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生物化学蛋白质思维导图知识点整理
编辑于2020-11-01 16:50:50蛋白质
概述
蛋白质是由多种α-氨基酸按一定的序列通过肽键(酰胺键)缩合而成的具有一定功能的生物大分子
分类
元素组成
碳50%~55%、氢6%~8%、氧19%~24%、氮13%~19%、硫0%~4%。
有的蛋白质还有微量的磷、铁、铜、碘、锌和钼等元素。
含氮量平均为16%
分子形状
球状蛋白
纤维状蛋白
膜蛋白
化学组成
简单蛋白
清蛋白
球蛋白
醇溶蛋白
谷蛋白
精蛋白
组蛋白
硬蛋白
结合蛋白
核蛋白
糖蛋白和蛋白聚糖
脂蛋白
色蛋白
磷蛋白
功能
酶
调节蛋白
贮存蛋白
转运蛋白
运动蛋白
防御蛋白和毒蛋白
受体蛋白
支架蛋白
结构蛋白
异常功能
基本组成单位——氨基酸
氨基酸的一般结构式
所有来自蛋白质的氨基酸均为L-α-氨基酸
氨基酸的分类
按R基极性分类
非极性R基氨基酸
丙氨酸,Ala,a
缬氨酸,Val,V
亮氨酸,Leu,L
异亮氨酸,Ile,I
苯丙氨酸,Phe,F
甲硫氨酸,Met,M
脯氨酸,Pro,P
色氨酸,Trp,W
极性不带电荷的R基氨基酸
甘氨酸,Gly,G
丝氨酸,Ser,S
苏氨酸,Thr,T
天冬酰胺,Asn,N
谷氨酰胺,Gln,Q
酪氨酸,Tyr,Y
半胱氨酸,Cys,C
极性带负电荷的R基氨基酸
天冬氨酸,Asp,D
谷氨酸,Glu,E
极性带正电荷的R基氨基酸
组氨酸,His,H
赖氨酸,Lys,K
精氨酸,Arg,R
按R基的化学结构分类
脂肪族氨基酸
芳香族氨基酸
苯丙氨酸,Phe,F
酪氨酸,Tyr,Y
色氨酸,Trp,W
杂环氨基酸
组氨酸,His,H
杂环亚氨基酸
脯氨酸,Pro,P
按酸碱性分类
碱性氨基酸
赖氨酸,Lys,K
精氨酸,Arg,R
组氨酸,His,H
中性氨基酸
酸性氨基酸
谷氨酸,Glu,E
天冬氨酸,Asp,D
从营养角度可分为
必需氨基酸(8种)
异亮氨酸(Ile)、亮氨酸(Leu)、色氨酸(Trp)、苏氨酸(Thr)、苯丙氨酸(Phe) 、赖氨酸(Lys) 、蛋氨酸(Met)、缬氨酸(Val)
非必需氨基酸
氨基酸的理化性质
两性解离及等电点
等电点
氨基酸所带净电荷为零,在电场中,不向任何一极移动,此时溶液的pH值称为氨基酸的等电点
中性氨基酸的等电点一般在:5.0~6.3,酸性氨基酸的等电点一般在:2.8~3.2,碱性氨基酸的等电点一般在:7.6~10.9。
等电点的计算
氨基酸的化学性质
与水合茚三酮反应
α-氨基酸与茚三酮反应产生蓝紫色化合物,脯氨酸(Pro)和羟脯氨酸与茚三酮反应产生黄色物质
与甲醛反应
与2,4-二硝基氟苯(DNFB)反应——Sanger反应
与异硫氰酸苯酯(PITC)反应——Edman反应
与亚硝酸反应
与荧光胺反应
与5,5-双硫基-双(2-硝基苯甲酸)反应
芳香族氨基酸的紫外吸收性质
280nm波长
色氨酸与乙醛酸反应
半胱氨酸的巯基反应
氨基酸分析分离
1.纸层析2.薄层层析3.分配柱层析4.离子交换柱层析5.高效液相色谱6.氨基酸自动分析仪
蛋白质的分离纯化
蛋白质变性
某些物理或化学因素,能够破坏蛋白质的结构状态,引起蛋白质生物活性丧失,这种现象称为蛋白质的变性。
蛋白质沉淀
等电点沉淀法
