生化第三章氨基酸

氨基酸思维导图，包括：氨基酸定义、氨基酸分类、氨基酸的酸碱化学、氨基酸的化学反应、氨基酸的光学活性和光谱性质、氨基酸混合物的分析分离。

第三章氨基酸

• 20种氨基酸的名称，简写和结构 氨基酸侧链的化学反应
• 氨基酸
  • 蛋白质的水解
    • 酸水解
      • 最多17种
      • 脱酰胺
      • 色氨酸分解
    • 碱水解
      • 消旋 精氨酸脱氨
    • 酶水解
      • 水解a羧基端的酰胺键
      • 用于一级结构分析
      • 胰蛋白酶
      • 糜蛋白酶
        • 胰凝乳蛋白酶
      • 胃蛋白酶
  • a氨基酸一般结构
    • 19 L氨基酸
    • 共性，特性
      • 酪氨酸和胱氨酸不溶于水
    • 氨基酸残基
    • a氨基酸作为蛋白质的构建分子
      • 酰胺键的形成
      • L型氨基酸自然选择
  • 能给出质子的为酸，能接受质子的为碱
• 氨基酸分类
  • 常见蛋白质氨基酸
    • R基的化学结构
      • 脂肪族
        • 中性氨基酸
        • 含羟基氨基酸
        • 含硫氨基酸
        • 酸性氨基酸
        • 碱性氨基酸
      • 芳香族
        • 苯环共轭π键系统
          • 最大光吸收波长Trp＞Tyr＞Phe
          • 近紫外区有吸收光的能力
      • 杂环族
    • 含两个手性碳原子
      • Thr Ile
    • 肽聚糖短肽之间的连接，碱性最强的蛋白质氨基酸、脯氨酸有特殊的刚性结构
    • 活性中心出现多
      • ser lys
    • 最接近生理PH
      • 组氨酸在生理ph下，既可以接受质子，又可以供给质子
    • 酪氨酸激酶
    • 巯基还原性，极性很强
    • 亚氨基酸
      • 脯氨酸
    • 三种重要的个性氨基酸
      • 脯氨酸
        • 是一种阿尔法亚氨基酸
      • 甘氨酸
        • 在肽链中不与其他氨基酸残基的侧链发生作用，不会产生任何位组现象，在空间结构的形成中有特定作用
      • 半胱氨酸
        • 以胱氨酸的形式在蛋白质中存在
  • 蛋白质氨基酸衍生物
    • 蛋白质合成后，经辅酶作用改变其侧链形成的氨基酸
    • 羟脯氨酸，羟赖氨酸
      • 胶原蛋白分子中
    • 磷酸丝氨酸
    • 焦谷氨酸
    • 甲状腺素
      • 酪氨酸的衍生物
    • y羧基谷氨酸
      • 凝血酶原中
    • 硒代半胱氨酸
      • 蛋白质合成期间掺入，不是合成后修饰的
        • 存在于少数蛋白质中
      • 由ser衍生而来
  • 非蛋白质氨基酸
    • 氨基酸中间代谢产物
    • 伽玛—氨基丁酸
      • 谷氨酸脱羧
        • 神经递质
    • 贝塔-丙氨酸
      • 泛素的前体
    • L-阿尔法氨基酸衍生物
      • 瓜氨酸，鸟氨酸
        • 精氨酸生物合成和尿素循环中间物
    • D-氨基酸
• 氨基酸的酸碱化学
  • 氨基酸的兼性离子形式
    • 等电点
  • 氨基酸的解离
    • 带电状况和ph的关系。
  • 氨基酸的等电点的确定
    • 中性氨基酸，pa1和pka2的算术平方根
      • Tyr酚羟基弱酸性也按这种算
    • 酸性氨基酸
      • 两个最小的
        • 半胱氨酸巯基弱酸性
    • 碱性氨基酸
      • 两个最大的
    • 解离顺序
  • 氨基酸的甲醛滴定
    • 测定氨基酸的一种常用方法，定量
• 氨基酸的化学反应
  • a氨基参与的
    • 和亚硝酸反应
      • 生成氮气
        • 氨基酸定量
    • 和酰化试剂反应
      • 生成酰胺键
        • 肽和蛋白质人工合成中保护氨基
    • 烃基化反应
      • sanger测末端氨基酸原理
        • 和DNFB反应，得到DNP氨基酸，不过会导致肽键断裂
          • 层析法鉴定
      • edman测小肽序列
        • 和PITC反应，最终成PTH氨基酸，会脱去一个Aa，可以测60-70AA的氨基酸序列
          • 多肽顺序自动分析仪
            • 层析法鉴定
      • DNS反应
        • DNS-Cl反应，生成DNS—氨基酸，DNS发荧光
    • 成西佛碱反应
      • 游离的氨基和醛反应生成西佛碱弱碱
        • 酶促反应中间产物
    • 脱氨基反应
      • 成酮酸
  • a羧基参与的
    • 成盐成酯反应
      • 保护羧基，和碱或醇反应
    • 成酰氯反应
      • 需要事先保护氨基生成氨基酰氯
        • 肽的人工合成
    • 成酰胺反应
      • 形成氨基酰胺
        • 两种酰胺
    • 脱羧基反应
      • 剩下来胺类化合物
    • 叠氮反应
      • 肽的人工合成
  • a氨基和a羧基共同参与反应
    • 茚三酮反应
      • 检测和定量氨基酸
      • 生成紫色物质，570nm定量测量定性？？。co2定量
        • 定性和定量
      • 脯氨酸（羟脯氨酸）和茚三酮
        • 生成亮黄色产物
          • 440nm
        • 不释放NH3
      • 原理为氧化脱羧作用
    • 成肽反应
  • R基参与的反应
    • 侧链官能团参与的某些反应是蛋白质化学修饰的基础
    • 酪氨酸
      • 米伦氏反应
    • 酪氨酸的酚基
      • pauly反应
        • 与对氨基苯磺酸的重氮盐结合成橘黄色的化合物
    • 精氨酸的胍基
      • 氨基酸序列分子蛋白质结构功能研究
    • 组氨酸
      • pauly反应
    • 色氨酸
      • 乙醛酸反应
    • 色氨酸吲哚基
      • 分光光度法测蛋白质中色氨酸含量
    • 半胱氨酸的巯基
      • 开环对氨基酸序列测定有用，保护肽链巯基，防止重新氧化成二硫键
      • 贝塔，巯基乙醇破坏二硫键
      • 与Allman试剂反应，在ph8，412nm处有光吸收，用分光光度法定量测定巯基
    • 苯丙氨酸
      • 黄色反应
    • 谷氨酸的羧基可以由ATP活化
      • 形成谷氨酰磷酸
• 氨基酸的光学活性和光谱性质
  • 光学活性，立体化学
  • 光谱性质
    • 紫外吸收光谱
      • 酪氨酸，色氨酸，苯丙氨酸
    • 远紫光区
      • 小于220nm都有吸收
    • 核磁共振波谱NM高级与CT，流动影像
      • 肽和小蛋白质的三维结构
• 氨基酸混合物的分析分离
  • 色谱
    • 和颜色无关，色层分析
  • 常用的分配层析
    • 柱层析，纸层析，薄层层析
  • 分配柱层析
    • 定性，定量
      • 茚三酮显色定量
  • 薄层层析
  • 离子交换层析
    • 根据氨基酸的电荷不一样
      • 洗出顺序
    • 根据氨基酸的疏水性
  • 气液层析
    • n解释
    • 子主题
  • 高效液相层析
    • HPLC