导图社区 分子生物学 原核真核转录
分子生物学 原核真核转录。真核原核启动子；RNA聚合酶；等
细胞增殖与凋亡检测的技术和原理，详细的总结了增殖，凋亡的内容。希望对各位小伙伴有所帮助哦！
这是一篇关于膜蛋白及其分类的思维导图，主要内容有外周/外在膜蛋白、内在/整合膜蛋白、脂描定蛋白。
下图内容包括：基因工程基因表达机制及调控元件，略偏于分子生物学知识；微生物基因工程内容，影响基因表达的因素、工程菌的不稳定性，蛋白质稳定策略...
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第14章DNA的生物合成读书笔记
转录
化学过程
周期
起始
延伸
终止
三步
形成闭合复合物
形成开口复合物
启动子逃脱
RNA聚合酶
细菌
只有一种：核心酶（核心酶+σ->全酶）
结构特征
两个亚基——蟹钳结构
DNA从其间进入
催化分叉
链分离
校正功能
焦磷酸键解：错误核酸+ppi->去除一个错误插入的
水解
向后追踪几个并移除
真核
Pol I\III
部分rRNA、tRNA之类的
Pol II：负责所有编码蛋白质的基因的转录
真核RNA聚合酶II核心启动子
启动子结构
BRE：TFIIB识别元件
TATA元件
Inr
DPE：下游启动子元件
调控序列
增强
启动子近端元素
上游激活序列
增强子
抑制
沉默子
边界元件
绝缘体
起始过程
①TFIID中TBP结合到TATA box
②TFIIA、B被招募且B结合到BRE
③RNA Pol II-TFIIF复合物被招募
④TFIIE、H结合到Pol II上游，形成前起始复合物
⑤TFIIH水解ATP的能量->启动子融化
ATPase+蛋白激酶活性
⑥启动子逃脱
注意作用
去除大部分起始因子（GTF和中介复合物），招募其他因子
延长因子：刺激延长
RNA加工因子
5'加帽（甲基化G）
防止降解；提高转录效率；转移至细胞质；第一个内含子剪切
3'poly A 尾
提高稳定性；转录效率；最后一个内含子剪切
内含子剪接
真核RNA转录-加工相偶联
RNA编辑
改变转录完成后的mRNA序列
位点特异性脱氨基：C->U改变碱基
Guide RNA（gRNA）指导特定区域U的插入、缺失
E.coli的σ70启动子
结构
+1：翻译起始
两个保守序列：-10，-35（共有序列），接近这些的启动子统常更强（一定时间转录起始量）
上游元件：可提供RNA Pol更多相互作用位点，提高其结合
extended -10：存于无-35的启动子上，补偿缺失
σ70因子
αCTD识别上游元件
区域4：识别-35
螺旋转角螺旋
区域2：识别-10
区域3：识别extended -10
σ3.2：在RNA出口通道中间
转变为开口复合物
DNA融化：-11-+3
聚合酶结构改变
另外
起始需要起始NTP（常为A）置入活性位点
流产式起始：需要将σ3.2区域逐出RNA出口通道，酶要多次尝试
DNA进入蟹钳；分叉链分离；NTP加入；后方DNA退火
不依赖Rho的（强）
①短的反向重复序列形成发卡结构
②一段富含U的序列
使释放
Rho依赖性（弱）
Rho有ATPase和解旋酶活性
与RNA产物结合，使Pol、Rho蛋白构象改变，易脱离
RNA剪接
序列决定剪接位置
5'剪接位点；3'剪接位点；分枝位点
过程
Group I: 外来G进攻5'位点，连接到内含子上，5’外显子再进攻3'外显子
形成直线内含子
Group II: 分支位点A进攻5'位点，后同上
形成套索结构内含子
两种识别错误
剪接位点跳跃
外显子减少
伪拼接位点
不是剪接位点却将其认为是
提高位点选择准确性
共转录装载——利用Pol II C尾端蛋白，防止跳跃
SR蛋白与外显子剪接增强子结合：将剪接机器招募至附近剪接位点
mRNA转运
成熟mRNA携带蛋白质集合，标志其准备好转运
GTFs（通用转录因子）
TFIID
TBP(TATA box 结合蛋白）
TAFs（TBP相关因子）
TFIIA,B,F,E,H