盐析法
加有机溶剂
加重金属盐
加酸
加热
蛋白质的显色反应
双缩脲反应Folin-酚试剂黄色反应醋酸铅反应
蛋白质定量分析
凯氏定氮法双缩脲法Folin-酚试剂法考马斯亮蓝染色法紫外分光光度法
蛋白质的大小测定
SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳法凝胶过滤法沉降速度法
蛋白质的分离
根据溶解度不同
等电点沉淀法盐析法低温有机溶剂沉淀法
根据分子大小
透析和超滤凝胶过滤法
根据带电性质
电泳法离子交换层析法
根据配体特异性
亲和层析法
蛋白质分子中氨基酸序列确定
多肽链的分离二硫键的断裂氨基酸组成的分析N端残基的鉴定C端残基的鉴定
多肽链的裂解
1.胰蛋白酶2.糜蛋白酶(胰凝乳蛋白酶)3.梭菌蛋白酶4.葡萄球菌蛋白酶5.溴化氢6.羟胺
肽段氨基酸序列的测定
1.Edman法2.质谱法测序3.根据核苷酸序列推断法
肽段的拼接
二硫桥位置的确定
对角线电泳法
蛋白质的性质
两性解离与等电点
蛋白质的胶体性质
丁达尔现象布郎运动不能透过半透膜电泳现象
维系胶体溶液稳定性的因素
水化层
带电层
紫外吸光性
蛋白质的结构与功能的关系
蛋白质一级结构与功能的关系
实证之一
核糖核酸酶的自发折叠
蛋白质一级结构决定高级结构,高级结构决定蛋白质功能
蛋白质一级结构改变可引起疾病
镰刀型贫血病
一级结构相似的蛋白质具有相似的高级结构与功能。
同源蛋白
指在不同有机体中实现同一功能的蛋白质。
不变残基可变残基
氨基酸序列提供重要的生物进化信息。
蛋白质高级结构与功能的关系
协同效应
血红蛋白分子中亚基间的别构效应存在促进关系,即寡聚蛋白质的一个亚基与其配体结合后,能促进此寡聚体中另一个亚基与配体结合能力的现象,称为协同效应。
别构效应
在生物体内,当某种物质可特异地与蛋白质分子的某一部位结合,触发该蛋白质的构象发生一定变化,从而导致其功能活性的变化,这种现象称别构效应。
蛋白质的结构
蛋白质的一级结构
指蛋白质多肽链中氨基酸的排列顺序,氨基酸序列的多样性决定了蛋白质空间结构和功能的多样性
维系蛋白质分子一级结构的化学键:肽键、二硫键
蛋白质的一级结构包括:(1)组成蛋白质的多肽链数目。(2)多肽链的氨基酸顺序。(3)多肽链内或链间二硫键的数目和位置。
蛋白质的二级结构
蛋白质的二级结构是指多肽链本身的折叠和盘绕方式。
α-螺旋、β-折叠、β-转角、β-凸起、无规则卷曲、超二级结构和结构域
维系蛋白质分子二级结构的化学键:氢键
蛋白质的三级结构
指多肽链上包括主链和侧链在内的所有原子在三维空间的分布
维系三级结构主要作用力:疏水作用力,还有氢键、范德华力、离子键
蛋白质的四级结构
四级结构中的每个独立三级结构单元称为亚基,亚基间通过非共价键聚合而形成特定的构象。蛋白质的四级结构指分子中亚基的种类、数量以及相互关系。
维系蛋白质分子的四级结构:疏水相互作用力、氢键、范德华力、离子键
肽
定义
若干氨基酸之间以肽键相连接所形成的长链称为肽。
肽键
一分子氨基酸的α-氨基与另一氨基酸的α-羧基之间脱水形成的酰胺键(-NH-CO-)称为肽键。
肽平面
肽键中的四个原子和它相邻的两个Cα处于同一平面,形成了酰胺平面,也称肽平面。
生物活性肽
1.谷胱甘肽2.神经激素3.促肾上腺皮质激素4.脑肽5.胰岛素和胰高血糖素6.肠胃道活性肽7.神经生长因子和表皮生长因子