由于碳碳单键的旋转或扭曲而引起的分子中原子或基团在空间的不同排列形式称为构象
这种因单键的旋转或扭曲而产生的异构体称为构象异构体。由于旋转所需能量较小，一般低于5Kcal/mol,理论上一个分子可以有无数构象式同时存在，但由于分子中较大基团（或原子）的立体障碍，一些构象需要克服的立体能垒大而存在的可能性较小，而以分子势能最低的构象存在的可能性大
因为相互作用能量的影响，药物和受体结合时，药物本身不一定采取优势构象
这是由于药物分子与受体间作用力的影响，使药物与受体相互适应达到互补，即分子识别过程的构象重组。因此把药物与受体作用时所采取的实际构象为药效构象
药效构象不一定是药物的优势构象，药物与受体间作用力可补偿由优势构象转为药效构象时分子内能的增加所需的能量，即维持药效构象所需的能量
药物分子的基本结构不同，但可能会以相同的作用机制引起相同的药理和毒理效应，这是由于它们具有共同的药效构象，即构象等效性，从而以相同的作用方式与受体部位相互作用
构象等效性不仅存在于同系化合物或（和）同型化合物，而且在结构差异很大或化学类型不同的化合物之间，也可能有相同的药效构象
