进行结构研究之前，必须对该成分的纯度进行确认，一般常用各种色谱法（薄层色谱、纸色谱）进行纯度检验
中药有效成分的理化鉴定
物理常数的测定
测定的物理常数包括熔点、沸点、比旋度、折光率和比重
分子式的确定
最常用的是质谱法（mass spectrometry,MS)。高分辨质谱法（high resolution mass spectrometry,HR-MS）不仅可给出化合物的精确分子量，还可以直接给出化合物的分子
在没有条件测定其高分辨质谱时，也可通过质谱中出现的同位素峰的强度推定化合物的分子式
化合物的结构骨架与官能团的确定
在决定了一个化合物的分子式后，就需要进行分子结构骨架和官能团的确定。一般首先计算出化合物的不饱和度，推测出结构中可能含有的双键数或环数。用化学法推定分子结构骨架主要依靠各类中药化学成分的呈色反应
紫外（UV）光谱的测定仅需要少量的纯样品，这对于中药化学成分的研究是非常有利的。一般来说，UV 光谱主要提供化合物分子中共轭体系的结构信息可据此判断共轭体系中取代基的种类、位置和数目
红外光谱（IR）的测定范围通常在 4000~500cm ，其中 4000 ~ 1333cm 为特征区，1333~500cm 为指纹区。如果被测定物是已知物，与已知对照品红外光谱完全一致，则可推测是同一物质。如无对照品也可检索有关红外光谱数据图谱，主要用于官能团的确认类型的判断等
核磁共振谱（NMR）是化合物分子在磁场中受电磁波的辐射，有磁矩的原子核吸收能量产生能级跃迁，即发生核磁共振，以吸收峰的频率对吸收强度作图而得的图谱。它能提供分子中有关氢原子和碳原子的类型相互相连接方式，周围化学环境以及构型、构象信息
H-NMR 技术能提供的结构信息参数主要是化学位移（8)、偶合常数（J）及质子数目
C-NMR提供的结构信息是分子中各种不同类型及化学环境的碳核化学位移、异核偶合常数（Jan）及驰豫时间（T)，其中利用度最高的是化学位移
新的离子源不断出现，质谱在确定化合物分子量，官能团、辨认化合物类型、推导碳骨架等方面发挥着越来越重要的作用
其他结构鉴定方法
旋光光谱在测定手性化合物的构型和构象、确定某些官能团（如羰基）在手性分子中的位置方面有独到之处
圆二色光谱
旋光性化合物的摩尔吸光系数是不同的，这种现象称为圆二色性
运用CD 谱研究有机化合物的构型或构象，得出的结论与 ORD 是一致的，且 CD 谱比较明确，容易解析，CD谱在鞣质结构研究中已经成为常规方法
X射线单晶衍射法（X-ray single crystal diffraction,XRD）简称为X射线衍射法
X射线单晶衍射法不仅能测定化合物的一般结构，还能测定化合物结构中的键长、键角、构象、绝对构型等结构，是测定大分子物质结构最有力的工具
样品在两种以上展开系统中或在正相和反相两种色谱法中在有效的R，值范围内均显示单一斑点，一般方可确认其为单体化合物
气相色谱或高效液相色谱等色谱法也常用于判断物质的纯度，但气相色谱只适用于一定条件下能够气化而不分解的物质，高效液相色谱需预判化合物的结构类型
液体物质还可通过测定沸点沸程、折光率及比重等推测其纯度。结晶样品的熔距为0.5~1.0℃、液体样品的沸程在5℃以内
对已知化合物来说，无论是固体还是液体物质，如其比旋度与文献数据相同，则表明其已是或接近单体成分
