核酸代谢、蛋白质代谢

生化之核酸与蛋白质代谢思维导图，主要包括核酸的酶促降解和核苷酸代谢、蛋白质的酶促降解和氨基酸代谢两部分内容。

蛋白质与核酸代谢

• 蛋白质的酶促降解和氨基酸代谢
  • 蛋白质的酶促降解
    • 蛋白水解酶
      • 肽酶
        • 定义
          • 肽链外切酶，可分别从多肽 链的游离羧基端或游离氨基端逐个水解AA的E
        • 氨肽酶
          • 从多肽链氨基端逐个水解AA的E
        • 羧肽酶
          • 从多肽链羧基端 逐个水解AA的E
          • 羧肽酶 A：水解除（Arg、 Lys、Pro） 外的AA为羧基末端的肽键
          • 羧肽酶 B：水解碱性AA（Arg、 Lys）为羧基末端的肽键
      • 蛋白酶
        • 定义
          • 又称肽链内切酶， 它能水解肽链内部的肽键，使蛋白质多 肽链水解为许多小肽段
        • 种类
          • 胃蛋白酶
          • 胰凝乳蛋白酶
          • 胰蛋白酶
          • 嗜热菌蛋白酶
          • 溴化氰（非酶）
    • 食物中蛋白质的消化吸收
    • 细胞内蛋白质降解
      • 意义
        • 异常蛋白的清除
        • 短命蛋白的清除
        • 维持体内氨基酸代谢库
        • 防御机制组成部分
        • 蛋白质前体的裂解加工
      • 降解系统
        • 溶酶体
          • 无选择性
            • 食物中摄取的蛋白质
            • 膜蛋白
            • 长命蛋白
        • 泛素
          • 有选择性
            • 异常蛋白质
            • 短命蛋白
          • 细胞自噬
  • 氨基酸的分解与转化
    • 脱氨基作用
      • 氧化脱氨基作用
        • L－AA氧化E
        • D－ AA氧化E
        • 谷氨酸脱氢E
          • 子主题
      • 转氨基作用
        • 转氨作用
          • 转氨酶
            • 谷丙转氨酶（GPT）
            • 谷草转氨酶（GOT）
      • 联合脱氨基作用
        • 转氨E－谷氨酸脱氢E的联合脱氨作用
          • 肝和肾
        • 转氨E－嘌呤核苷酸循环联合脱氨作用
          • 心肌、骨骼肌、脑
      • 非氧化脱氨基作用
        • 大多数在微生物中进行
        • 还原脱氨基作用
        • 脱水脱氨基作用
        • 直接脱氨基作用
      • 脱酰氨基作用
    • 脱羧基作用
      • 直接脱羧基作用
        • 简介
          • AA脱羧E广泛存在于生物体内，以磷酸 吡哆醛为辅酶
        • 种类
          • Glu脱羧
            • • γ-氨基丁酸
          • Ser的脱羧
          • Lys、鸟氨酸的脱羧
      • 羟化脱羧基作用
        • • 黑色素
    • AA降解产物的去向
      • 氨的代谢转变
        • 重新合成AA
        • 生成酰胺
        • 生成铵盐
        • 经鸟氨酸循环，合成尿素，排出体外
          • 氨的主要去路
          • 鸟氨酸循环
      • α-酮酸的代谢转变
        • 还原氨基化－－合成新AA
        • 彻底氧化为CO2和H2O（TCA循环和ETS）
          • 碳骨架的氧化
            • • 生糖AA
              • 生酮AA
              • 生糖兼生酮AA
        • 转变为糖和脂肪（TCA循环的中间产物）
        • 脱羧基产物的转化
  • 氨基酸的生物合成
    • 氨基化作用
      • • 氨的来源
          • 分解代谢
          • 生物固氮
            • 意义
              • 不需高温高压，节约能源，不污染环境； 生物固氮可以为农作物提供氮肥
              • 固氮酶结构（多功能酶）
                • 铁蛋白 + 钼铁蛋白 二者结
              • 固氮酶催化的反应及反应条件
                • 反应
                • 条件
                  • 电子供体 NADPH
                  • ATP 还原1mol N2 需消耗16molATP
                  • 厌氧环境
          • 硝酸盐的还原作用
            • NR（硝酸还原酶）
            • NiR （亚硝酸还原酶）
      • 氨的同化（氨基化作用）
        • Glu合成途径 Glu 其它AA
          • Glu脱氢酶途径（异养真核生物）
          • GS－GOGAT途径（高等绿色植物）
        • 氨甲酰磷酸的合成
          • 氨甲酰磷酸合成EⅠ
          • 氨甲酰磷酸合成E Ⅱ
      • 转氨基作用
      • 各族AA的合成
        • • 丙氨酸族
          • 丙氨酸族
          • 天冬氨酸族
          • 谷氨酸族
          • 组氨酸和芳香氨基酸族
  • 氨基酸与一碳基团代谢
• 核酸的酶促降解 和核苷酸代谢
  • 核酸的酶促降解
    • 核酸E
      • 按底物分
        • DNA酶
        • RNA酶
      • 按作用方式分
        • 核酸外切酶
        • 核酸内切酶
          • 限制性内切酶
            • 定义
              • 细菌内存在的一类能识别水解外 源双链DNA的核酸内切酶
            • 特点
              • 有极高的专一性
              • 识别位点，这些位点 一般在4-8bp，通常具回文结构
              • 切割后形 成粘性末端（或平齐末端）
            • 基因编辑技术
        • 核酸内切兼外切E
    • 核苷酸的降解
      • 核苷酸的降解
      • 嘌呤的降解
        • • 痛风
      • 嘧啶的降解
  • 核苷酸的合成代谢
    • 核糖核苷酸的合成
      • 嘌呤核苷酸的合成
        • “从头合成”途径（肝脏、小肠粘膜、胸腺）
          • 特点
            • 5-磷酸核糖-1-焦磷酸（PRPP）是核 苷酸中核糖磷酸部分的供体
            • 嘌呤的各个原子是在PRPP的C1位置 上逐渐加上去的。其关键步骤是从PRPP和 Gln形成5-磷酸核糖胺。在这个反应中，C1 从a-构型转变为 β-构型
            • 嘌呤核苷酸的合成是直接形成次黄嘌 呤核苷酸（IMP，又称肌苷酸），然后才 转变为其它嘌呤核苷酸。
          • 调节
            • 关键酶
              • PRPP合酶(PRPP激酶)
              • 酰胺转移酶
            • 调节剂
        • 补救途径（脑和骨髓）
      • 嘧啶核苷酸的合成
        • “从头合成”途径（肝细胞细胞质）
          • 尿嘧啶核苷酸的合成特点
            • 氨甲酰磷酸以Gln作为氨的供体，氨甲酰 磷酸合成酶催化合成
            • 氨甲酰磷酸和Asp合成氨甲酰天冬氨酸， 闭环氧化生成乳清酸（嘧啶环）
            • 乳清苷酸脱羧后生成UMP
          • 调节
        • 补救途径
    • 脱氧核糖核苷酸的合成
      • 核糖核苷酸的还原
      • dTMP 的合成