一级结构是蛋白质的重要结构。蛋白质一级结构相同，生物功能就相同；但生物功能相同，一级结构并非完全相同。一类蛋白质中往往只要具备了一定的“同源序列”，表现出一定的结构相似性，就能执行同样的生物功能。
一级结构相似的蛋白质，功能相似（如血红蛋白→运输氧）
存在于不同生物中的一组序列和功能想死的蛋白质互称同源蛋白。同源蛋白之间在进化上有亲缘关系。序列相似性越高，进化关系越近；反之，进化关系越远。
如人和猪的血红蛋白功能是：运输氧，但实际是序列不同但相似
在同源蛋白中，有些位点的氨基酸残基在进化上比较保守（不变），称为不变残基或保守残基，它们对蛋白质特定结构和功能非常重要，如果发生突变，蛋白质极易丧失正常功能；有些位点的氨基酸残基可以发生改变，称为可变残基
通过比较同源蛋白质的氨基酸序列的差异可以研究不同物种间的亲缘关系和进化。来自两个物种间的同源蛋白质，其序列间的氨基酸差异数目与物种系统发生差异成正比。亲缘关系越远，同源蛋白的氨基酸顺序差异就越大
在可变残基中，有些只能在同类氨基酸之间发生保守性替代，如Glu→Asp，Leu→Ile等。可变残基对蛋白质的结构和功能没有特殊影响，一般只在物种进化中起作用，与免疫性有关。
在物种进化中起作用：决定物种特异性（如血红蛋白，在人体中可能是Glu，在猪当中可能是Asp，瞎掰举例，仅供参考）
