是个泡泡
小技巧: 如果pH<pI(pI=7),可认为处于酸性环境,则吸引质子,就带正电,所以向负极移动。 pH>pI同理。
记忆三字符
口诀: 1.Trp色氨酸 “踢他的屁股” 2.Glu谷氨酸 “GU谷” 3.Lys赖氨酸 “Lai赖” 4.Cys半胱氨酸 “C为O的一半” 5.Ser丝氨酸 “Si丝” 6.Pro脯氨酸 “Pu脯”