导图社区 第三章 蛋白质化学
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第三章 蛋白质化学
基本概念
蛋白质:由氨基酸通过肽键连接成的高分子含氮化合物
蛋白质的元素组成:主要为C、H、O 、N 、S
蛋白质的基本单位:氨基酸(由20种氨基酸组成)
氨基酸:含有氨基的羧酸
氨基酸
构型:除甘氨酸外,其它蛋白质氨基酸的α-碳原子均为不对称碳原子
常见20种氨基酸的分类
(1)按R基团的结构分:脂肪族氨基酸、芳香族氨基酸、杂环氨基酸、杂环亚氨基酸
(2)按R基团的结构极性分:极性、非极性氨基酸
(3)按氨基酸的酸碱性分:中性、酸性、碱性氨基酸
酸性氨基酸: 天冬氨酸、谷氨酸
碱性氨基酸:精氨酸、赖氨酸、组氨酸
中性氨基酸:其它
(4)按营养状况分:必需氨基酸和非必需氨基酸
重要性质
物理性质:无色结晶,在晶体或溶液中以两性离子状态存在;熔点很高,旋光性不同 (除甘氨酸),吸收光谱有差异.......
吸收光谱:Trp、Tyr和Phe可吸收280nm附近的光,其他氨基酸不吸收可见光
两性性质:氨基酸具有酸碱性质,是一类两性电解质
pI:氨基酸所带静电荷为“零”时,溶液的pH值称为该氨基酸的等电点,以 pI 表示
当溶液的pH=pI 时,氨基酸主要从两性离子形式存在
当溶液的pH<pI 时,氨基酸主要以正离子形式存在。
当溶液的pH>pI 时,氨基酸主要以负离子形式存在。
氨基酸等电点计算口诀
中性氨基酸:pI=(pK1+pK2)/ 2
碱性氨基酸:pI=(较大两个pK之和)/ 2
酸性氨基酸:pI=(较小两个pK之和)/ 2
重要化学反应
(1) 茚三酮反应
(2) 亚硝酸反应
(3) 二硝基氟苯反应(Sanger反应)
(4) 异硫氰酸苯酯反应(Edman反应)
(5) Dansyl-cl反应
肽
定义:由两个或两个以上氨基酸通过肽键连接形成的化合物
蛋白质
定义:当多肽的分子量大到足够具有一定的空间结构时就可视为蛋白质
一级结构(初级结构):指蛋白质多肽链中氨基酸的排列顺序,主要连接键是肽键,也存在部分二硫键
空间结构基础
作用力:次级键,包括氢键、疏水力、离子键、范德华力、配位键、酯键等
酰胺平面与肽单元
二级结构
定义:多肽链主链由于氢键的作用形成的空间排布(即主链本身的折叠和盘绕方式)
类型:α-螺旋、β-折叠、β-转角、γ-转角、无规卷曲
超二级结构
定义:指相互邻近的二级结构单元(α-螺旋,β-折叠等)组合在一起,彼此相互靠近,形成在空间上能够辨认、有规则的二级结构组合体
类型:αα,βxβ,β-曲折,β-折叠筒等
模体motif:指的是由2个或3个具有二级结构的肽段,在空间上相互接近,形成一个特殊的空间结构。
结构域domain:指在较大的球状蛋白质分子或亚基中,其三维结构往往可以形成两个或多个空间上可以明显区别的区域,这种相对独立的三维实体称为结构域。
三级结构
指在二级结构基础上,多肽链再进一步折叠盘绕成更复杂的三维空间结构,主要靠非共价键(氢键、离子键、疏水键、二硫键)来维持。可理解为:二级结构单位集合组成三级结构
四级结构
指寡聚蛋白中各亚基的立体排布和各亚基间的相互作用。可理解为蛋白质的亚基聚合成大分子蛋白质的方式(亚基是指寡聚蛋白中每一条具有三维结构的多肽链,是蛋白质分子的最小共价单位)。注:单链蛋白没有四级结构。
纤维状蛋白质与球状蛋白质:分子轴比大于10为纤维状蛋白,小于10则为球状蛋白
重点:蛋白质的结构和功能,结构与功能的关系,氨基酸的分类及性质