诉讼的目的和任务不同。 民事诉讼的处理对象是民事争议，目的和任务是通过审理民事案件解决民事争议。确认民事权利义务关系，制裁民事违法行为。保护以财产关系为核心的民事权利，维护民事主体的合法权益。维护国家正常的民事法律秩序。 行政诉讼的处理对象为行政争议，目的和任务是通过司法机关对行政主体行政行为的合法性进行审查，从而一方面保护公民法人或者其他组织的行政相对的合法权益。另一方面，监督行政机关依法行政，保证国家的行政权合法运行，维护国家正常的行政法律秩序。
诉讼当事人不同。 民事诉讼中原被告的资格是不固定的，这是由于民事法律关系中主体双方的法律地位是平等的，而行政诉讼则相反。
诉讼权利不同。起诉权，处分权。民事诉讼中原被告都有，行政诉讼中被告没有。
举证责任不同。 诉讼当事人双方都负有举证责任，这是两者的共同之处。但在举证责任的分配上，二者存在这差异。民事诉讼实行“谁主张谁举证。” 行政诉讼中，行政机关的举证能力比作为原告的行政相对人更优越。
二者所适用的原则不同。 行政诉讼遵循以下特殊原则，1.行政诉讼与行政复议印象。链接司法最终裁判的原则2.行政诉讼一般不送用于调节的原则3.行政诉讼实行有限变更原则。4.人民法院实行特定的管辖原则。5.人民法院对行政行为实行合法性审查的原则。
诉讼范围不同。 民事诉讼的范围广泛而又复杂，除了适用普通程序和简易程序的各种权益争议案件外，还有适用特别程序的非权益争议的案件。而行政诉讼的范围相对来说较为狭小。
结案方式不同。 民事诉讼中，人民法院审理和解决民事案件的结案方式通常有三种:调解结案，判决结案和裁定结案。 而在行政诉讼中，人民法院审理的行政案件一般不用调解的方式结案，主要用裁定或判决的方式结案。
