导图社区 真核生物转录思维导图
真核生物中的转录发生在细胞核内,mRNA 从细胞核移出进入细胞质进行翻译。 RNA 聚合酶启动 RNA 合成是由转录起始位点 5' 侧的启动子位点的存在指导的。 RNA 聚合酶转录 DNA 模板的一条链,即反义 (-) 链。
动物细胞培养(animal cell culture)就是从动物机体中取出相关的组织,将它分散成单个细胞(使用胰蛋白酶或胶原蛋白酶)然后,放在适宜的培养基中,让这些细胞生长和增殖。细胞培养是指细胞在体外条件下的生长,动物细胞在单独细胞培养的过程中不再形成个体。
生物化学,糖类代谢知识点总结,糖酵解,三羧 酸循环,乙醛酸循环,磷酸戊糖途径,糖异生作用,乳酸循环。
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第14章DNA的生物合成读书笔记
第五章 RNA加工
概述
核酸内切酶和核酸外切酶去除核苷酸
内切酶在前体RNA的特定位点切割,外切酶在末端切割
这一过程在所有生物中都可以看到
在初级转录产物或其裂解产物的5‘端或3’端添加核苷酸
添加一个帽和poly尾
碱基或糖基上的修饰
在mRNA和rRNA的2‘-OH上添加一个甲基,
tRNA中普遍甲基化
RNPs
核糖核蛋白
rRNA加工
在原核生物中(RNA聚合酶Ⅲ)
有一小段tRNA
生成16、23、5 srRNA
在真核生物中
snoRNPs甲基化、假尿嘧啶的形成和其他修饰
2’-OH甲基化信号保持成熟,Pre-rRNA的初始裂解,然后进一步裂解和输出
tRNA加工
原核生物中
主要产物经RNase D,E,F,P,转变成末端成熟的tRNA,再经基础的修改变成成熟tRNA
真核生物中
初级转录产物形成内切酶识别的二级结构
RNase P 剪切5‘前导和RNase D 剪切3’额外的核苷酸
tRNA核苷酸转移酶将5‘-CCA-3’添加到3‘端,生成成熟的3’端
基因内区删除
RNase P
存在与原核和真核生物中,是小的RNPs(snRNPs),具有催化作用
mRNA加工
在原核生物中基本没有,原核生物一般共转录翻译
在真核生物中,mRNA是由RNA PolⅡ作为较长的前体中,不同群体的RNA PolⅡ转录本被称为核异质RNA,Pre-mRNA分子通过5‘-capping-3’裂解和聚腺苷酸化,剪接和甲基化被加工成成熟的mRNA。
mRNA剪切
hnRNP:hnRNA+proteins
被RNA聚合酶Ⅱ合成,有助于使hnRNA保持单链形式,并协助各种RNA加工反应
RNA剪接过程 PPT P33
遵循GU-AG法则
snRNP(小核RNA):snRNA+proteins
snRNA富含尿嘧啶基,与特定蛋白形成snRNPs
最丰富的snRNP参与了Pre-mRNA剪接,U1,U2,U4,U5,U6
大量snRNP定义了Pre-rRNA甲基化位点,由Pol Ⅱ合成
它们5‘获得两个甲基,进入细胞核发挥剪接作用
三种剪接形式
细胞核 pre-mRNA
两步转酯反应
Ⅱ类自剪接内含子
Ⅰ类自剪接内含子
使用游离G核苷酸
内部引导序列
剪接体如何可靠的找到剪接位点
原核生物
为了避免外显子跳跃,剪接体成分协同转录加载到剪接位点上
为了避免伪剪接位点选择SR(富含丝氨酸和精氨酸)蛋白将剪接体成分招募到5’和3‘端剪接位点,外显子剪接增强子
真核生物可变位剪接
单个基因可通过选择性剪接产生多种产物。通过选择性剪接单个基因可产生多种蛋白质,这些不同的蛋白质被称为异构体,他们可以相似的功能、不同的功能甚至对立的功能
有几种机制可以确保相互排除的拼接
空间位阻
主要和次要剪接位点的组合
如果剪接了两个就有两个终止信号
果蝇基因(Dscam)P206的奇妙案例:大规模的互斥剪接
可变剪接受激活子和阻遏子的调控P46
外显子重排
外显子通过重组产生编码新蛋白的基因
外什么内含子存在于除细菌外的所有生物中?内含子早期模型:由于选择压力二加速染色体复制和细胞分裂。晚期模型:由于转座子机制。
外什么内含子在真核生物中被保留:外显子重排的优点
外显子重排的证据
外显子与内含子边界通常与域之间边界重合
一些蛋白(免疫球蛋白)有重复单位,这可能由于基因复制
相关外显子有时存在于不相关的基因中
RNA编辑课本P107
特定场地脱氨基作用
指导 RNA引导鸟苷酸插入或删除(通常在锥虫和线粒体中
来自内外信号相互作用
mRNA加帽
前体mRNA通常首先被鸟苷基封顶,这是对mRNA的5‘三磷酸基的修饰,该反应由磷酸水解酶、鸟苷基转移酶和甲基转移酶催化
第一步:RNA三磷酸酶除去前体mRNA的末端磷酸,然后鸟苷基转移酶从GTP中加盖GMP,形成5’和5‘的磷酸
第二步:2个甲基转移酶将冠鸟苷的N7和倒数第二个核苷酸的2’甲基化
N6甲基化
调控外显子的剪接
3‘端的加工
核输出
翻译有促进作用
降解
为什么只有mRNA加帽
CAP结构只有RNAP Ⅱ加工
加帽酶结合到CTD(被聚合酶 Ⅱ编码)
他们只与CTD的伸长形式结合(即磷酸化的CTD)
加帽的功能
防止mRNA降解
增强其翻译性
运输(运出核)
mRNA剪接的效率提高
mRNA加尾
将聚(A)加入RNA的过程称为据腺苷酸化
AMP残基的长链称为poiy(A)尾
大多数真核mRNA及其前体在其3’端有一个大约250nt长的AMP残基
poly(A)在转录后由一种称为poly(A)聚合酶的酶添加
poly(A)不是转录的产物,因为它不在DNA中编码
mRNA降解