组学与系统生物医学

这是一篇关于组学与系统生物医学的思维导图。包含基因组学、转录物组学、蛋白质组学、代谢物组学、其他组学、系统生物医学及其应用。

组学与系统生物医学

• 基因组学
  • 结构基因组学
    • 内容
      • 基因作图和大规模测序
        • 遗传作图和物理作图绘制人类基因组草图
        • EST文库方法绘制转录图谱
        • BAC克隆系和鸟枪法测序绘制序列图谱
      • 构建人类基因组图谱
        • 物理图谱
          • 杂交图、限制性酶切图、克隆系图
        • 遗传图谱
          • 连锁图
        • 转录图谱
          • 又称cdna图谱或表达图，是一种以表达序列标签为未标绘制的分子遗传图谱。
        • 序列图谱
          • 基因组组装
    • 意义
      • 通过HGP的实施，解析人类自身DNA的结构与序列
  • 功能基因组学
    • 研究内容
      • 基因组的表达、基因功能注释、基因组调控网络表达及机制的研究
    • 意义
      • 整体水平-一种组织或细胞-同一时间或同一条件-表达基因的种类、数量、功能/同一细胞在不同状态下基因表达的差异
      • 同时对多个基因或蛋白进行研究
    • 探讨基因的活动规律
      • 全基因组扫描dna序列中的基因
      • BLAST等程序搜索同源基因
      • 实验验证基因功能
      • 转录物组和蛋白质组描述基因表达模式
  • 比较基因组学
    • 种间比较基因组学
      • 阐明物种进化提供依据
    • 种内比较基因组学
      • 根据基因的同源性预测相关基因的功能
  • ENCODE计划
• 转录物组学
  • 定义
    • 整体水平上研究细胞编码基因（编码rna和蛋白质）转录产生的全部转录物的种类、结构和功能及其相互作用的学科。
  • 全面分析基因表达谱
    • 大规模基因表达谱分析和功能注释
  • 整体性分析
    • 微阵列
    • SAGE
    • MPSS
  • 转录物组测序和单细胞转录物组分析
    • 前者：获得基因表达调控信息的基础
    • 后者：解析单个细胞行为的分子基础
• 蛋白质组学
  • 研究内容
    • 结构蛋白质组学
    • 功能蛋白质组学
  • 蛋白质鉴定
    • 种类和结构鉴定
    • 翻译后修饰鉴定
  • 蛋白质功能确定
    • 鉴定基本功能特性
    • 蛋白质相互作用研究
  • 常用技术
    • 二维电泳、液相分离、质谱
• 代谢物组学
  • 任务
    • 分析生物/细胞代谢产物的全貌-主要为生物液体
  • 四个层次
    • 代谢物靶标分析
    • 代谢谱分析
    • 代谢组学
    • 代谢指纹分析
  • 分析工具
    • 核磁共振、色谱、质谱
  • 生物医学领域有广阔应用前景
• 其他组学
  • 糖组学
    • 结构和功能糖组学
    • 分析技术
      • 色谱分离/质谱鉴定技术
      • 糖微阵列技术
      • 生物信息学
    • 与肿瘤关系密切
  • 脂组学
    • 代谢组学的分支
    • 三大步骤
      • 样品分离
      • 脂质鉴定
      • 数据库检索
    • 促进脂质生物标志物的发现和疾病诊断
• 系统生物医学及其应用
  • 整体性为特征的一种整合科学
  • 分子医学是发展现代医学学科的重要基础
  • 精准医学是实现个体化医学的重要手段
  • 转化医学是加速基础研究实际应用的重要途径